More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0547 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 456 aa  915    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  61.4 
 
 		 456 aa  585  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  54.19 
 
 		 470 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  54.39 
 
 		 468 aa  484  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  49.89 
 
 		 465 aa  398  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 447 aa  313  2.9999999999999996e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  34.2 
 
 		 451 aa  273  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  34.95 
 
 		 455 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 438 aa  266  4e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  34.59 
 
 		 457 aa  262  8e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  36.6 
 
 		 473 aa  262  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  34.73 
 
 		 474 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  33.77 
 
 		 455 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  34.42 
 
 		 472 aa  257  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  34.6 
 
 		 474 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  34.51 
 
 		 474 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  35.04 
 
 		 473 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.99 
 
 		 472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  35.19 
 
 		 474 aa  254  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  36.05 
 
 		 485 aa  254  3e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  34.73 
 
 		 476 aa  251  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  35.16 
 
 		 467 aa  249  9e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  32.82 
 
 		 459 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 		 451 aa  247  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  33.8 
 
 		 399 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 399 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 		 398 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  33.8 
 
 		 399 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  37.9 
 
 		 447 aa  245  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  33.8 
 
 		 399 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  33.8 
 
 		 399 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  33.8 
 
 		 399 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  33.72 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  33.8 
 
 		 399 aa  244  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  34.22 
 
 		 478 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 473 aa  243  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  34.22 
 
 		 478 aa  243  7e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  34.22 
 
 		 478 aa  243  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  34.22 
 
 		 478 aa  243  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  34.22 
 
 		 478 aa  243  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  34.22 
 
 		 478 aa  243  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  34.22 
 
 		 478 aa  243  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  33.56 
 
 		 399 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  33.33 
 
 		 399 aa  242  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  34.03 
 
 		 398 aa  239  5e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  36.73 
 
 		 435 aa  238  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  33.11 
 
 		 451 aa  236  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  37.3 
 
 		 445 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  36.09 
 
 		 477 aa  219  8.999999999999998e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  35.96 
 
 		 449 aa  218  2e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 		 404 aa  211  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 459 aa  210  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  28.73 
 
 		 464 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 		 447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  30 
 
 		 514 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1414  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 424 aa  199  1.0000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.63 
 
 		 450 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 436 aa  192  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1266  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.693096  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 473 aa  189  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1189  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 422 aa  188  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00252456  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 459 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 492 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  31.22 
 
 		 436 aa  186  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  31.22 
 
 		 436 aa  186  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 382 aa  186  8e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  29.06 
 
 		 526 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1010  major facilitator family transporter  34.05 
 
 		 398 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.45 
 
 		 461 aa  182  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 462 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 415 aa  182  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.65 
 
 		 468 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  27.41 
 
 		 460 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 462 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 434 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 480 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 480 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 466 aa  179  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 446 aa  179  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  27.74 
 
 		 438 aa  179  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  29.69 
 
 		 478 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 464 aa  177  5e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0090  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 422 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 462 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 438 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.87 
 
 		 470 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 480 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 		 494 aa  173  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 		 459 aa  173  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30.28 
 
 		 462 aa  173  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  30.8 
 
 		 467 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  30.44 
 
 		 480 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0909  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 455 aa  172  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0703326  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  30.44 
 
 		 480 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.62 
 
 		 474 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 467 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 		 477 aa  171  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>