24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0123 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0123  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
296 aa  613  1e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1092  hypothetical protein  43.22 
 
 
337 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.109622  hitchhiker  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0486  hypothetical protein  31.05 
 
 
281 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013307 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0553  hypothetical protein, putative phage gene  35.26 
 
 
294 aa  97.1  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.070631  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4747  methionine sulfoxide reductase A  32.12 
 
 
301 aa  96.7  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3168  hypothetical protein  31.25 
 
 
294 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5903  methionine sulfoxide reductase A  29.88 
 
 
311 aa  89.4  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal  0.547889 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0232  hypothetical protein  32.32 
 
 
313 aa  88.6  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.227271  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0619  hypothetical protein  32.32 
 
 
318 aa  88.6  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2410  hypothetical protein  30.65 
 
 
300 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1829  methionine sulfoxide reductase A  29.65 
 
 
306 aa  85.5  1e-15  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.349811  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0087  methionine sulfoxide reductase A  28.89 
 
 
299 aa  82.4  7e-15  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000549703  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1152  hypothetical protein  29.88 
 
 
334 aa  79.3  6e-14  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.363384  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1217  hypothetical protein  30 
 
 
299 aa  72.8  6e-12  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2394  hypothetical protein  21.9 
 
 
291 aa  72.8  7e-12  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  5.39888e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3728  hypothetical protein  29.31 
 
 
324 aa  68.6  1e-10  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.926929  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0802  hypothetical protein  27.44 
 
 
279 aa  61.6  2e-08  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  2.0853e-13  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2225  hypothetical protein  25.14 
 
 
298 aa  60.1  4e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0918911  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1942  hypothetical protein  23.95 
 
 
308 aa  54.3  3e-06  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.350781  normal  0.226641 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3776  hypothetical protein  34.07 
 
 
102 aa  49.7  6e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3849  hypothetical protein  34.07 
 
 
102 aa  49.7  6e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0622  hypothetical protein  29.61 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3159  methionine sulfoxide reductase A  25.48 
 
 
306 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.414524  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1485  hypothetical protein  27.61 
 
 
275 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>