148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0071 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0071  amine oxidase  100 
 
 		 452 aa  881    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0365942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2504  squalene-associated FAD-dependent desaturase  58.11 
 
 		 414 aa  433  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2965  amine oxidase  57.79 
 
 		 423 aa  422  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0856614  hitchhiker  0.00607749 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1201  amine oxidase  63.29 
 
 		 434 aa  424  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269087  normal  0.505468 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1120  squalene-associated FAD-dependent desaturase  63.01 
 
 		 422 aa  418  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.454747  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2016  amine oxidase  56.95 
 
 		 426 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1548  amine oxidase  57.5 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1455  amine oxidase  58.94 
 
 		 439 aa  402  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2571  squalene-associated FAD-dependent desaturase  53.57 
 
 		 462 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0585158 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1286  putative squalene/phytoene dehydrogenase  48.69 
 
 		 448 aa  316  6e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2550  squalene-associated FAD-dependent desaturase  48.87 
 
 		 432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005489 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  43.82 
 
 		 441 aa  251  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1470  amine oxidase  37.98 
 
 		 440 aa  227  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1698  putative squalene/phytoene dehydrogenase  41.78 
 
 		 424 aa  207  4e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  36.59 
 
 		 438 aa  189  7e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2707  amine oxidase  38.82 
 
 		 410 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0288942  hitchhiker  0.00000819833 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1513  squalene-associated FAD-dependent desaturase  34.91 
 
 		 444 aa  126  9e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.00817062 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0117  amine oxidase  29.78 
 
 		 410 aa  109  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  28.21 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1826  squalene-associated FAD-dependent desaturase  30 
 
 		 437 aa  94.7  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7145  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.11 
 
 		 438 aa  93.6  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5425  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.29 
 
 		 433 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1719  amine oxidase  28.1 
 
 		 418 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.188576  normal  0.0628779 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6348  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.1 
 
 		 424 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0839028  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.04 
 
 		 439 aa  80.9  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3155  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.68 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0063  amine oxidase  27.57 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3574  amine oxidase  27.21 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2219  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.46 
 
 		 433 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.698048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1943  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.46 
 
 		 433 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273475  normal  0.570646 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2968  putative phytoene dehydrogenase  25.43 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4555  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.11 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.160695 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1725  amine oxidase  25.71 
 
 		 418 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299467  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5179  amine oxidase  29.11 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5680  amine oxidase  29.11 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799558  hitchhiker  0.00195148 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5505  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.27 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342763  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1834  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.04 
 
 		 433 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4952  amine oxidase  28.66 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15769  normal  0.0932773 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0018  amine oxidase  28.9 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1695  amine oxidase  28.44 
 
 		 486 aa  62  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.916682  hitchhiker  0.0000276291 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2683  amine oxidase  23.97 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.446485  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3242  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.47 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.179321 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3174  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.71 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.724661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2270  amine oxidase  23.63 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.160101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  28.67 
 
 		 562 aa  57  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  28.26 
 
 		 453 aa  57  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0241  amine oxidase  27.68 
 
 		 508 aa  57  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  39.47 
 
 		 479 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  27.27 
 
 		 455 aa  55.8  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  26.71 
 
 		 481 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  39.47 
 
 		 483 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4516  amine oxidase  26.05 
 
 		 432 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  39.47 
 
 		 490 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  27.07 
 
 		 453 aa  55.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  39.47 
 
 		 490 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  39.47 
 
 		 489 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4138  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.39 
 
 		 425 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7028  squalene-associated FAD-dependent desaturase  29.91 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000526905 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  28.57 
 
 		 453 aa  55.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  38.16 
 
 		 479 aa  54.7  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0821  amine oxidase  29.11 
 
 		 569 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.147648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5461  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.52 
 
 		 419 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3090  putative beta-carotene desaturase/methylase  28.62 
 
 		 520 aa  54.3  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  27.91 
 
 		 484 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  27.13 
 
 		 484 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  32.31 
 
 		 478 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  30.77 
 
 		 486 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0011  hypothetical protein  27.19 
 
 		 422 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  27.91 
 
 		 484 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  29.32 
 
 		 453 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  27.82 
 
 		 453 aa  52.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  35.53 
 
 		 486 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  36.84 
 
 		 482 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  32.2 
 
 		 447 aa  50.8  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  26.72 
 
 		 453 aa  51.2  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  26.36 
 
 		 499 aa  50.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  43.9 
 
 		 456 aa  50.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  21.83 
 
 		 472 aa  50.4  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  28.36 
 
 		 462 aa  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  28.36 
 
 		 464 aa  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  35.79 
 
 		 452 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  35.79 
 
 		 452 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  35.79 
 
 		 452 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004467  glutamate synthase [NADPH] small chain  35.4 
 
 		 489 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2122  amine oxidase  25.66 
 
 		 465 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160745 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  29.77 
 
 		 488 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  29.77 
 
 		 488 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  21.4 
 
 		 647 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  27.91 
 
 		 591 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00927  glutamate synthase subunit beta  36.84 
 
 		 489 aa  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  29.68 
 
 		 420 aa  47.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  36.78 
 
 		 429 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4262  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.99 
 
 		 418 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5081  glucose-inhibited division protein A  42.86 
 
 		 381 aa  47.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.880262 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  26.87 
 
 		 475 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  33.73 
 
 		 451 aa  47.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7245  amine oxidase, flavin-containing  45.76 
 
 		 392 aa  47.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147229  normal  0.232939 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  26.87 
 
 		 475 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  29.23 
 
 		 477 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  23.14 
 
 		 552 aa  46.6  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>