More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0795 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 232 aa  473  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 233 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 233 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 233 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  46.7 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 243 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  37.33 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 222 aa  142  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4063  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 243 aa  132  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.299746  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 225 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  41.09 
 
 		 223 aa  122  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  36.67 
 
 		 266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  36.87 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 255 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  36.2 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 229 aa  112  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 239 aa  112  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  36.54 
 
 		 237 aa  108  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 260 aa  105  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  37.93 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  35.94 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00895  transcription regulator protein  36.55 
 
 		 205 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0473063  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 		 233 aa  99.8  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6449  transcriptional regulator, GntR family  36.23 
 
 		 236 aa  98.2  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  normal  0.091376 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  28.78 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 235 aa  98.2  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  33.5 
 
 		 228 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  30.91 
 
 		 231 aa  95.9  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0489  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 238 aa  95.9  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2140  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 238 aa  95.9  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0432435  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  32.98 
 
 		 239 aa  95.1  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 236 aa  95.1  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 214 aa  94.7  9e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 219 aa  94.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 232 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2413  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224265  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 219 aa  92.4  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 224 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 226 aa  92  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 250 aa  92  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 249 aa  91.7  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  32.66 
 
 		 219 aa  92  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 219 aa  92  8e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  32.87 
 
 		 240 aa  92  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5236  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 252 aa  91.7  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  32.49 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2564  transcriptional regulator GntR  31.75 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  31.84 
 
 		 240 aa  90.1  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 228 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 234 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5600  transcriptional regulator, GntR family  34.69 
 
 		 228 aa  90.1  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 262 aa  89.4  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 214 aa  89.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3450  transcriptional regulator, GntR family  28.36 
 
 		 231 aa  89.4  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101357  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  32.38 
 
 		 232 aa  89  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3236  GntR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 250 aa  89  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 255 aa  89  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3906  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 244 aa  89.4  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 238 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0185  transcriptional regulator, GntR family  34.18 
 
 		 222 aa  89.4  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.27943  normal  0.15963 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1174  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 241 aa  89  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 221 aa  89  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 238 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 227 aa  89  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 238 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4046  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 235 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  34.29 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  32.85 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 229 aa  88.2  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  27.84 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3577  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000218035  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 264 aa  86.7  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1377  transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 		 225 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  32 
 
 		 239 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>