More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0750 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
535 aa  1103    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0748  extracellular solute-binding protein  92.52 
 
 
535 aa  987    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  89.78 
 
 
534 aa  964    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4254  extracellular solute-binding protein  52.26 
 
 
527 aa  595  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340537  normal  0.123719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  49.01 
 
 
516 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  47.67 
 
 
515 aa  501  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  48.8 
 
 
516 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3221  extracellular solute-binding protein  49.12 
 
 
517 aa  489  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102229  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  47.06 
 
 
522 aa  482  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  45.98 
 
 
522 aa  483  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  47.17 
 
 
534 aa  481  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  44.65 
 
 
529 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  44.35 
 
 
529 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  44.15 
 
 
529 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1614  putative solute-binding transport protein (periplasmic)  67.14 
 
 
289 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147333  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  38.01 
 
 
536 aa  391  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  40.94 
 
 
544 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1611  extracellular solute-binding protein  73.33 
 
 
259 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  39.17 
 
 
544 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  38.12 
 
 
524 aa  354  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2569  ABC transporter substrate-binding protein  36.45 
 
 
558 aa  348  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  36.41 
 
 
542 aa  342  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  37.4 
 
 
532 aa  340  4e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  36.56 
 
 
534 aa  340  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.29 
 
 
534 aa  336  7e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  37.23 
 
 
534 aa  333  5e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  36.07 
 
 
520 aa  331  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  34.92 
 
 
528 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  36.17 
 
 
524 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.64 
 
 
539 aa  323  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  34.54 
 
 
544 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  33.93 
 
 
527 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4764  extracellular solute-binding protein  35.03 
 
 
539 aa  291  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  34.82 
 
 
495 aa  290  4e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0161  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.26 
 
 
529 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485134  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  32.89 
 
 
531 aa  285  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  31.71 
 
 
533 aa  280  7e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5671  extracellular solute-binding protein  33.27 
 
 
531 aa  279  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.880059  normal  0.0905991 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  34.62 
 
 
537 aa  278  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3968  extracellular solute-binding protein  34.11 
 
 
537 aa  273  6e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7214  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  32.59 
 
 
532 aa  272  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0132  extracellular solute-binding protein  31.64 
 
 
532 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4290  extracellular solute-binding protein  31.64 
 
 
530 aa  271  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00787986  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  31.45 
 
 
530 aa  270  4e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2913  extracellular solute-binding protein family 5  30.8 
 
 
533 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.037834  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4877  putative ABC transporter, substrate binding protein  30.28 
 
 
560 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6559  extracellular solute-binding protein family 5  31.74 
 
 
536 aa  261  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67626  normal  0.403463 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.02 
 
 
531 aa  259  8e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2014  twin-arginine translocation pathway signal  32.03 
 
 
534 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.533924  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  32.23 
 
 
531 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2972  extracellular solute-binding protein  30.48 
 
 
535 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.439804  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6144  extracellular solute-binding protein family 5  31.28 
 
 
533 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.5133  hitchhiker  0.00348679 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3320  extracellular solute-binding protein  30.54 
 
 
528 aa  226  8e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0123121  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4327  putative ABC transporter, extracellular substrate binding protein  29.33 
 
 
538 aa  225  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3082  twin-arginine translocation pathway signal  30.71 
 
 
535 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.49552  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2918  extracellular solute-binding protein family 5  29.2 
 
 
538 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258086  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1152  extracellular solute-binding protein  28.6 
 
 
538 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1041  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 
538 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  31.64 
 
 
502 aa  208  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 
538 aa  206  8e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  28.31 
 
 
546 aa  205  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  28.41 
 
 
534 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  28.25 
 
 
533 aa  201  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.42 
 
 
538 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  29.22 
 
 
541 aa  193  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.53 
 
 
511 aa  193  8e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 
551 aa  189  7e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  30.74 
 
 
520 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 
540 aa  186  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  30.21 
 
 
526 aa  183  6e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  26.89 
 
 
540 aa  182  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 
539 aa  179  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 
565 aa  178  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  27.68 
 
 
576 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 
521 aa  176  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 
493 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  30.31 
 
 
508 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 
559 aa  173  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.37 
 
 
532 aa  172  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  28.43 
 
 
509 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0365  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.58 
 
 
521 aa  171  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  27.29 
 
 
544 aa  170  5e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  28.78 
 
 
524 aa  169  8e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  28.76 
 
 
526 aa  169  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 
522 aa  169  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0181  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  30.25 
 
 
547 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2914  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 
543 aa  167  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.85 
 
 
535 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 
495 aa  167  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.99 
 
 
534 aa  167  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3755  extracellular solute-binding protein family 5  30.7 
 
 
547 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 
520 aa  166  8e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  28.16 
 
 
544 aa  166  9e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  30.15 
 
 
509 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  26.85 
 
 
520 aa  164  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.92 
 
 
529 aa  163  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  28.86 
 
 
522 aa  163  6e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  26.7 
 
 
502 aa  163  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  27.17 
 
 
563 aa  163  9e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 
519 aa  162  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>