More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0422 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0422  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 527 aa  1088    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147362  normal  0.173861 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0423  extracellular solute-binding protein  81.4 
 
 		 527 aa  853    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204725  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  45.9 
 
 		 528 aa  463  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  45.7 
 
 		 528 aa  463  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.414652 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  47.48 
 
 		 526 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4792  extracellular solute-binding protein  45.25 
 
 		 528 aa  456  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  45.64 
 
 		 527 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  45.11 
 
 		 528 aa  455  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1300  extracellular solute-binding protein  47.07 
 
 		 526 aa  445  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2857  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  44.4 
 
 		 532 aa  438  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1303  extracellular solute-binding protein  42.61 
 
 		 544 aa  420  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0663  extracellular solute-binding protein family 5  42.89 
 
 		 526 aa  414  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.373149  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0685  extracellular solute-binding protein  42.16 
 
 		 526 aa  415  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429103 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1097  putative binding-dependent transport protein (periplasmic)  42.63 
 
 		 528 aa  403  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1815  extracellular solute-binding protein  44.01 
 
 		 532 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5794  extracellular solute-binding protein  40.54 
 
 		 520 aa  398  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000436692  decreased coverage  0.000177852 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0255  extracellular solute-binding protein  43.09 
 
 		 531 aa  396  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.146115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0666  extracellular solute-binding protein family 5  43.12 
 
 		 523 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.404568  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  42.02 
 
 		 531 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0688  extracellular solute-binding protein  43.12 
 
 		 523 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110035  normal  0.066295 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4474  extracellular solute-binding protein  41.37 
 
 		 538 aa  381  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3143  extracellular solute-binding protein  39.51 
 
 		 524 aa  358  9.999999999999999e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0573017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3144  extracellular solute-binding protein  38.1 
 
 		 526 aa  356  5e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000116165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0872  extracellular solute-binding protein family 5  38.57 
 
 		 527 aa  355  8.999999999999999e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  37.55 
 
 		 528 aa  355  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4426  extracellular solute-binding protein  39.36 
 
 		 556 aa  353  5.9999999999999994e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169116  normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5796  extracellular solute-binding protein  38.22 
 
 		 526 aa  350  4e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00815808  hitchhiker  0.00391201 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2822  extracellular solute-binding protein  38 
 
 		 517 aa  348  2e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.687608  normal  0.0566169 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  38.56 
 
 		 530 aa  348  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2819  extracellular solute-binding protein  36.44 
 
 		 529 aa  343  5.999999999999999e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000112764  normal  0.172306 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0877  4-phytase  40.73 
 
 		 460 aa  342  1e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  32.82 
 
 		 517 aa  273  4.0000000000000004e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  32.82 
 
 		 542 aa  273  5.000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  35.46 
 
 		 528 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide/dipeptide-binding protein  34.66 
 
 		 595 aa  266  5e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  33.98 
 
 		 519 aa  266  8e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1792  extracellular solute-binding protein family 5  32.81 
 
 		 514 aa  265  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0136295  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  33.4 
 
 		 517 aa  264  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  34.59 
 
 		 530 aa  260  5.0000000000000005e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  31.5 
 
 		 516 aa  259  6e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  34.9 
 
 		 533 aa  259  6e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2799  extracellular solute-binding protein  32.66 
 
 		 520 aa  259  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  34.71 
 
 		 533 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  32.95 
 
 		 535 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  34.64 
 
 		 509 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  30.83 
 
 		 526 aa  252  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1686  extracellular solute-binding protein  30.1 
 
 		 514 aa  248  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.898408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  33.71 
 
 		 531 aa  244  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  33.81 
 
 		 535 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  28.88 
 
 		 518 aa  241  2.9999999999999997e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1829  extracellular solute-binding protein family 5  31.1 
 
 		 520 aa  240  4e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  32.35 
 
 		 514 aa  239  8e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  34.38 
 
 		 532 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  34.18 
 
 		 532 aa  236  7e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0449  extracellular solute-binding protein  30.14 
 
 		 520 aa  234  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2474  extracellular solute-binding protein  31.14 
 
 		 525 aa  233  5e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  33.65 
 
 		 538 aa  232  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  33.14 
 
 		 516 aa  231  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  33.14 
 
 		 516 aa  230  6e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  29.18 
 
 		 537 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  32.48 
 
 		 512 aa  228  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  32.68 
 
 		 505 aa  225  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  34.08 
 
 		 528 aa  225  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  32.24 
 
 		 522 aa  213  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  32.24 
 
 		 525 aa  208  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  30.78 
 
 		 526 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4690  extracellular solute-binding protein family 5  29.56 
 
 		 524 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  31.78 
 
 		 534 aa  196  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  31.57 
 
 		 534 aa  196  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3881  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 		 515 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.441306  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.12 
 
 		 521 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  29.98 
 
 		 521 aa  189  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1240  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 		 544 aa  189  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.602045  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  29.19 
 
 		 549 aa  184  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.2 
 
 		 534 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3737  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 517 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  31.75 
 
 		 509 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.03 
 
 		 532 aa  166  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  30.82 
 
 		 520 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  28.03 
 
 		 527 aa  164  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.59 
 
 		 510 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  28.11 
 
 		 521 aa  163  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.89 
 
 		 535 aa  160  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 521 aa  156  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  26.02 
 
 		 521 aa  156  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.02 
 
 		 521 aa  156  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  26.02 
 
 		 521 aa  156  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  26.22 
 
 		 521 aa  154  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  29.64 
 
 		 512 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  29.64 
 
 		 512 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  29.64 
 
 		 512 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  27.72 
 
 		 497 aa  150  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  29.31 
 
 		 520 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 		 490 aa  147  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  27.79 
 
 		 509 aa  146  9e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  29.64 
 
 		 502 aa  146  9e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  29.56 
 
 		 525 aa  146  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 528 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  26.68 
 
 		 520 aa  144  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.44 
 
 		 508 aa  143  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>