More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0233 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  100 
 
 		 388 aa  778    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  54.4 
 
 		 384 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  44.27 
 
 		 390 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  45.62 
 
 		 378 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  46.55 
 
 		 390 aa  298  9e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  43.98 
 
 		 385 aa  297  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3322  thiolase  45.45 
 
 		 383 aa  290  4e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152041  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3972  thiolase  45.45 
 
 		 383 aa  288  8e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  43.7 
 
 		 389 aa  287  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2105  thiolase  44.03 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0715913  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  46.48 
 
 		 393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  43.86 
 
 		 383 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  44.91 
 
 		 402 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3314  thiolase  42.04 
 
 		 404 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  44.39 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  44.39 
 
 		 403 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  43.86 
 
 		 383 aa  275  7e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3952  putative thiolase  45.09 
 
 		 378 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.130005  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  45.74 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  42.97 
 
 		 390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  45.05 
 
 		 381 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  44.39 
 
 		 383 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  44.95 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  42.52 
 
 		 382 aa  267  2.9999999999999995e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  41.75 
 
 		 380 aa  261  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  40.52 
 
 		 383 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3886  thiolase  45.65 
 
 		 381 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266996  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  43.69 
 
 		 380 aa  258  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  39.64 
 
 		 379 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  40.42 
 
 		 385 aa  256  7e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  43.46 
 
 		 381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  41.47 
 
 		 389 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  41.47 
 
 		 389 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  40.77 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  39.38 
 
 		 379 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  40.68 
 
 		 388 aa  243  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  38.34 
 
 		 379 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  39.79 
 
 		 388 aa  242  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  40.57 
 
 		 379 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  39.43 
 
 		 383 aa  241  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  41.98 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  38.6 
 
 		 379 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  39.48 
 
 		 388 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  39.69 
 
 		 391 aa  233  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  39.69 
 
 		 382 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  38.64 
 
 		 382 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  41.28 
 
 		 383 aa  229  7e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  38.9 
 
 		 382 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  41.43 
 
 		 384 aa  225  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  40.15 
 
 		 387 aa  224  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.4 
 
 		 388 aa  222  9e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  38.93 
 
 		 391 aa  219  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  37.56 
 
 		 389 aa  219  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  41.27 
 
 		 389 aa  219  7e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  38.97 
 
 		 388 aa  219  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  39.79 
 
 		 382 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  38.23 
 
 		 396 aa  215  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2744  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase, PaaJ-like  36.3 
 
 		 406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0906041 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  36.86 
 
 		 390 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  34.83 
 
 		 388 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  35.38 
 
 		 387 aa  212  9e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  38.77 
 
 		 395 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  38.4 
 
 		 394 aa  206  8e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  37.47 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  32.81 
 
 		 388 aa  204  2e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  38.42 
 
 		 390 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  34.78 
 
 		 390 aa  203  4e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  34.74 
 
 		 390 aa  203  4e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.5 
 
 		 378 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  37.6 
 
 		 390 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  35.08 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  39.15 
 
 		 385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  36.94 
 
 		 386 aa  200  3e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  38.78 
 
 		 395 aa  200  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  37.26 
 
 		 394 aa  199  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  37.9 
 
 		 386 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  38.44 
 
 		 385 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  38.57 
 
 		 385 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  39.59 
 
 		 389 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  34.04 
 
 		 388 aa  195  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  32.59 
 
 		 403 aa  194  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  38.02 
 
 		 385 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  37.79 
 
 		 390 aa  194  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  38.02 
 
 		 385 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1335  hypothetical protein  39.48 
 
 		 391 aa  190  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  36.69 
 
 		 385 aa  190  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3226  hypothetical protein  37.61 
 
 		 388 aa  189  9e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3215  hypothetical protein  37.61 
 
 		 388 aa  189  9e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3277  hypothetical protein  37.61 
 
 		 388 aa  189  9e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  36.46 
 
 		 394 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  36.41 
 
 		 386 aa  187  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  35.4 
 
 		 385 aa  186  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  35.14 
 
 		 394 aa  186  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  34.11 
 
 		 387 aa  186  7e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  36.63 
 
 		 385 aa  186  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.51 
 
 		 387 aa  186  8e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  37.02 
 
 		 548 aa  186  9e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  33.25 
 
 		 391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.6 
 
 		 392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  33.42 
 
 		 402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>