30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0098 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0098  hypothetical protein  100 
 
 
872 aa  1791    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2521  hypothetical protein  36.79 
 
 
869 aa  519  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.828375 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4461  hypothetical protein  37.03 
 
 
858 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1466  hypothetical protein  37.15 
 
 
858 aa  449  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.467243  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1489  hypothetical protein  37.15 
 
 
858 aa  449  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3821  hypothetical protein  33.84 
 
 
870 aa  430  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0310113 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0748  hypothetical protein  34.47 
 
 
855 aa  427  1e-118  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.298605  normal  0.440798 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5574  hypothetical protein  33.88 
 
 
844 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218076  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5977  hypothetical protein  33.88 
 
 
844 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2658  hypothetical protein  32.16 
 
 
839 aa  373  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000653199  hitchhiker  0.00786959 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5900  hypothetical protein  30.79 
 
 
792 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3110  hypothetical protein  30.98 
 
 
611 aa  213  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.464764  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3322  S8A family peptidase  23.78 
 
 
795 aa  75.9  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.546962  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0448  hypothetical protein  29.83 
 
 
712 aa  68.9  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3111  hypothetical protein  31.45 
 
 
169 aa  66.6  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2639  hypothetical protein  25.7 
 
 
821 aa  64.3  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0443804  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3864  hypothetical protein  26.46 
 
 
847 aa  61.6  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.000004588 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1641  Subtilisin-like serine protease protein  27.87 
 
 
570 aa  61.6  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1586  hypothetical protein  24.66 
 
 
847 aa  60.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5724  hypothetical protein  41.67 
 
 
152 aa  57.8  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3853  hypothetical protein  22.95 
 
 
845 aa  56.2  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3504  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.83 
 
 
827 aa  55.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.227841  normal  0.192563 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4146  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.28 
 
 
729 aa  53.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0370543 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4275  hypothetical protein  21.7 
 
 
826 aa  52.4  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5328  hypothetical protein  25.25 
 
 
829 aa  51.2  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355422  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0085  hypothetical protein  21.1 
 
 
849 aa  48.9  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0321951  normal  0.899584 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0523  hypothetical protein  24.4 
 
 
743 aa  47.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3535  hypothetical protein  25.36 
 
 
850 aa  47.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.692569  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4230  hypothetical protein  27.8 
 
 
789 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.828103  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2858  hypothetical protein  29.69 
 
 
835 aa  46.2  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>