More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0046 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0046  inner-membrane translocator  100 
 
 		 348 aa  672    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2691  Monosaccharide-transporting ATPase  43.08 
 
 		 344 aa  193  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1209  inner-membrane translocator  39.24 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.759802  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4053  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364977  normal  0.563025 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1720  inner-membrane translocator  39.38 
 
 		 340 aa  187  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0384708  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6850  Monosaccharide-transporting ATPase  39.94 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.414348  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1712  inner-membrane translocator  37.77 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4850  Monosaccharide-transporting ATPase  37.25 
 
 		 373 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.170033  normal  0.0438131 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2317  inner-membrane translocator  38.01 
 
 		 355 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2042  monosaccharide-transporting ATPase  39.04 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0809219  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1591  monosaccharide-transporting ATPase  36.47 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1692  inner-membrane translocator  38.84 
 
 		 344 aa  178  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0800814  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0831  inner-membrane translocator  38.35 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.931772  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5292  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 373 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2472  Monosaccharide-transporting ATPase  39.94 
 
 		 347 aa  176  6e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290998  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3342  inner-membrane translocator  34.09 
 
 		 373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000671432  normal  0.193395 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2409  monosaccharide-transporting ATPase  37.39 
 
 		 373 aa  172  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.512815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4036  inner-membrane translocator  39.43 
 
 		 342 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  0.036893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1359  inner-membrane translocator  36.28 
 
 		 352 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3601  inner-membrane translocator  35.45 
 
 		 352 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0114  inner-membrane translocator  38.63 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2606  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 352 aa  170  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.7123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1275  monosaccharide-transporting ATPase  33.52 
 
 		 374 aa  170  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0850984  normal  0.367155 
 
 
-
 
NC_004310  BR1340  sugar ABC transporter, permease protein  36.05 
 
 		 375 aa  168  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.572384  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1832  monosaccharide-transporting ATPase  35.47 
 
 		 376 aa  168  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1300  sugar ABC transporter, permease protein  36.05 
 
 		 375 aa  168  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4010  inner-membrane translocator  33.82 
 
 		 352 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310882  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2411  Monosaccharide-transporting ATPase  37.26 
 
 		 391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2771  inner-membrane translocator  37.38 
 
 		 353 aa  164  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1426  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 406 aa  162  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000154609  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0915  sugar ABC transporter, permease protein, putative  37.57 
 
 		 374 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282258  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1833  permease protein of sugar ABC transporter  37.57 
 
 		 381 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2645  sugar ABC transporter, permease protein  37.29 
 
 		 381 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0405275  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1446  carbohydrate ABC transporter permease  37.57 
 
 		 381 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0434  carbohydrate ABC transporter permease  37.57 
 
 		 381 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0869397  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1657  carbohydrate ABC transporter permease  37.57 
 
 		 381 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499153  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1679  carbohydrate ABC transporter permease  37.57 
 
 		 381 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0728  carbohydrate ABC transporter permease  37.57 
 
 		 381 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0655  inner-membrane translocator  34.7 
 
 		 350 aa  159  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1807  inner-membrane translocator  34.65 
 
 		 352 aa  159  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4493  Monosaccharide-transporting ATPase  36.47 
 
 		 377 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1598  monosaccharide-transporting ATPase  36.67 
 
 		 385 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4536  inner-membrane translocator  38.3 
 
 		 357 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0059  inner-membrane translocator  36.15 
 
 		 385 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2807  Monosaccharide-transporting ATPase  36.46 
 
 		 385 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0259687  normal  0.476656 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  34.83 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5834  monosaccharide-transporting ATPase  36.45 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  35.54 
 
 		 328 aa  153  5e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1328  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.34 
 
 		 385 aa  152  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  35.06 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0845  Monosaccharide-transporting ATPase  35.31 
 
 		 320 aa  149  9e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.102065  normal  0.0278084 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  35.26 
 
 		 317 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  35.76 
 
 		 336 aa  145  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  34.78 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3462  monosaccharide-transporting ATPase  33.23 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  33.88 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  35.93 
 
 		 334 aa  142  6e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  36.43 
 
 		 342 aa  142  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  36.43 
 
 		 342 aa  142  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  34.74 
 
 		 353 aa  142  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  34.74 
 
 		 353 aa  142  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  33.87 
 
 		 342 aa  142  9e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  36.4 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1889  inner-membrane translocator  34.24 
 
 		 347 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2222  monosaccharide-transporting ATPase  36.67 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.294 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  33.88 
 
 		 348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1036  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.19 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0147412  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  36.15 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  33.68 
 
 		 322 aa  140  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  34.98 
 
 		 358 aa  139  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5683  Monosaccharide-transporting ATPase  33.87 
 
 		 352 aa  139  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.795031 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6226  Monosaccharide-transporting ATPase  32.13 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  33.87 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1265  inner-membrane translocator  36.65 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00281697  decreased coverage  0.000195243 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0945  Monosaccharide-transporting ATPase  35.5 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0035821  normal  0.067207 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  35.64 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  34.74 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2883  inner-membrane translocator  37.93 
 
 		 348 aa  137  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.797919 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  34.36 
 
 		 306 aa  137  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  33.99 
 
 		 347 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3057  inner-membrane translocator  37.06 
 
 		 328 aa  136  7.000000000000001e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0880  Monosaccharide-transporting ATPase  35.18 
 
 		 335 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0333312  normal  0.303688 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 345 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 328 aa  135  9e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.99 
 
 		 345 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  34.94 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  33.23 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  33.99 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3431  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.117225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  32.57 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  34.71 
 
 		 345 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 345 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 345 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  34.21 
 
 		 334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  32.39 
 
 		 322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0504  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 357 aa  133  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  34.21 
 
 		 334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>