More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0154 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 
333 aa  654    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4785  KpsF/GutQ family protein  81.48 
 
 
339 aa  484  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4132  KpsF/GutQ family protein  77.09 
 
 
333 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3490  KpsF/GutQ family protein  76.78 
 
 
333 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  72.07 
 
 
333 aa  463  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  73.07 
 
 
335 aa  464  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  73.21 
 
 
333 aa  457  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4108  KpsF/GutQ family protein  69.66 
 
 
330 aa  436  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal  0.0965302 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5294  KpsF/GutQ family protein  69.39 
 
 
332 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  66.67 
 
 
330 aa  414  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  61.3 
 
 
333 aa  403  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3809  arabinose-5-phosphate isomerase  69.75 
 
 
340 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  61.92 
 
 
327 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  61.92 
 
 
327 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  60 
 
 
339 aa  366  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0359  KpsF/GutQ  58.2 
 
 
327 aa  358  7e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  57.62 
 
 
333 aa  358  8e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  59.35 
 
 
333 aa  357  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0491  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  60.37 
 
 
327 aa  353  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566737  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0137  KpsF/GutQ family protein  57.54 
 
 
335 aa  353  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0071  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  59.44 
 
 
327 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3102  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  59.44 
 
 
327 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0770  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  59.44 
 
 
327 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1519  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  59.44 
 
 
327 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0602  KpsF/GutQ family sugar isomerase  59.44 
 
 
327 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2947  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  59.44 
 
 
327 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0586  KpsF/GutQ family sugar isomerase  59.44 
 
 
327 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0307  KpsF/GutQ family protein  57.28 
 
 
327 aa  350  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0601  KpsF/GutQ family protein  58.28 
 
 
327 aa  349  4e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0442241 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3418  KpsF/GutQ  59.75 
 
 
332 aa  347  2e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000032508  normal  0.585789 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2172  KpsF/GutQ family protein  58.28 
 
 
327 aa  346  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2786  KpsF/GutQ family protein  58.28 
 
 
327 aa  346  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258492  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2797  KpsF/GutQ family protein  58.28 
 
 
327 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.154837 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  55.56 
 
 
330 aa  345  7e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  56.52 
 
 
325 aa  345  8e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  56.83 
 
 
323 aa  344  1e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6116  KpsF/GutQ family sugar isomerase  57.67 
 
 
327 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2704  KpsF/GutQ family protein  57.98 
 
 
327 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0680644 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  55.1 
 
 
345 aa  342  5.999999999999999e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  55.1 
 
 
345 aa  342  8e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0331  KpsF/GutQ family protein  55.99 
 
 
346 aa  341  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4117  KpsF/GutQ  58.2 
 
 
327 aa  341  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0879  KpsF/GutQ family protein  58.75 
 
 
329 aa  340  1e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00879092  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2846  KpsF/GutQ family protein  57.67 
 
 
327 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2788  sugar phosphate isomerase  54.37 
 
 
330 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000495576  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1612  KpsF/GutQ family protein  55.86 
 
 
330 aa  339  2.9999999999999998e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  53.27 
 
 
324 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  52.68 
 
 
323 aa  338  5.9999999999999996e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3083  arabinose-5-phosphate isomerase  53.87 
 
 
325 aa  338  8e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  52.96 
 
 
324 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0538  capsule expression protein KpsF/GutQ  56.97 
 
 
328 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0529  KpsF/GutQ family protein  57.06 
 
 
327 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.64598  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  52.96 
 
 
324 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  54.27 
 
 
330 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  54.78 
 
 
326 aa  335  7e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3611  KpsF/GutQ family protein  52.01 
 
 
325 aa  333  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  53 
 
 
324 aa  333  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  50.31 
 
 
324 aa  333  3e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  50.16 
 
 
324 aa  332  6e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2225  KpsF/GutQ family protein  58.1 
 
 
341 aa  332  7.000000000000001e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  53.18 
 
 
324 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  52.01 
 
 
329 aa  330  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0731  Arabinose-5-phosphate isomerase  54.37 
 
 
325 aa  329  3e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  53.18 
 
 
326 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  52.87 
 
 
324 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0678  KpsF/GutQ family protein  51.08 
 
 
325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.732488  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3344  KpsF/GutQ family protein  51.08 
 
 
325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3372  KpsF/GutQ family protein  51.55 
 
 
325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.600625  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  51.4 
 
 
324 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0677  KpsF/GutQ family protein  51.08 
 
 
325 aa  327  3e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.953587  normal  0.0677039 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.85 
 
 
328 aa  326  3e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3956  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  51.08 
 
 
325 aa  325  6e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  50.77 
 
 
323 aa  325  6e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  52.37 
 
 
324 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0720  KpsF/GutQ family protein  51.39 
 
 
325 aa  323  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.500239  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.23 
 
 
345 aa  323  3e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  51.39 
 
 
323 aa  322  4e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.23 
 
 
328 aa  322  5e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  53.23 
 
 
328 aa  322  5e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.23 
 
 
328 aa  322  5e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.23 
 
 
328 aa  322  5e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.23 
 
 
328 aa  322  5e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.23 
 
 
328 aa  322  5e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  53.23 
 
 
328 aa  322  5e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.23 
 
 
328 aa  322  5e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.23 
 
 
328 aa  322  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.23 
 
 
328 aa  322  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0494  KpsF/GutQ family protein  50.77 
 
 
325 aa  322  6e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0102894  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.23 
 
 
328 aa  322  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.23 
 
 
328 aa  322  6e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  51.74 
 
 
324 aa  322  7e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.23 
 
 
328 aa  322  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.23 
 
 
328 aa  322  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.23 
 
 
328 aa  321  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0279  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.56 
 
 
363 aa  321  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.954706  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.62 
 
 
357 aa  321  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3306  KpsF/GutQ family protein  50.15 
 
 
325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.92 
 
 
328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4235  KpsF/GutQ family protein  50.15 
 
 
325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000366362 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.62 
 
 
342 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>