More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0062 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0062  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  681    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0983  hypothetical protein  74.69 
 
 
339 aa  454  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  52.35 
 
 
338 aa  333  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  52.63 
 
 
325 aa  324  1e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  50.79 
 
 
324 aa  320  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  47.85 
 
 
324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  49.84 
 
 
325 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  49.02 
 
 
324 aa  308  5.9999999999999995e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2999  hypothetical protein  46.49 
 
 
324 aa  300  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.272534 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  47.16 
 
 
334 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0450  hypothetical protein  50 
 
 
322 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.697568  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  46.03 
 
 
344 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0441  hypothetical protein  49.66 
 
 
322 aa  280  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0368157  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  42.9 
 
 
319 aa  280  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4931  extra-cytoplasmic solute receptor  43.83 
 
 
330 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5277  hypothetical protein  46.18 
 
 
327 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  41.96 
 
 
331 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  47.3 
 
 
351 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  45.3 
 
 
328 aa  276  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43.93 
 
 
330 aa  273  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  44.88 
 
 
334 aa  268  8e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1021  hypothetical protein  44.48 
 
 
323 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.345353  normal  0.559311 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  42.64 
 
 
339 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.28 
 
 
330 aa  263  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42.28 
 
 
330 aa  264  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0688  hypothetical protein  44.97 
 
 
326 aa  263  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.502545  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  44.63 
 
 
328 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  42.01 
 
 
328 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3347  hypothetical protein  41.36 
 
 
330 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261888  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  43.17 
 
 
339 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  44.06 
 
 
322 aa  259  4e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  45.7 
 
 
353 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  44.66 
 
 
320 aa  258  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  42.62 
 
 
339 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  45.7 
 
 
328 aa  257  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.95 
 
 
328 aa  257  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  41.95 
 
 
328 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  42.9 
 
 
333 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  42.64 
 
 
332 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  42.04 
 
 
314 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3597  hypothetical protein  43.12 
 
 
323 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  41.64 
 
 
327 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  42.59 
 
 
323 aa  256  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  43.05 
 
 
349 aa  255  6e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  43.62 
 
 
324 aa  255  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  41.69 
 
 
322 aa  255  9e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  43.62 
 
 
326 aa  255  9e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  40.92 
 
 
356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  42.57 
 
 
322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  45.15 
 
 
334 aa  252  7e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  42.47 
 
 
334 aa  252  8.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  42.28 
 
 
338 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1522  hypothetical protein  42.27 
 
 
326 aa  251  9.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.5354  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  42.62 
 
 
325 aa  251  9.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  45.13 
 
 
334 aa  250  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  43.42 
 
 
322 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  42.19 
 
 
325 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  46.31 
 
 
386 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  43.26 
 
 
335 aa  250  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  42.52 
 
 
327 aa  250  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  43.31 
 
 
326 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  42.67 
 
 
328 aa  251  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  42.58 
 
 
339 aa  250  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  41.02 
 
 
344 aa  249  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  41.97 
 
 
310 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  41.23 
 
 
322 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  41.61 
 
 
348 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  41.07 
 
 
343 aa  249  6e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  41.95 
 
 
322 aa  249  7e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  45.7 
 
 
356 aa  249  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  40.24 
 
 
328 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  42.23 
 
 
324 aa  248  8e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  42.73 
 
 
330 aa  248  9e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  42.73 
 
 
330 aa  248  9e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0578  hypothetical protein  40.88 
 
 
327 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  41.81 
 
 
324 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  43.08 
 
 
326 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  39.88 
 
 
335 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  45.1 
 
 
325 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0902  hypothetical protein  41.61 
 
 
320 aa  247  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  42.31 
 
 
339 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0987  hypothetical protein  41.61 
 
 
320 aa  247  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  40.32 
 
 
318 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  41.01 
 
 
339 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2205  hypothetical protein  41.46 
 
 
324 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0725118 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  41.28 
 
 
343 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  41.64 
 
 
353 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  42.47 
 
 
336 aa  246  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  40.56 
 
 
331 aa  245  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  42.63 
 
 
325 aa  246  6e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  41.09 
 
 
346 aa  245  9e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  40.84 
 
 
326 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  37.95 
 
 
332 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  39.88 
 
 
330 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  41.69 
 
 
323 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  39.14 
 
 
336 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  40.67 
 
 
355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  43.4 
 
 
332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  40.19 
 
 
320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1270  hypothetical protein  43.65 
 
 
323 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>