225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0374 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  100 
 
 		 274 aa  548  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  56.85 
 
 		 251 aa  294  8e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  56.18 
 
 		 254 aa  279  4e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2338  LamB/YcsF family protein  56.47 
 
 		 256 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  53.2 
 
 		 255 aa  265  8e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  52.42 
 
 		 258 aa  263  3e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  50.6 
 
 		 253 aa  262  4e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  51 
 
 		 253 aa  262  6e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  51.81 
 
 		 253 aa  262  6e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  50.6 
 
 		 254 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 		 253 aa  258  9e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  49.8 
 
 		 253 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 		 253 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  49.8 
 
 		 253 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 		 253 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  52.4 
 
 		 254 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  56.63 
 
 		 260 aa  253  3e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  49 
 
 		 253 aa  253  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  50.6 
 
 		 257 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0986  lactam utilization protein B related protein  50.62 
 
 		 254 aa  250  1e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  47.98 
 
 		 252 aa  249  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  47.39 
 
 		 252 aa  249  3e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  45.06 
 
 		 255 aa  248  5e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  45.06 
 
 		 255 aa  248  7e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0064  LamB/YcsF family protein  54.07 
 
 		 246 aa  248  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  45.06 
 
 		 255 aa  248  7e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0089  LamB/YcsF family protein  54.47 
 
 		 246 aa  248  8e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0380957  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1504  LamB/YcsF family protein  51.75 
 
 		 262 aa  248  8e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  51.43 
 
 		 255 aa  248  9e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  52.78 
 
 		 255 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  45.42 
 
 		 257 aa  247  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  51.98 
 
 		 254 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  52.42 
 
 		 251 aa  246  4e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  52.78 
 
 		 254 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  51.61 
 
 		 252 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  52.19 
 
 		 256 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4365  LamB/YcsF family protein  53.06 
 
 		 246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  51.39 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  47.58 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  51.79 
 
 		 256 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  46.37 
 
 		 250 aa  243  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  46.37 
 
 		 250 aa  243  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2372  LamB/YcsF family protein  52.02 
 
 		 247 aa  242  6e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.839401 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2788  LamB/YcsF family protein  54.8 
 
 		 251 aa  241  6e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1972  LamB/YcsF family protein  52.42 
 
 		 256 aa  241  7e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1341  LamB/YcsF family protein  49.19 
 
 		 255 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  51.19 
 
 		 256 aa  241  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  50.99 
 
 		 256 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  43.78 
 
 		 255 aa  237  1e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2169  LamB/YcsF family protein  52.42 
 
 		 247 aa  237  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  50 
 
 		 255 aa  236  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  49.6 
 
 		 255 aa  235  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5650  LamB/YcsF family protein  46.77 
 
 		 255 aa  234  8e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  46.61 
 
 		 254 aa  234  8e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  49.2 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  51.23 
 
 		 253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2272  LamB/YcsF family protein  47.2 
 
 		 255 aa  231  7.000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1216  LamB/YcsF family protein  50.6 
 
 		 245 aa  231  9e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0728  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 		 244 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.45791 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  46.61 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  48.83 
 
 		 260 aa  229  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  50.41 
 
 		 250 aa  229  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3352  LamB/YcsF family protein  51.18 
 
 		 253 aa  228  9e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  48.61 
 
 		 254 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  48.61 
 
 		 254 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  48.61 
 
 		 254 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  46.64 
 
 		 254 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  51.39 
 
 		 304 aa  227  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 		 256 aa  227  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0228  LamB/YcsF family protein  49.59 
 
 		 254 aa  226  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  50.81 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5077  LamB/YcsF family protein  48.21 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.709601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2827  LamB/YcsF family protein  53.39 
 
 		 245 aa  226  4e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  hitchhiker  0.00875882 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0803  LamB/YcsF family protein  48.99 
 
 		 244 aa  225  8e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.179932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0447  LamB/YcsF family protein  49.19 
 
 		 262 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0264  LamB/YcsF family protein  49.19 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0974794  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0822  LamB/YcsF family protein  50.81 
 
 		 244 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0506032  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00673  hypothetical protein  48.58 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0774  LamB/YcsF family protein  51.22 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.846244 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2942  LamB/YcsF family protein  48.58 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00662  hypothetical protein  48.58 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0251  LamB/YcsF family protein  49.19 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  48.25 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  46 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0871  LamB/YcsF family protein  50.81 
 
 		 244 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.557987  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3140  LamB/YcsF family protein  47.97 
 
 		 258 aa  223  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0738  LamB/YcsF family protein  48.18 
 
 		 244 aa  222  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0761  LamB/YcsF family protein  50.81 
 
 		 244 aa  222  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  47.97 
 
 		 250 aa  223  4e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0761  LamB/YcsF family protein  48.18 
 
 		 244 aa  222  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3309  LamB/YcsF family protein  48.78 
 
 		 254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.716241  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2978  LamB/YcsF family protein  48.78 
 
 		 254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2113  LamB/YcsF family protein  48.78 
 
 		 254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3370  LamB/YcsF family protein  48.78 
 
 		 254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2923  LamB/YcsF family protein  48.58 
 
 		 244 aa  221  7e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140615  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2226  LamB/YcsF family protein  45.56 
 
 		 254 aa  221  8e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  48.78 
 
 		 250 aa  221  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  48.99 
 
 		 253 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0630  LamB/YcsF family protein  47.77 
 
 		 244 aa  221  9.999999999999999e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1980  LamB/YcsF family protein  46.67 
 
 		 259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171805  normal  0.0279771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>