More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0058 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0058  ABC transporter related  100 
 
 
266 aa  544  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2408  ABC transporter-related protein  83.78 
 
 
267 aa  450  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  71.75 
 
 
266 aa  391  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3341  ABC transporter related  72.66 
 
 
262 aa  382  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00439567  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  72.27 
 
 
264 aa  375  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  67.97 
 
 
259 aa  359  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  67.58 
 
 
259 aa  358  7e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  67.97 
 
 
262 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  65.04 
 
 
266 aa  355  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  62.69 
 
 
282 aa  340  1e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  60.24 
 
 
262 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  56.97 
 
 
265 aa  316  3e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  59.27 
 
 
280 aa  315  5e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  57.71 
 
 
264 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.12 
 
 
266 aa  293  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  52.51 
 
 
288 aa  293  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  52.33 
 
 
267 aa  292  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  51.91 
 
 
278 aa  292  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.73 
 
 
266 aa  291  7e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.73 
 
 
266 aa  291  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.73 
 
 
266 aa  291  7e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.73 
 
 
266 aa  291  7e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.73 
 
 
266 aa  291  7e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.73 
 
 
266 aa  291  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.73 
 
 
266 aa  291  7e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  58.3 
 
 
260 aa  290  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4494  ABC transporter related  59.92 
 
 
316 aa  287  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00159832  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4037  ABC transporter related protein  57.89 
 
 
301 aa  286  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4052  ABC transporter related  53.91 
 
 
282 aa  284  8e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146234  normal  0.303462 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0832  ABC transporter related  53.6 
 
 
305 aa  278  5e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0378548  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0115  ABC transporter related  53.91 
 
 
315 aa  273  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2770  ABC transporter related protein  53.17 
 
 
271 aa  272  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1808  ABC transporter related  57.2 
 
 
294 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.976965 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2473  ABC transporter related protein  51.98 
 
 
258 aa  271  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200808  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  55.51 
 
 
255 aa  269  4e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4535  ABC transporter related  51.95 
 
 
274 aa  268  7e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3600  ABC transporter related protein  52.38 
 
 
289 aa  265  4e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1360  ABC transporter related protein  50.97 
 
 
269 aa  262  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2607  ABC transporter related  49.6 
 
 
274 aa  247  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4009  ABC transporter-related protein  49.21 
 
 
274 aa  246  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2316  ABC transporter related  50.2 
 
 
267 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.573379  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0654  ABC transporter related protein  47.45 
 
 
267 aa  241  7e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  45.9 
 
 
259 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0047  ABC transporter related  45.87 
 
 
247 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  44.9 
 
 
244 aa  199  5e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  43.02 
 
 
260 aa  199  6e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  44.78 
 
 
273 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  42.45 
 
 
250 aa  193  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.29 
 
 
265 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  43.29 
 
 
265 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  43.16 
 
 
260 aa  191  9e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  41.46 
 
 
271 aa  191  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  40.74 
 
 
249 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  44.35 
 
 
276 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  39.83 
 
 
243 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  43.16 
 
 
273 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  42.21 
 
 
262 aa  188  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.25 
 
 
288 aa  187  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  41.3 
 
 
265 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  40.16 
 
 
260 aa  186  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  39.45 
 
 
254 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.69 
 
 
286 aa  185  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5243  ABC transporter related  40.85 
 
 
245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  40.08 
 
 
263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  40.4 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  40.16 
 
 
271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  37.86 
 
 
261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  37.7 
 
 
497 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  41.67 
 
 
259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  40.08 
 
 
261 aa  183  3e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.49 
 
 
265 aa  182  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  38.13 
 
 
313 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  42.25 
 
 
278 aa  183  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  39.27 
 
 
266 aa  183  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  42.29 
 
 
277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  39.92 
 
 
266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  40.48 
 
 
254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.34 
 
 
517 aa  182  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  41.77 
 
 
261 aa  181  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2043  ABC transporter related  41.13 
 
 
255 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.332554  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  38.37 
 
 
257 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  42.24 
 
 
266 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  39.34 
 
 
283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  39.36 
 
 
285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  39.75 
 
 
253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  38.8 
 
 
519 aa  179  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  39.06 
 
 
284 aa  179  4.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  40.09 
 
 
499 aa  178  5.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  41.49 
 
 
254 aa  178  7e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  38.93 
 
 
261 aa  178  8e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0147  ABC transporter related  37.74 
 
 
294 aa  178  8e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  35.55 
 
 
524 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  35.55 
 
 
524 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  37.71 
 
 
245 aa  177  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  38.37 
 
 
258 aa  178  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  37.13 
 
 
265 aa  177  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0914  ABC transporter related  40.42 
 
 
240 aa  177  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2238  ABC transporter related  38.98 
 
 
504 aa  176  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  41.15 
 
 
265 aa  176  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  35.55 
 
 
524 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>