225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0082 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0082  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  100 
 
 		 285 aa  583  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1422  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  61.34 
 
 		 280 aa  331  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.162088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1870  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  57.49 
 
 		 268 aa  318  6e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2309  TPR repeat-containing protein  54.15 
 
 		 278 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1168  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  54.68 
 
 		 275 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1088  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  56.02 
 
 		 275 aa  305  5.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.756407  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2185  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  57.04 
 
 		 285 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2610  tetratricopeptide TPR_2  59.62 
 
 		 269 aa  296  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.104861  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5021  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  54.96 
 
 		 295 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.667321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2870  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  48.19 
 
 		 306 aa  237  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2088  TPR repeat-containing protein  49.57 
 
 		 259 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.883758  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1998  uncharacterized protein involved in fimbrial biogenesis  42.11 
 
 		 267 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.151418 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2108  TPR repeat-containing protein  43.97 
 
 		 258 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1213  putative type 4 fimbrial biogenesis protein  41.76 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.543413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1149  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  41 
 
 		 265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588418  normal  0.518826 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1057  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  40.23 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0988004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2987  TPR repeat-containing protein  37.95 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0592  TPR repeat-containing pilus assembly protein PilF  40.38 
 
 		 261 aa  145  9e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83159  normal  0.24417 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3392  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  35.69 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1622  tetratricopeptide TPR_2  34.25 
 
 		 247 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247403 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0901  tfp pilus assembly protein PilF  29.58 
 
 		 246 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2888  type IV pilus biogenesis protein PilF, putative  29.22 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01054  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  33.33 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.5978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06112  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  33.33 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.21949  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1226  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  27.41 
 
 		 262 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0380935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1297  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  29.26 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.276388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1430  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  27.24 
 
 		 262 aa  102  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.14258  normal  0.202712 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1371  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  28.82 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.503899  normal  0.0591536 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3007  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  28.82 
 
 		 262 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000355185  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2992  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  28.82 
 
 		 262 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00509234  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3150  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  28.82 
 
 		 262 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0633925  hitchhiker  0.00734203 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1227  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  28.63 
 
 		 262 aa  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.023902  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3314  fimbrial biogenesis and twitching motility protein, putative  26.64 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0733  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  28.4 
 
 		 256 aa  99  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2192  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  28.82 
 
 		 276 aa  97.1  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1288  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  27.13 
 
 		 262 aa  97.1  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1715  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  30.62 
 
 		 269 aa  97.1  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.360118  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1542  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  27.06 
 
 		 262 aa  97.1  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.364125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3128  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  28.69 
 
 		 332 aa  96.7  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2654  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  25.48 
 
 		 262 aa  95.5  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1779  type IV pilus assembly protein PilF  30.5 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.821646  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1303  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  25.58 
 
 		 266 aa  92.8  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.682058  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2050  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  26.99 
 
 		 258 aa  92  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.024552  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1114  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  26.43 
 
 		 261 aa  90.5  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22274  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2367  fimbrial biogenesis and twitching motility protein, putative  25.69 
 
 		 262 aa  89.4  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000000700104  normal  0.549255 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1166  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  26.44 
 
 		 261 aa  89  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.327307 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1254  tetratricopeptide TPR_2  27.36 
 
 		 260 aa  89  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.146515  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1250  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  30.34 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.901782  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1432  type IV pilus biogenesis protein PilF  27.63 
 
 		 252 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02493  hypothetical protein  26.03 
 
 		 253 aa  87  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14850  type 4 fimbrial biogenesis protein PilF  26.64 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1309  type 4 fimbrial biogenesis protein PilF  26.64 
 
 		 252 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1658  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  28.97 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.311816 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003634  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilF  26.03 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1217  putative fimbrial biogenesis and twitching motility protein  28.57 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.544829  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40310  type IV pilus biogenesis protein PilF  27.06 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4603  Type IV pilus biogenesis protein PilF  26.32 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1246  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.619631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0650  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 317 aa  72.4  0.000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1603  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  34.71 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0684116 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1931  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  34.71 
 
 		 249 aa  72  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0417979  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0727  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilF  23.21 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1904  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  33.14 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1550  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.41 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000389536  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1125  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  25.28 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.377413  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0420  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  26.82 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209508 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1184  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  26.82 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1291  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  26.82 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0680  type 4 fimbrial biogenesis protein  25.79 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000581719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3611  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  25.23 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.253083 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3502  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  27 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0881  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  24.17 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.904873  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0851  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  24.17 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0894  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  25.59 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000416211 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1432  hypothetical protein  25.53 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1256  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  22.97 
 
 		 261 aa  57  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.812098  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4254  lysM domain-containing protein  23.86 
 
 		 524 aa  57  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.305557  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.47 
 
 		 3145 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  32.17 
 
 		 452 aa  52.4  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 1276 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  37.5 
 
 		 706 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 		 452 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4327  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  24.52 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.813272  hitchhiker  0.000000000191123 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1503  hypothetical protein  24.54 
 
 		 260 aa  50.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2464  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 252 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.545805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 393 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2851  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.91 
 
 		 807 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1197  fimbrial biogenesis and twitching motility protein  26.12 
 
 		 179 aa  50.8  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0047  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 506 aa  50.4  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0614925  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3605  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.34 
 
 		 248 aa  50.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 		 685 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.68 
 
 		 219 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3025  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 239 aa  49.7  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 1121 aa  49.7  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  27.91 
 
 		 462 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 		 637 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1809  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 780 aa  49.3  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.203841  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  23.53 
 
 		 733 aa  49.3  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 		 315 aa  48.9  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 653 aa  48.9  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>