More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6284 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6284  NAD+ synthetase  100 
 
 		 566 aa  1144    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000396806  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5607  NAD+ synthetase  70.27 
 
 		 566 aa  720    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44805 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0975  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  70.8 
 
 		 566 aa  759    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.212633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3718  NAD+ synthetase  76.99 
 
 		 566 aa  861    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0770195  normal  0.014642 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2312  NAD+ synthetase  44.5 
 
 		 571 aa  421  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.589478  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  40.59 
 
 		 566 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3217  NAD+ synthetase  40.77 
 
 		 557 aa  413  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0411  NAD+ synthetase  39.22 
 
 		 546 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.172115 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  40.21 
 
 		 561 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  40.03 
 
 		 561 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  39.9 
 
 		 561 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2091  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  43.3 
 
 		 550 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3032  NAD synthetase  39.72 
 
 		 561 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  42.98 
 
 		 567 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0217  NAD+ synthetase  40.84 
 
 		 554 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2180  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  42.39 
 
 		 561 aa  404  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.432565 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  38.73 
 
 		 543 aa  402  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2239  NAD synthetase  44.08 
 
 		 558 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.572998 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  42.15 
 
 		 540 aa  401  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2524  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  40.77 
 
 		 556 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.421348 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0290  NAD synthetase  38.97 
 
 		 560 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.950907 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  44.64 
 
 		 543 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  40.04 
 
 		 567 aa  397  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15651  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  39.01 
 
 		 576 aa  395  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.873266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1984  NAD synthetase  38.59 
 
 		 584 aa  393  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187378  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  38.91 
 
 		 566 aa  391  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0495  NAD+ synthase  40.83 
 
 		 558 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  41.25 
 
 		 577 aa  392  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  38.74 
 
 		 566 aa  389  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0426  NAD+ synthetase  39.86 
 
 		 548 aa  388  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.277898  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1036  NAD+ synthetase  40.48 
 
 		 558 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  43.08 
 
 		 556 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  41.98 
 
 		 554 aa  385  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  36.42 
 
 		 574 aa  385  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0105  NAD synthetase  41.54 
 
 		 574 aa  384  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.1435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0572  NAD+ synthetase  40.92 
 
 		 552 aa  385  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.323116  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  38.29 
 
 		 566 aa  382  1e-105  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0449  NAD+ synthetase  41.28 
 
 		 556 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.270974 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04891  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  41.51 
 
 		 564 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  40.75 
 
 		 540 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  40.57 
 
 		 540 aa  379  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  40.75 
 
 		 540 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  39.61 
 
 		 542 aa  376  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4875  NAD+ synthetase  42.18 
 
 		 559 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0223  NAD+ synthetase  38.07 
 
 		 540 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  41.37 
 
 		 543 aa  376  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3277  NAD+ synthetase  39.55 
 
 		 554 aa  376  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16251  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  35.56 
 
 		 565 aa  378  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  39.5 
 
 		 540 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  38.38 
 
 		 583 aa  373  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16481  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  35.04 
 
 		 565 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  39.02 
 
 		 564 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  40.28 
 
 		 561 aa  372  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  40.64 
 
 		 535 aa  374  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  39.43 
 
 		 542 aa  372  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1524  NAD+ synthetase  39.66 
 
 		 559 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14105 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  40.11 
 
 		 545 aa  372  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  40.35 
 
 		 545 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0977  NAD+ synthase  37.58 
 
 		 569 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  38.03 
 
 		 545 aa  370  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1539  NAD+ synthetase  34.36 
 
 		 565 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18451  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  37.52 
 
 		 569 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.522379 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0307  NAD+ synthetase  43.06 
 
 		 569 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.770204  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  39.82 
 
 		 545 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  39.4 
 
 		 538 aa  368  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0285  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  43.33 
 
 		 569 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.210766  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  38.91 
 
 		 552 aa  366  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  40.41 
 
 		 577 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16361  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  34.87 
 
 		 565 aa  369  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3756  NAD+ synthetase  38.26 
 
 		 573 aa  365  1e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  41.58 
 
 		 546 aa  364  2e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  37.37 
 
 		 576 aa  362  1e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0296  NAD+ synthetase  44.04 
 
 		 569 aa  362  1e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2113  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  39.65 
 
 		 559 aa  362  1e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  37.21 
 
 		 576 aa  361  2e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  40.28 
 
 		 554 aa  360  3e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  40.11 
 
 		 554 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1117  NAD synthetase  38.29 
 
 		 566 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  39.72 
 
 		 550 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1566  NAD synthetase  39.06 
 
 		 560 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175024  normal  0.0652771 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  39.29 
 
 		 539 aa  357  3.9999999999999996e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  37.66 
 
 		 567 aa  357  3.9999999999999996e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  40.64 
 
 		 541 aa  357  3.9999999999999996e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  39.25 
 
 		 539 aa  356  5e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  39.37 
 
 		 546 aa  356  5.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  37.5 
 
 		 567 aa  355  1e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3162  NAD synthetase  40.67 
 
 		 544 aa  355  1e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0246  NAD+ synthetase  40.84 
 
 		 571 aa  355  1e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126728  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  41.19 
 
 		 539 aa  354  2e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1015  NAD synthetase  38.47 
 
 		 550 aa  351  2e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.52427  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0981  NAD synthetase  38.47 
 
 		 550 aa  351  2e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  35.4 
 
 		 573 aa  350  3e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  40.66 
 
 		 583 aa  351  3e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0606  NAD synthetase  37.32 
 
 		 560 aa  350  4e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.298865  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2968  NAD+ synthetase  38.75 
 
 		 577 aa  350  5e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  38.94 
 
 		 591 aa  349  6e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1242  NAD synthetase  38.97 
 
 		 566 aa  349  7e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3396  NAD synthetase  38.04 
 
 		 562 aa  349  7e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1089  NAD synthetase  38.97 
 
 		 566 aa  349  7e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34657  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2097  NAD synthetase  37.91 
 
 		 559 aa  349  8e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>