More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0522 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  660    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  44.03 
 
 
328 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  45.77 
 
 
330 aa  276  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  46.26 
 
 
330 aa  275  7e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  43.83 
 
 
339 aa  275  8e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  44.19 
 
 
320 aa  275  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  46.96 
 
 
323 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  42.72 
 
 
318 aa  273  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  43.52 
 
 
331 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  42.99 
 
 
325 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  45.15 
 
 
328 aa  272  7e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  45.58 
 
 
327 aa  271  8.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  45.58 
 
 
325 aa  271  8.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.12 
 
 
327 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  41.12 
 
 
330 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  45.21 
 
 
331 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  48.03 
 
 
334 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  44.14 
 
 
339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  41.56 
 
 
328 aa  269  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.56 
 
 
328 aa  269  5e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  44.59 
 
 
328 aa  269  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  45.3 
 
 
327 aa  268  5.9999999999999995e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  43.91 
 
 
323 aa  268  8e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  44.06 
 
 
335 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  42.81 
 
 
333 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  42.11 
 
 
331 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  42.11 
 
 
338 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  44.11 
 
 
332 aa  265  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  43.18 
 
 
330 aa  263  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  45.42 
 
 
331 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  40.84 
 
 
327 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.56 
 
 
328 aa  262  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  43.84 
 
 
349 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  46.64 
 
 
330 aa  262  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  43.73 
 
 
344 aa  262  6e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  44.55 
 
 
335 aa  261  8.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  40.25 
 
 
332 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  44.03 
 
 
332 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  45.25 
 
 
333 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  42.42 
 
 
332 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  42.81 
 
 
326 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  44.26 
 
 
360 aa  261  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  42.94 
 
 
336 aa  260  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  42.91 
 
 
330 aa  260  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  42.67 
 
 
304 aa  260  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  42.91 
 
 
330 aa  260  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  41.43 
 
 
322 aa  259  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  42.03 
 
 
330 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  45.71 
 
 
330 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  41.12 
 
 
328 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  43.03 
 
 
332 aa  259  5.0000000000000005e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  42.72 
 
 
321 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  41.61 
 
 
336 aa  258  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  42.72 
 
 
325 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  41.72 
 
 
331 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  41.56 
 
 
328 aa  257  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  38.32 
 
 
331 aa  256  5e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  38.32 
 
 
331 aa  255  6e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  42.52 
 
 
322 aa  255  7e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  43.58 
 
 
353 aa  255  7e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  43.12 
 
 
343 aa  255  7e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  43.58 
 
 
328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  42.28 
 
 
324 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  44.86 
 
 
330 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  43.46 
 
 
310 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  40.53 
 
 
330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  44.56 
 
 
332 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.69 
 
 
325 aa  252  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  39.75 
 
 
332 aa  252  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  39.74 
 
 
314 aa  252  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  43.19 
 
 
305 aa  252  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  44.52 
 
 
333 aa  252  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  41.56 
 
 
322 aa  252  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0039  hypothetical protein  42.68 
 
 
324 aa  251  8.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  43.79 
 
 
318 aa  251  9.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2668  hypothetical protein  41.49 
 
 
336 aa  251  9.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  41.67 
 
 
322 aa  251  9.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  39.46 
 
 
334 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  39.82 
 
 
333 aa  251  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  40.25 
 
 
322 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  43.14 
 
 
330 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  44.88 
 
 
335 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  40.69 
 
 
326 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  40.19 
 
 
332 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  41.06 
 
 
356 aa  249  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  41.95 
 
 
328 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  40.19 
 
 
331 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  45.69 
 
 
356 aa  249  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  41.89 
 
 
353 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  42.19 
 
 
326 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  39.7 
 
 
330 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  39.32 
 
 
335 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  42.23 
 
 
355 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  43.77 
 
 
326 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  41.42 
 
 
322 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  42.57 
 
 
345 aa  247  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0125  hypothetical protein  42.57 
 
 
331 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  41.64 
 
 
331 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  41.88 
 
 
326 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  42.57 
 
 
345 aa  246  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>