More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0065 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2969  PfkB family kinase  53.64 
 
 
654 aa  673    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0726  iolC protein  55.21 
 
 
666 aa  645    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179784  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1892  ribokinase-like domain-containing protein  80.83 
 
 
651 aa  1031    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.333312 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1240  transferase kinase protein  79.85 
 
 
650 aa  1044    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3500  iolC protein  53.21 
 
 
645 aa  679    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.782212  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0913  iolC protein  55.21 
 
 
666 aa  645    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3274  carbohydrate kinase, PfkB  52.45 
 
 
645 aa  663    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0475711  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1831  iolC protein  55.21 
 
 
666 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.463805  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1341  PfkB domain protein  55.05 
 
 
634 aa  697    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4567  PfkB family carbohydrate kinase  80.37 
 
 
652 aa  1047    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4660  ribokinase-like domain-containing protein  52.8 
 
 
642 aa  643    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50040  myo-inositol catabolism protein IolC  53.82 
 
 
647 aa  689    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2996  Protein of unknown function DUF2090  54.43 
 
 
634 aa  687    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2647  iolC protein  55.34 
 
 
666 aa  662    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146165  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1870  PfkB family kinase  54.09 
 
 
625 aa  665    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0201058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2809  PfkB domain protein  51.78 
 
 
681 aa  666    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760381  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1677  iolC protein  55.21 
 
 
666 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1326  putative myo-inositol catabolism LolC protein  52.68 
 
 
680 aa  659    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3041  ribokinase-like domain-containing protein  53.8 
 
 
656 aa  675    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1600  ribokinase-like domain-containing protein  52.26 
 
 
670 aa  667    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161608  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0941  PfkB  80.68 
 
 
651 aa  1046    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00555431  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4711  PfkB domain protein  52.02 
 
 
643 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00995478  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0303  myo-inositol catabolism protein  51.4 
 
 
636 aa  660    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1303  ribokinase-like domain-containing protein  80.53 
 
 
651 aa  1043    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1401  ribokinase-like domain-containing protein  80.22 
 
 
651 aa  1040    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1423  ribokinase-like domain-containing protein  80.68 
 
 
651 aa  1046    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1342  ribokinase-like domain-containing protein  80.53 
 
 
651 aa  1044    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3314  ribokinase-like domain-containing protein  74.92 
 
 
646 aa  984    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0985  ribokinase-like domain-containing protein  61.85 
 
 
659 aa  793    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3334  PfkB domain protein  55.62 
 
 
647 aa  699    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1444  iolC protein  55.21 
 
 
666 aa  645    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0065  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
674 aa  1365    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0436  iolC protein  55.21 
 
 
666 aa  645    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1655  iolC protein  55.21 
 
 
666 aa  646    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1594  ribokinase-like domain-containing protein  46.96 
 
 
652 aa  612  9.999999999999999e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0076  myo-inositol catabolism IolC protein  47.3 
 
 
634 aa  549  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3837  ribokinase-like domain-containing protein  46.69 
 
 
633 aa  539  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27619  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  44.81 
 
 
645 aa  519  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  46.59 
 
 
636 aa  513  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  45.47 
 
 
646 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  45.65 
 
 
640 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  44.33 
 
 
642 aa  504  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3562  ribokinase-like domain-containing protein  43.72 
 
 
655 aa  504  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.249096 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  42.88 
 
 
644 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  46.06 
 
 
635 aa  493  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  42.75 
 
 
644 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3703  PfkB  39.63 
 
 
630 aa  419  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830468  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  47.35 
 
 
628 aa  316  9e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  47.35 
 
 
628 aa  313  4.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  36.23 
 
 
335 aa  206  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  32.94 
 
 
332 aa  196  9e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  32.94 
 
 
332 aa  196  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  32.94 
 
 
332 aa  196  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  32.94 
 
 
332 aa  194  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  32.36 
 
 
332 aa  187  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1697  PfkB domain-containing protein  36.03 
 
 
337 aa  187  7e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4016  ribokinase-like domain-containing protein  37.58 
 
 
322 aa  172  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0662  PfkB domain-containing protein  34.67 
 
 
327 aa  165  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  30.24 
 
 
338 aa  160  9e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5449  PfkB domain protein  37.23 
 
 
312 aa  157  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2602  ribokinase-like domain-containing protein  35.98 
 
 
323 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.386766  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3605  PfkB domain protein  35.49 
 
 
336 aa  151  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  28.03 
 
 
338 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4542  PfkB domain protein  34.06 
 
 
317 aa  148  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1803  ribokinase-like domain-containing protein  33.43 
 
 
349 aa  145  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.453248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0725  PfkB domain protein  35.84 
 
 
322 aa  143  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0820  ribokinase-like domain-containing protein  31.91 
 
 
364 aa  141  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1365  PfkB domain protein  35.67 
 
 
321 aa  138  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0937  PfkB domain protein  32.53 
 
 
338 aa  134  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3078  PfkB domain-containing protein  32.62 
 
 
314 aa  134  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3349  PfkB  29.64 
 
 
324 aa  134  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0814732  normal  0.201328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5563  ribokinase-like domain-containing protein  33.94 
 
 
320 aa  133  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  28.7 
 
 
333 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  31.98 
 
 
326 aa  131  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  33.23 
 
 
317 aa  130  9.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2742  PfkB domain protein  34.67 
 
 
320 aa  127  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4488  PfkB domain protein  33.95 
 
 
314 aa  127  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3303  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  26.67 
 
 
323 aa  125  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8494  ribokinase-like domain-containing protein  33.44 
 
 
321 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4059  PfkB domain protein  33.54 
 
 
325 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.867831 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1419  PfkB  28.15 
 
 
326 aa  117  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204315  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  30.27 
 
 
322 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  30.15 
 
 
317 aa  111  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  26.91 
 
 
323 aa  110  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  25.21 
 
 
320 aa  110  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  25.6 
 
 
322 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6848  PfkB domain protein  34.47 
 
 
323 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.71176  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2528  protein IolC  31.28 
 
 
207 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000240198 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  27.78 
 
 
325 aa  103  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  28.02 
 
 
323 aa  103  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  31.51 
 
 
314 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  27.33 
 
 
337 aa  102  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  27.91 
 
 
329 aa  101  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  28.65 
 
 
333 aa  101  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  26.76 
 
 
324 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  28.52 
 
 
311 aa  100  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  26.78 
 
 
333 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  28.12 
 
 
306 aa  100  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  25.79 
 
 
319 aa  97.8  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  30.03 
 
 
306 aa  96.7  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>