20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0526 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0526  hypothetical protein  100 
 
 
368 aa  764    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2835  hypothetical protein  67.66 
 
 
361 aa  516  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995862  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2768  hypothetical protein  67.93 
 
 
361 aa  517  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1790  hypothetical protein  60.48 
 
 
384 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1697  hypothetical protein  55.28 
 
 
360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1491  hypothetical protein  43.16 
 
 
370 aa  266  4e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4615  hypothetical protein  42.06 
 
 
363 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0908  hypothetical protein  40.58 
 
 
379 aa  232  7.000000000000001e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0413158  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7052  hypothetical protein  36.71 
 
 
373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3124  hypothetical protein  34.94 
 
 
361 aa  162  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.507339  hitchhiker  0.000432102 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1706  hypothetical protein  35.21 
 
 
370 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3336  hypothetical protein  35.78 
 
 
396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255984  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0057  hypothetical protein  29.66 
 
 
482 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185735  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2312  hypothetical protein  29.88 
 
 
398 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.243961  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0622  hypothetical protein  34.46 
 
 
371 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0234  hypothetical protein  28.94 
 
 
326 aa  99  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0956  hypothetical protein  26.97 
 
 
594 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.194018  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4520  hypothetical protein  25.07 
 
 
541 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0874605  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3258  hypothetical protein  25.88 
 
 
930 aa  59.7  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339134  normal  0.438308 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07098  hypothetical protein  31.15 
 
 
357 aa  57  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>