More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0044 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0044  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
493 aa  1010    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  47.67 
 
 
501 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
496 aa  344  2e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.5 
 
 
495 aa  317  3e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  40.09 
 
 
497 aa  316  8e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.61 
 
 
501 aa  315  8e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.04 
 
 
497 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  41.06 
 
 
492 aa  312  6.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4112  transcriptional regulator  39.32 
 
 
495 aa  309  9e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  39.87 
 
 
499 aa  303  4.0000000000000003e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0423  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.38 
 
 
494 aa  302  9e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6170  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.09 
 
 
523 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  38.54 
 
 
509 aa  300  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  37.45 
 
 
501 aa  298  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  37.42 
 
 
509 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  37.45 
 
 
501 aa  297  3e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5345  transcriptional regulator  38.4 
 
 
506 aa  297  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0493543 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.88 
 
 
501 aa  296  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  37.42 
 
 
569 aa  296  7e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  40.34 
 
 
488 aa  296  8e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
501 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
501 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  37.45 
 
 
506 aa  293  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  37.45 
 
 
506 aa  293  5e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  38.72 
 
 
507 aa  293  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
490 aa  292  8e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  37.45 
 
 
506 aa  292  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  38.4 
 
 
503 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
506 aa  291  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
506 aa  291  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  37.89 
 
 
504 aa  289  7e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3858  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.83 
 
 
491 aa  285  9e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
506 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3403  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.58 
 
 
489 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  38.12 
 
 
502 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  37.55 
 
 
492 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.55 
 
 
515 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  37.92 
 
 
502 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.04 
 
 
507 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  37.87 
 
 
507 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  37.87 
 
 
507 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  37.87 
 
 
507 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
503 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
492 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  36.76 
 
 
511 aa  282  9e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  37.95 
 
 
502 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 
502 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
507 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  36.04 
 
 
520 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  37.5 
 
 
507 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 
502 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2202  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
488 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  35.6 
 
 
513 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1108  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
492 aa  280  3e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5427  transcriptional regulator  36.13 
 
 
490 aa  280  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491975  normal  0.163691 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2866  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
492 aa  279  8e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156549  normal  0.161976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
492 aa  279  8e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3119  transcription regulator protein  39.66 
 
 
488 aa  278  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  36.4 
 
 
523 aa  278  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  36.91 
 
 
475 aa  278  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  36.82 
 
 
476 aa  277  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.63 
 
 
503 aa  276  4e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
492 aa  276  5e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4413  transcriptional regulator  39.54 
 
 
490 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336861  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4136  transcriptional regulator  40.38 
 
 
515 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.53433  normal  0.112546 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.96 
 
 
485 aa  274  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  34.82 
 
 
485 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1071  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 
511 aa  272  9e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.030835  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  36 
 
 
561 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1398  GntR family transcriptional regulator  39.96 
 
 
502 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.309369  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 
546 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 
485 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 
564 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0133  GntR family transcriptional regulator  39.96 
 
 
502 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1480  GntR family transcriptional regulator  39.96 
 
 
502 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
470 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0515  GntR family transcriptional regulator  39.96 
 
 
498 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  37.45 
 
 
495 aa  271  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 
564 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.6 
 
 
485 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0988  transcriptional regulator  39.96 
 
 
502 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
485 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0937  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
486 aa  270  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.34 
 
 
485 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  35.39 
 
 
521 aa  269  7e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.34 
 
 
472 aa  269  8.999999999999999e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3950  GntR family transcriptional regulator  39.3 
 
 
515 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115894  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
487 aa  268  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5786  transcriptional regulator  38.93 
 
 
492 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.61313  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5048  transcriptional regulator  38.76 
 
 
502 aa  266  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.528927 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4478  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
488 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728897  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3639  transcriptional regulator  36.23 
 
 
488 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3888  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
488 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  34.87 
 
 
475 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5851  transcriptional regulator  35.88 
 
 
520 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475987  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 
504 aa  266  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
503 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05334  transcriptional regulator  34.47 
 
 
470 aa  265  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1330  GntR family transcriptional regulator  39.3 
 
 
490 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0661  transcriptional regulator  40.55 
 
 
513 aa  265  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>