More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0688 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  100 
 
 		 578 aa  1150    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  80.84 
 
 		 578 aa  888    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  72.47 
 
 		 575 aa  792    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  52.28 
 
 		 580 aa  535  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  52.15 
 
 		 585 aa  535  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02675  general secretory pathway protein E  50.63 
 
 		 575 aa  499  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0769  general secretory pathway protein E  51.97 
 
 		 566 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0856  general secretory pathway protein E  51.97 
 
 		 566 aa  492  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.67783  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0546  general secretory pathway protein E  51.69 
 
 		 573 aa  494  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0871321 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  47.68 
 
 		 559 aa  487  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  44.86 
 
 		 558 aa  479  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  47.11 
 
 		 553 aa  477  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  48.31 
 
 		 567 aa  478  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2183  general secretory pathway protein E  49.73 
 
 		 563 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  46.69 
 
 		 599 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  46.69 
 
 		 599 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  46.07 
 
 		 603 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  46.86 
 
 		 599 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3317  general secretion pathway protein E  50.99 
 
 		 585 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3151  type II secretion system protein E  49.57 
 
 		 585 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421515  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  45.75 
 
 		 553 aa  461  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  44.42 
 
 		 885 aa  459  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  44.02 
 
 		 553 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.09 
 
 		 563 aa  449  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  42.24 
 
 		 555 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  42.33 
 
 		 571 aa  449  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.34 
 
 		 568 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  44.17 
 
 		 568 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.34 
 
 		 568 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  41.45 
 
 		 871 aa  444  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  45.47 
 
 		 566 aa  444  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  43.65 
 
 		 553 aa  445  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.31 
 
 		 568 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.13 
 
 		 568 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.73 
 
 		 568 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16170  type II secretion system protein E, GspE  46.36 
 
 		 569 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  46.68 
 
 		 520 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  43.38 
 
 		 558 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  42.65 
 
 		 888 aa  439  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.03 
 
 		 571 aa  441  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  43.33 
 
 		 561 aa  436  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  41.03 
 
 		 568 aa  436  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  43.41 
 
 		 570 aa  436  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  40 
 
 		 566 aa  437  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  41.21 
 
 		 561 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  42.81 
 
 		 577 aa  438  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  43.47 
 
 		 557 aa  436  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29490  putative type II secretion protein  45.39 
 
 		 575 aa  438  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.13 
 
 		 568 aa  432  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  43.62 
 
 		 564 aa  433  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  40.78 
 
 		 568 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  38.81 
 
 		 562 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  50.9 
 
 		 514 aa  432  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  57.18 
 
 		 469 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.35 
 
 		 568 aa  432  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  42.48 
 
 		 571 aa  430  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  41.32 
 
 		 554 aa  429  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  42.81 
 
 		 610 aa  431  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  56.58 
 
 		 469 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  43.92 
 
 		 559 aa  428  1e-118  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  42.38 
 
 		 561 aa  427  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  44.09 
 
 		 573 aa  428  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  47.41 
 
 		 514 aa  427  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.07 
 
 		 568 aa  427  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  41.19 
 
 		 557 aa  425  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  40.18 
 
 		 558 aa  425  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  40.46 
 
 		 565 aa  422  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  39.75 
 
 		 564 aa  422  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  41.35 
 
 		 556 aa  424  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  47.64 
 
 		 521 aa  424  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4590  general secretion pathway protein E  52.48 
 
 		 509 aa  419  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  38.51 
 
 		 787 aa  421  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  52.71 
 
 		 498 aa  420  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1471  general secretory pathway protein E  54.78 
 
 		 498 aa  421  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  49.09 
 
 		 523 aa  421  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  50.11 
 
 		 521 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  50.11 
 
 		 521 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  43.53 
 
 		 563 aa  421  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  50 
 
 		 520 aa  419  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  53.71 
 
 		 521 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  49.66 
 
 		 521 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3174  type II secretion system protein E (GspE)  55.67 
 
 		 468 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277379  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  49.66 
 
 		 521 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  49.66 
 
 		 521 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  49.66 
 
 		 521 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2210  general secretory pathway protein E  55.03 
 
 		 477 aa  418  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  49.2 
 
 		 514 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  43.52 
 
 		 570 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  42.68 
 
 		 891 aa  416  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  51.07 
 
 		 523 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  38.35 
 
 		 563 aa  419  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  49.89 
 
 		 521 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  50.36 
 
 		 523 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  52.7 
 
 		 521 aa  414  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2530  general secretory pathway protein E  55.81 
 
 		 477 aa  413  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4250  general secretory pathway protein E  48.97 
 
 		 494 aa  414  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0196458 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  41.31 
 
 		 806 aa  413  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  40.5 
 
 		 563 aa  412  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0954  general secretory pathway protein E  52.45 
 
 		 503 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.120459  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3579  glycoside hydrolase family protein  52.59 
 
 		 503 aa  412  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.666057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>