More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0841 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 247 aa  503  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  72.69 
 
 		 254 aa  343  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  55.61 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  58.74 
 
 		 255 aa  250  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  58.22 
 
 		 239 aa  248  6e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  55.71 
 
 		 262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  55.25 
 
 		 236 aa  231  9e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  52.99 
 
 		 262 aa  231  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  51.38 
 
 		 252 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  51.57 
 
 		 228 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5236  transcriptional regulator, GntR family  50.46 
 
 		 252 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2747  transcriptional regulator, GntR family  52.05 
 
 		 233 aa  215  5e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.756614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2564  transcriptional regulator GntR  50.68 
 
 		 246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  48.91 
 
 		 228 aa  211  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  48.09 
 
 		 266 aa  211  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3836  GntR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 312 aa  199  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155558  normal  0.0735717 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  44.8 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 238 aa  133  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  39.32 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5712  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16960  transcriptional regulator, GntR family  34.91 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.916885 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6449  transcriptional regulator, GntR family  38.01 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  normal  0.091376 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 237 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 254 aa  99  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0705  transcriptional regulator, GntR family  32.89 
 
 		 243 aa  96.3  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 227 aa  95.9  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 220 aa  95.5  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 233 aa  95.1  8e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 202 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 216 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 239 aa  92  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  34.65 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 255 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 237 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0649  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.875188  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3893  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 243 aa  86.3  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.000000224678  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 221 aa  86.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 216 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 219 aa  86.3  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 265 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4146  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 243 aa  86.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.10084  normal  0.977946 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 233 aa  85.1  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 222 aa  85.1  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3215  GntR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0184388 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5826  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644703 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  32.69 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0106  transcriptional regulator, GntR family  33.48 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0518218  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  36.18 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  30.04 
 
 		 274 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1443  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 234 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1235  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  30.14 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  30.43 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  24.75 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  29.21 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00895  transcription regulator protein  35 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0473063  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  24.75 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1138  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128923 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  26.81 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  28.05 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6785  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  28.77 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3216  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0185552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  29.81 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>