45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0606 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0606  membrane lipoprotein lipid attachment site  100 
 
 		 205 aa  421  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.467937 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5474  putative lipoprotein  57.36 
 
 		 195 aa  218  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2514  putative lipoprotein  55.45 
 
 		 204 aa  215  4e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0633  membrane lipoprotein lipid attachment site  54.68 
 
 		 196 aa  206  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1313  membrane lipoprotein lipid attachment site  51.22 
 
 		 196 aa  191  9e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.565237  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2914  hypothetical protein  42.44 
 
 		 201 aa  155  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000421511  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3039  hypothetical protein  41.95 
 
 		 201 aa  155  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000888459  normal  0.414715 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0935  hypothetical protein  41.95 
 
 		 201 aa  155  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000406943  normal  0.0868767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0898  hypothetical protein  41.95 
 
 		 201 aa  155  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000138757  normal  0.418189 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3015  membrane lipoprotein lipid attachment site  41.95 
 
 		 201 aa  155  6e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1060  hypothetical protein  41.67 
 
 		 197 aa  153  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3243  hypothetical protein  42.57 
 
 		 201 aa  153  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126868  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3601  membrane lipoprotein lipid attachment site  42.29 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3478  membrane lipoprotein lipid attachment site  42.29 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0966746  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0884  membrane lipoprotein lipid attachment site  42.29 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000370182  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0637  hypothetical protein  42.44 
 
 		 201 aa  152  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0353203  normal  0.98697 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3403  membrane lipoprotein lipid attachment site  42 
 
 		 197 aa  151  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00726225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0824  membrane lipoprotein lipid attachment site  41.46 
 
 		 201 aa  151  8e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.525373  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1484  putative lipoprotein  41.24 
 
 		 196 aa  150  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.233925  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1298  putative lipoprotein  48.21 
 
 		 196 aa  149  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.41074  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0836  membrane lipoprotein lipid attachment site  39.71 
 
 		 197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0143317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0964  membrane lipoprotein lipid attachment site  41 
 
 		 197 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0219897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0914  hypothetical protein  39.51 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.310752  normal  0.0133601 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004000  putative lipoprotein  39.69 
 
 		 196 aa  142  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01522  hypothetical protein  39 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3947  membrane lipoprotein lipid attachment site  37.31 
 
 		 200 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191679  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0596  putative lipoprotein  38.97 
 
 		 200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2065  putative lipoprotein  37.72 
 
 		 196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.274451  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1812  membrane lipoprotein lipid attachment site  39.88 
 
 		 204 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1891  membrane lipoprotein lipid attachment site  38.32 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0189  hypothetical protein  30.96 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0713  hypothetical protein  27.37 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0063  hypothetical protein  29.13 
 
 		 210 aa  72  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1832  hypothetical protein  26.37 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0086  putative lipoprotein  28.36 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0126  putative lipoprotein  30.68 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2264  hypothetical protein  27.04 
 
 		 199 aa  62  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0680426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0084  hypothetical protein  31.17 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1310  hypothetical protein  24.38 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2333  hypothetical protein  28 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000127187  normal  0.606412 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3851  membrane lipoprotein lipid attachment site  23.68 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.160992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1490  hypothetical protein  26.39 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.687468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1191  membrane lipoprotein lipid attachment site  27 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00328821  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0180  conserved hypothetical lipoprotein  25.48 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1219  hypothetical protein  23.03 
 
 		 213 aa  41.2  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>