More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0489 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  697  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  78.32 
 
 
339 aa  511  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  79.34 
 
 
360 aa  510  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  75.38 
 
 
345 aa  504  1e-142  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  78.06 
 
 
345 aa  504  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  70.24 
 
 
336 aa  489  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  63.96 
 
 
333 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  65.77 
 
 
333 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  51.32 
 
 
339 aa  335  5e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  51.5 
 
 
335 aa  333  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  50.15 
 
 
328 aa  329  5e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  52.75 
 
 
328 aa  328  9e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  51.77 
 
 
327 aa  327  2e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  50 
 
 
335 aa  324  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  52.25 
 
 
334 aa  320  2e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  49.84 
 
 
330 aa  316  3e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  49.84 
 
 
330 aa  315  5e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  50.47 
 
 
325 aa  309  4e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  49.02 
 
 
331 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  49.38 
 
 
326 aa  306  4e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  53.11 
 
 
330 aa  305  6e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  52.56 
 
 
335 aa  305  7e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  46.59 
 
 
328 aa  303  4e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  46.06 
 
 
330 aa  301  9e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  46.06 
 
 
330 aa  301  9e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  44.51 
 
 
331 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  50.82 
 
 
331 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  47.27 
 
 
330 aa  299  4e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  46.58 
 
 
327 aa  298  7e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  50.33 
 
 
321 aa  298  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  48.52 
 
 
328 aa  298  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  48.23 
 
 
322 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  45.75 
 
 
358 aa  297  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  48.85 
 
 
349 aa  296  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  51.15 
 
 
339 aa  296  3e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  45.21 
 
 
330 aa  296  4e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  48.2 
 
 
328 aa  295  6e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  46.89 
 
 
334 aa  295  8e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0994  hypothetical protein  48.55 
 
 
341 aa  293  3e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  48.52 
 
 
328 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1078  hypothetical protein  48.55 
 
 
344 aa  293  3e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.058258  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  46.29 
 
 
331 aa  292  5e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  46.96 
 
 
322 aa  292  6e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  45.21 
 
 
344 aa  290  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  48.05 
 
 
355 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  45.32 
 
 
336 aa  289  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  47.42 
 
 
324 aa  290  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  48.69 
 
 
324 aa  289  5e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  48.2 
 
 
328 aa  289  5e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  43.66 
 
 
333 aa  288  6e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  48.73 
 
 
335 aa  288  8e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  43.49 
 
 
334 aa  288  9e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  48.01 
 
 
325 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  50 
 
 
333 aa  287  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  49.02 
 
 
323 aa  287  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  45.92 
 
 
339 aa  286  3e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  46.63 
 
 
328 aa  286  3e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  46.57 
 
 
330 aa  286  3e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  49.51 
 
 
322 aa  286  4e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  47.71 
 
 
324 aa  286  4e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  44.91 
 
 
324 aa  285  8e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  43.71 
 
 
330 aa  285  9e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  48.2 
 
 
353 aa  285  9e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  46.89 
 
 
325 aa  285  1e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  46.89 
 
 
327 aa  284  1e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  49.02 
 
 
323 aa  284  1e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  46.43 
 
 
326 aa  284  2e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  46.41 
 
 
328 aa  283  4e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  44.9 
 
 
318 aa  282  7e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  46.35 
 
 
334 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  44.62 
 
 
337 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  48.36 
 
 
386 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  45.21 
 
 
337 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  42.47 
 
 
332 aa  280  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  44.12 
 
 
326 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  44.34 
 
 
332 aa  279  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  47 
 
 
326 aa  279  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  3.51886e-10  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  45.9 
 
 
332 aa  279  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5058  extra-cytoplasmic solute receptor  50.49 
 
 
328 aa  278  8e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0827045  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  46.05 
 
 
304 aa  278  9e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  45.28 
 
 
322 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  44.58 
 
 
321 aa  278  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  44.58 
 
 
321 aa  278  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  42.01 
 
 
331 aa  277  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  42.01 
 
 
331 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  45.9 
 
 
339 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  42.48 
 
 
327 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  50.34 
 
 
325 aa  276  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  45.75 
 
 
334 aa  276  5e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  45.73 
 
 
334 aa  275  6e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5869  extra-cytoplasmic solute receptor  46.51 
 
 
346 aa  275  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  44.17 
 
 
330 aa  275  1e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5388  hypothetical protein  44.19 
 
 
337 aa  275  1e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  46.53 
 
 
321 aa  273  2e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3791  hypothetical protein  45.03 
 
 
320 aa  274  2e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  44.63 
 
 
322 aa  274  2e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  44.16 
 
 
324 aa  273  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  45.69 
 
 
322 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  43.67 
 
 
327 aa  273  4e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  46.13 
 
 
322 aa  273  4e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>