More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0038 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  655  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5830  hypothetical protein  68.92 
 
 
339 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  60 
 
 
339 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  53.42 
 
 
310 aa  321  1e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  47.69 
 
 
333 aa  311  7e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  47.68 
 
 
328 aa  291  8e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  47.68 
 
 
328 aa  291  9e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  46.42 
 
 
328 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6260  hypothetical protein  48.77 
 
 
332 aa  285  6e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  46.48 
 
 
336 aa  285  8e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  42.95 
 
 
330 aa  283  4e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  44.26 
 
 
324 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  44.33 
 
 
356 aa  276  5e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  47.57 
 
 
333 aa  275  8e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  44.48 
 
 
353 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  44.07 
 
 
328 aa  273  4e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  47.18 
 
 
327 aa  272  5e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  47.18 
 
 
325 aa  272  6e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  46.49 
 
 
339 aa  271  8e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  45.36 
 
 
326 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  46.28 
 
 
335 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  43.87 
 
 
322 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  47.88 
 
 
333 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  42.62 
 
 
335 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  43.71 
 
 
325 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.38 
 
 
330 aa  267  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  44.87 
 
 
318 aa  266  3e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42.19 
 
 
330 aa  266  3e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  43.48 
 
 
348 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  45.18 
 
 
327 aa  266  4e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  45.25 
 
 
304 aa  266  4e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  45.85 
 
 
322 aa  265  7e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  43.46 
 
 
326 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  3.51886e-10  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  42.27 
 
 
328 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  42.14 
 
 
318 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  44.67 
 
 
328 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  44.04 
 
 
331 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  43.48 
 
 
355 aa  262  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  42.49 
 
 
322 aa  261  9e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  43.48 
 
 
339 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  43.11 
 
 
344 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  43.56 
 
 
323 aa  260  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  41.77 
 
 
333 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  44.48 
 
 
325 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  44.67 
 
 
324 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  45.39 
 
 
333 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  44.34 
 
 
358 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0625  hypothetical protein  49.82 
 
 
276 aa  259  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.545238  normal  0.474322 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.01 
 
 
327 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  43.85 
 
 
335 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  45.36 
 
 
330 aa  259  5e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  45.36 
 
 
330 aa  259  5e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  44.48 
 
 
327 aa  259  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  45.95 
 
 
349 aa  258  7e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  39.69 
 
 
330 aa  258  8e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  43.87 
 
 
360 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  44.05 
 
 
345 aa  258  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  42.95 
 
 
356 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  44.05 
 
 
345 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43.33 
 
 
330 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  42.35 
 
 
326 aa  257  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  41.23 
 
 
332 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  45 
 
 
325 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  43.4 
 
 
339 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  44.62 
 
 
339 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  44.48 
 
 
324 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  41.88 
 
 
323 aa  256  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  41.32 
 
 
330 aa  255  8e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  41.49 
 
 
328 aa  255  8e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  45.9 
 
 
321 aa  255  8e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  44.79 
 
 
334 aa  254  1e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.18374e-05 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  42.12 
 
 
333 aa  253  2e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  40.94 
 
 
335 aa  254  2e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  41.36 
 
 
325 aa  254  2e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  40.67 
 
 
331 aa  253  4e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  43.05 
 
 
324 aa  253  4e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  40.67 
 
 
331 aa  252  5e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  45.15 
 
 
322 aa  252  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  42.14 
 
 
337 aa  252  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  44.37 
 
 
324 aa  252  7e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  44.88 
 
 
327 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  47.3 
 
 
325 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  43.17 
 
 
326 aa  250  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  40.9 
 
 
336 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  44.15 
 
 
323 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  43.48 
 
 
322 aa  250  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  44.63 
 
 
331 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  41.77 
 
 
324 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  44.78 
 
 
314 aa  249  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  42.19 
 
 
330 aa  248  8e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  41.88 
 
 
338 aa  248  9e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  40.81 
 
 
322 aa  248  9e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  42.05 
 
 
328 aa  248  9e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  40.8 
 
 
326 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  43.29 
 
 
337 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  42.81 
 
 
338 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  42.52 
 
 
321 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  44.48 
 
 
328 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  39.76 
 
 
325 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  42.14 
 
 
337 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>