More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0799 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0799  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
310 aa  600  1e-170  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4029  carbohydrate kinase, PfkB  52.92 
 
 
299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4413  PfkB family kinase  45.17 
 
 
298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4348  kinase, PfkB family  45.17 
 
 
298 aa  215  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4302  kinase PfkB family  45.17 
 
 
298 aa  215  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4235  kinase, PfkB family  45.17 
 
 
298 aa  215  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  0.927219 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  45.17 
 
 
298 aa  215  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4268  PfkB family kinase  44.64 
 
 
298 aa  208  9e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03768  predicted sugar kinase  44.29 
 
 
298 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4103  PfkB domain protein  44.29 
 
 
298 aa  207  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4406  PfkB family kinase  44.29 
 
 
298 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03717  hypothetical protein  44.29 
 
 
298 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5330  kinase, PfkB family  43.94 
 
 
298 aa  205  6e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.574224 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4349  kinase, PfkB family  42.41 
 
 
298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4140  ribokinase-like domain-containing protein  42.41 
 
 
298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.682006  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4103  PfkB family kinase  42.41 
 
 
298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5201  PfkB domain protein  40.26 
 
 
326 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0358  ribokinase-like domain-containing protein  37.95 
 
 
306 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5471  PfkB domain protein  39 
 
 
324 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.784292 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1019  PfkB domain protein  40 
 
 
284 aa  140  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.485278 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0090  PfkB  37.01 
 
 
309 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0616  PfkB domain protein  36.36 
 
 
312 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0460  PfkB  35.29 
 
 
308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.413409  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0671  PfkB  36.45 
 
 
309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4851  PfkB  36.49 
 
 
309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  32.57 
 
 
306 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2838  putative sugar kinase  32.54 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1805  PfkB  32.13 
 
 
318 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3654  PfkB  31.48 
 
 
300 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4302  PfkB domain protein  31.48 
 
 
297 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2812  PfkB  33.11 
 
 
321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  34.6 
 
 
298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1546  PfkB domain protein  28.27 
 
 
285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418317 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1648  PfkB  32.42 
 
 
297 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46421  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2455  PfkB domain-containing protein  39.57 
 
 
282 aa  109  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.287722  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  33.21 
 
 
304 aa  107  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  24.03 
 
 
306 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  34.19 
 
 
304 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  36.21 
 
 
314 aa  106  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  30.39 
 
 
305 aa  102  6e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1940  PfkB  26.76 
 
 
294 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123547  normal  0.0238447 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1913  PfkB domain-containing protein  25.61 
 
 
288 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  28.43 
 
 
304 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  33.33 
 
 
295 aa  99.8  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  33.45 
 
 
315 aa  99  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  30.62 
 
 
302 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  30.23 
 
 
318 aa  98.6  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0980  ribokinase-like domain-containing protein  33.57 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.167032 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1986  PfkB  27.15 
 
 
286 aa  96.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.842187 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  32.09 
 
 
308 aa  96.3  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  31 
 
 
304 aa  96.3  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  28.52 
 
 
307 aa  96.3  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  30.74 
 
 
306 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  25.24 
 
 
308 aa  95.5  1e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  27.51 
 
 
310 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  24.67 
 
 
309 aa  94.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  27.4 
 
 
305 aa  93.6  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  29.04 
 
 
307 aa  93.6  4e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  28.34 
 
 
301 aa  92.8  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  25.89 
 
 
306 aa  92.4  9e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  33.33 
 
 
308 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  32.21 
 
 
314 aa  90.5  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  33.55 
 
 
308 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  26.54 
 
 
310 aa  90.1  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  31.02 
 
 
309 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  31.77 
 
 
315 aa  89.7  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  31.77 
 
 
315 aa  89.7  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4060  ribokinase-like domain-containing protein  29.58 
 
 
314 aa  89.4  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288269  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1363  ribokinase-like domain-containing protein  31.63 
 
 
303 aa  89.4  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0022  PfkB domain protein  27.43 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  33.55 
 
 
309 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  28.76 
 
 
302 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  23.75 
 
 
340 aa  88.2  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0924  ribokinase-like domain-containing protein  25.17 
 
 
305 aa  87.8  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.108155  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
300 aa  87.8  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  33.83 
 
 
310 aa  87  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0020  PfkB domain protein  27.08 
 
 
291 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7448  cyclic nucleotide-binding protein  32.79 
 
 
314 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  28.86 
 
 
315 aa  87  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6387  ribokinase  30.62 
 
 
309 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906333  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  27.45 
 
 
307 aa  86.7  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  30.85 
 
 
309 aa  85.9  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  26.2 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1475  ribokinase-like domain-containing protein  31.21 
 
 
305 aa  85.5  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  32.88 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  29.03 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  27.19 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  26.71 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2097  PfkB domain protein  35.96 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0568706  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  28.52 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  24.48 
 
 
345 aa  84  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  29.41 
 
 
302 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2306  PfkB family kinase  26.88 
 
 
319 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  24.75 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  25.32 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  25.32 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  25.32 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  24.75 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  29.68 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  27.13 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.933367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>