17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6282 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012792  Vapar_6282  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  582  1e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  8.83359e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3720  hypothetical protein  72.13 
 
 
293 aa  428  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  2.74124e-05  normal  0.0114353 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0702  hypothetical protein  64.66 
 
 
298 aa  364  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0635237 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0680  hypothetical protein  64.66 
 
 
285 aa  364  1e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0977  hypothetical protein  64.84 
 
 
288 aa  360  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32556  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5605  hypothetical protein  58.42 
 
 
324 aa  322  6e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.748883 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2359  hypothetical protein  47.72 
 
 
290 aa  244  2e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.367222  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5614  hypothetical protein  38.96 
 
 
261 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3863  hypothetical protein  37.36 
 
 
264 aa  164  1e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.725536 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49545  predicted protein  34.87 
 
 
300 aa  159  7e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2254  hypothetical protein  33.09 
 
 
345 aa  123  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108398  normal  0.210374 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1629  nicotinamidase  25.91 
 
 
300 aa  122  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.75318e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2210  hypothetical protein  32.66 
 
 
348 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.22069 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0304  hypothetical protein  31 
 
 
345 aa  117  2e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0347012  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2694  hypothetical protein  29.57 
 
 
353 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1379  nicotinamidase  26 
 
 
298 aa  104  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2409  hypothetical protein  32.79 
 
 
340 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000136883  hitchhiker  1.84258e-06 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>