18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0670 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0670  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  314  4e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217425  decreased coverage  8.00314e-05 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4392  hypothetical protein  62.12 
 
 
95 aa  74.7  4e-13  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4393  hypothetical protein  60 
 
 
95 aa  74.7  5e-13  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1376  hypothetical protein  30.19 
 
 
128 aa  60.8  7e-09  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1271  hypothetical protein  34.18 
 
 
120 aa  57.8  6e-08  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1828  hypothetical protein  48.98 
 
 
94 aa  53.1  2e-06  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0373  hypothetical protein  53.7 
 
 
102 aa  48.5  4e-05  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1208  hypothetical protein  29.19 
 
 
148 aa  48.1  5e-05  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544976  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0907  hypothetical protein  32.79 
 
 
87 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4530  hypothetical protein  25.32 
 
 
168 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.529986 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0766  hypothetical protein  39.66 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.704694  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1062  hypothetical protein  34.43 
 
 
87 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.197198  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0521  hypothetical protein  30.36 
 
 
179 aa  45.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1484  hypothetical protein  27.95 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1741  hypothetical protein  39.19 
 
 
101 aa  43.9  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1174  hypothetical protein  27.22 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0179647  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1581  hypothetical protein  23.97 
 
 
164 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  5.09629e-14  normal  0.19941 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0426  hypothetical protein  36.67 
 
 
101 aa  41.2  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>