72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0580 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0580    100 
 
 
306 bp  607  9.999999999999999e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3586  hypothetical protein  98.41 
 
 
315 bp  117  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1330  hypothetical protein  96.97 
 
 
429 bp  115  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24136  hitchhiker  0.00281182 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0193  hypothetical protein  98.36 
 
 
366 bp  113  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.092331 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0363  hypothetical protein  98.36 
 
 
294 bp  113  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.587808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3276  hypothetical protein  98.36 
 
 
519 bp  113  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2997  hypothetical protein  95.65 
 
 
471 bp  113  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0932717  normal  0.548265 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  98.36 
 
 
1545 bp  113  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  98.36 
 
 
6603 bp  113  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4746  hypothetical protein  98.36 
 
 
522 bp  113  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  98.36 
 
 
1749 bp  113  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2000  hypothetical protein  98.36 
 
 
504 bp  113  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  96.83 
 
 
1011 bp  109  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4615  hypothetical protein  96.77 
 
 
339 bp  107  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0565209  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4441  hypothetical protein  96.77 
 
 
1158 bp  107  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2536  beta-ketoacyl synthase  96.77 
 
 
1569 bp  107  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1024  hypothetical protein  96.77 
 
 
519 bp  107  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4508  hypothetical protein  96.72 
 
 
288 bp  105  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.619373  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2316    96.72 
 
 
1061 bp  105  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000290431  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  96.72 
 
 
9828 bp  105  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2545  hypothetical protein  96.72 
 
 
1545 bp  105  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.239765  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4622  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  96.72 
 
 
834 bp  105  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3387    96.72 
 
 
309 bp  105  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0582875 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0375    98.25 
 
 
159 bp  105  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.851107  normal  0.316386 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4003  hypothetical protein  96.72 
 
 
303 bp  105  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.313951  normal  0.03113 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4257  hypothetical protein  96.72 
 
 
243 bp  105  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.751318 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1699  hypothetical protein  96.72 
 
 
318 bp  105  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1657    96.72 
 
 
755 bp  105  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.625202  normal  0.215657 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4318  hypothetical protein  96.72 
 
 
432 bp  105  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.385835  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4444  hypothetical protein  96.72 
 
 
282 bp  105  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.272849 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2342  hypothetical protein  96.61 
 
 
300 bp  101  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3061  hypothetical protein  95.16 
 
 
336 bp  99.6  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.341918  normal  0.0301074 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2103    96.55 
 
 
282 bp  99.6  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.531773  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4493  extracellular solute-binding protein  96.55 
 
 
1734 bp  99.6  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4204  hypothetical protein  95.08 
 
 
1185 bp  97.6  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.460472  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1283  transposase, IS4 family protein  95.08 
 
 
915 bp  97.6  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.337005  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3787  hypothetical protein  98 
 
 
408 bp  91.7  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.564529  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2836  hypothetical protein  93.55 
 
 
387 bp  91.7  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3511  hypothetical protein  98 
 
 
297 bp  91.7  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0325201  normal  0.146576 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0467  hypothetical protein  98 
 
 
399 bp  91.7  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2030  hypothetical protein  98 
 
 
330 bp  91.7  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1161  hypothetical protein  98 
 
 
288 bp  91.7  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4860  histidine biosynthesis  97.92 
 
 
690 bp  87.7  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.155368  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  97.92 
 
 
975 bp  87.7  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  93.22 
 
 
918 bp  85.7  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0425  hypothetical protein  96 
 
 
240 bp  83.8  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.439852  normal  0.238395 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1891  hypothetical protein  96 
 
 
240 bp  83.8  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.286259  normal  0.310639 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1997  hypothetical protein  96 
 
 
240 bp  83.8  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.570421 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3510  hypothetical protein  97.83 
 
 
291 bp  83.8  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0575334  normal  0.0752647 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3216  hypothetical protein  97.83 
 
 
684 bp  83.8  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0618648  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0763  hypothetical protein  96 
 
 
450 bp  83.8  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791123  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4768  hypothetical protein  96 
 
 
318 bp  83.8  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2056  hypothetical protein  96 
 
 
471 bp  83.8  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.766928  normal  0.232948 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1020  hypothetical protein  96 
 
 
267 bp  83.8  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1094  hypothetical protein  96 
 
 
294 bp  83.8  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0968333 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4212  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  97.73 
 
 
1434 bp  79.8  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0207401  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2214  hypothetical protein  97.67 
 
 
243 bp  77.8  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1525  hypothetical protein  97.67 
 
 
378 bp  77.8  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1527  hypothetical protein  97.67 
 
 
285 bp  77.8  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124431  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0341  hypothetical protein  97.67 
 
 
315 bp  77.8  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1790  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  97.67 
 
 
1692 bp  77.8  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3831  hypothetical protein  97.67 
 
 
315 bp  77.8  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.187243 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3629  hypothetical protein  97.67 
 
 
303 bp  77.8  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0092  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  97.67 
 
 
630 bp  77.8  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4769  fatty acid desaturase  95.65 
 
 
918 bp  75.8  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.237988  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4887  putative cAMP phosphodiesterase  95.65 
 
 
423 bp  75.8  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1701  hypothetical protein  95.65 
 
 
309 bp  75.8  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1122    90.16 
 
 
168 bp  73.8  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2733  NLP/P60 protein  93.48 
 
 
573 bp  67.9  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0192428  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2035  hypothetical protein  89.09 
 
 
579 bp  61.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
2922 bp  46.1  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1317  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
789 bp  46.1  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00242931  hitchhiker  0.00262131 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>