More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0247 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  100 
 
 
639 aa  1287  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  52.04 
 
 
594 aa  600  1e-170  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  67.42 
 
 
474 aa  593  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  49.5 
 
 
589 aa  558  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  48.14 
 
 
638 aa  555  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  47.43 
 
 
572 aa  551  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  48.07 
 
 
634 aa  549  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  48.01 
 
 
563 aa  538  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2309  FHA domain containing protein  62.92 
 
 
568 aa  526  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  59.43 
 
 
569 aa  523  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  55.58 
 
 
463 aa  450  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  56.16 
 
 
444 aa  443  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  50.63 
 
 
463 aa  432  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1206  type II secretion system protein E  53.5 
 
 
742 aa  430  1e-119  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00140506  hitchhiker  1.53533e-12 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  55.79 
 
 
468 aa  427  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  49.88 
 
 
441 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  47.71 
 
 
487 aa  425  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2116  type II secretion system protein E  53.47 
 
 
457 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768773  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  53.1 
 
 
465 aa  424  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  8.47512e-06 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  51.06 
 
 
465 aa  422  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  51.52 
 
 
491 aa  421  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  50.95 
 
 
467 aa  419  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  56.2 
 
 
478 aa  419  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  47.84 
 
 
677 aa  421  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  48.52 
 
 
477 aa  420  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  50 
 
 
442 aa  417  1e-115  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  48.71 
 
 
472 aa  416  1e-115  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  51.06 
 
 
624 aa  412  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  46.52 
 
 
560 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  51.82 
 
 
471 aa  411  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2648  type II secretion system protein E  52.98 
 
 
498 aa  412  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  49.77 
 
 
452 aa  410  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  56.47 
 
 
513 aa  412  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  49.77 
 
 
442 aa  410  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2933  type II secretion system protein E  51.95 
 
 
495 aa  407  1e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242377  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  52.41 
 
 
470 aa  407  1e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  46.41 
 
 
469 aa  407  1e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  49.32 
 
 
462 aa  405  1e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  47.98 
 
 
455 aa  405  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  49.53 
 
 
451 aa  404  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  47.98 
 
 
455 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  47.98 
 
 
455 aa  405  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  52.14 
 
 
491 aa  405  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  48.52 
 
 
460 aa  399  1e-110  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  48.09 
 
 
454 aa  401  1e-110  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  48.09 
 
 
454 aa  401  1e-110  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  51.02 
 
 
468 aa  401  1e-110  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  49.29 
 
 
455 aa  400  1e-110  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  49.76 
 
 
455 aa  402  1e-110  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  49.76 
 
 
455 aa  401  1e-110  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  49.76 
 
 
455 aa  401  1e-110  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  48.09 
 
 
454 aa  401  1e-110  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  47.96 
 
 
454 aa  398  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  46.58 
 
 
472 aa  399  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  49.41 
 
 
454 aa  398  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  49.88 
 
 
459 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  46.87 
 
 
479 aa  396  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  47.39 
 
 
464 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  47.48 
 
 
453 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  43.69 
 
 
467 aa  394  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  49.06 
 
 
457 aa  391  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  49.17 
 
 
456 aa  391  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  46.9 
 
 
473 aa  389  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  46.88 
 
 
608 aa  388  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  48.3 
 
 
452 aa  385  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  53.85 
 
 
515 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  53.56 
 
 
520 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  53.56 
 
 
523 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  53.56 
 
 
520 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  53.56 
 
 
520 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  53.56 
 
 
521 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1055  type II secretion system protein E  50.12 
 
 
437 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3206  type II secretion system protein E  50.6 
 
 
437 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.235983 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  47.69 
 
 
445 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  45.47 
 
 
458 aa  382  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  45.45 
 
 
508 aa  382  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0994  type II secretion system protein E  45.55 
 
 
496 aa  382  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.010804  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  47.49 
 
 
474 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  53.56 
 
 
523 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  45.35 
 
 
463 aa  378  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  45.62 
 
 
455 aa  378  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  43.51 
 
 
467 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2700  type II secretion system protein E  49.88 
 
 
437 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  47.63 
 
 
452 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2349  type II secretion system protein E  49.13 
 
 
485 aa  375  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.413673 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4155  type II secretion system protein E  56.69 
 
 
471 aa  370  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  45.85 
 
 
489 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  47.33 
 
 
477 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  48.74 
 
 
449 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3352  type II secretion system protein E  56.4 
 
 
471 aa  372  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.695645  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  52.54 
 
 
466 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  45.93 
 
 
476 aa  372  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  48.4 
 
 
467 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  46.03 
 
 
485 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  45.87 
 
 
482 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  46.31 
 
 
482 aa  366  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1126  type II secretion system protein E  47.07 
 
 
484 aa  369  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188659  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0302  type II secretion system protein E  45.72 
 
 
484 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  42.68 
 
 
492 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  46.73 
 
 
433 aa  368  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>