More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6278 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  647    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  63.88 
 
 		 327 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  63.88 
 
 		 325 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  59.19 
 
 		 328 aa  397  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  59.87 
 
 		 304 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  60.26 
 
 		 333 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  62.93 
 
 		 325 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  52.47 
 
 		 336 aa  322  4e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  51.01 
 
 		 330 aa  316  3e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  51.01 
 
 		 330 aa  316  3e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  50.83 
 
 		 325 aa  315  5e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  49.35 
 
 		 330 aa  315  7e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  51.17 
 
 		 324 aa  315  8e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  49.66 
 
 		 327 aa  314  9.999999999999999e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  49.67 
 
 		 330 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  48.46 
 
 		 327 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  47.85 
 
 		 330 aa  308  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  49.66 
 
 		 349 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  49.68 
 
 		 328 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  50.31 
 
 		 339 aa  300  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  47.69 
 
 		 336 aa  299  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  49.38 
 
 		 335 aa  295  6e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  49.84 
 
 		 360 aa  295  6e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  48.04 
 
 		 335 aa  295  7e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  47.32 
 
 		 331 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  47.02 
 
 		 320 aa  293  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  49.55 
 
 		 331 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  43.96 
 
 		 331 aa  288  7e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  50.52 
 
 		 335 aa  288  9e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  43.96 
 
 		 331 aa  288  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  47.57 
 
 		 330 aa  287  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  47 
 
 		 326 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  47.65 
 
 		 331 aa  286  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  46.42 
 
 		 328 aa  287  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  49.17 
 
 		 328 aa  287  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  45.74 
 
 		 327 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  46.25 
 
 		 328 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  49.51 
 
 		 344 aa  287  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  49.54 
 
 		 334 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  44.48 
 
 		 325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  47.65 
 
 		 328 aa  286  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  46.11 
 
 		 328 aa  285  9e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  47.9 
 
 		 345 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  47.9 
 
 		 345 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  48.52 
 
 		 322 aa  284  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  44.38 
 
 		 330 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  48.78 
 
 		 339 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  44.72 
 
 		 346 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  46.25 
 
 		 358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  44.33 
 
 		 335 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  46.45 
 
 		 328 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  46.65 
 
 		 314 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  46.32 
 
 		 326 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  49.02 
 
 		 333 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  48.37 
 
 		 339 aa  281  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  45.48 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  47.99 
 
 		 328 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  47.99 
 
 		 324 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  45.34 
 
 		 324 aa  278  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  46.18 
 
 		 323 aa  278  9e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  50.65 
 
 		 330 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  43.73 
 
 		 329 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  50 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  46.49 
 
 		 318 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2834  hypothetical protein  47.85 
 
 		 327 aa  276  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421115  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  47.67 
 
 		 334 aa  276  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  44.98 
 
 		 326 aa  276  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  46.03 
 
 		 327 aa  275  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  46.18 
 
 		 326 aa  276  5e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  44.1 
 
 		 334 aa  275  8e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  46.86 
 
 		 325 aa  275  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  45.45 
 
 		 339 aa  275  8e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  46.15 
 
 		 328 aa  275  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  44.9 
 
 		 337 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  46.49 
 
 		 324 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  48.51 
 
 		 333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  46.2 
 
 		 335 aa  273  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  46.13 
 
 		 322 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  44.12 
 
 		 333 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  45.98 
 
 		 318 aa  272  6e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  43.19 
 
 		 332 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  47.31 
 
 		 343 aa  271  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  40.99 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  48.83 
 
 		 323 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  46.51 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  44.41 
 
 		 323 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  43.93 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  45.55 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  43.41 
 
 		 331 aa  269  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  41.43 
 
 		 322 aa  269  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1918  hypothetical protein  43.04 
 
 		 333 aa  268  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  46.03 
 
 		 332 aa  268  7e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  46.23 
 
 		 334 aa  268  7e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  44.38 
 
 		 331 aa  268  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  44.55 
 
 		 330 aa  268  8.999999999999999e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  45.03 
 
 		 331 aa  268  8.999999999999999e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  45.45 
 
 		 322 aa  268  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  44.06 
 
 		 337 aa  268  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  46.13 
 
 		 353 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  47.65 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>