107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6228 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6228  putative esterase  100 
 
 		 273 aa  552  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.226912  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0882  putative esterase  56.67 
 
 		 323 aa  275  6e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2868  cysteine synthase A  29.7 
 
 		 309 aa  68.6  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.965819  normal  0.710891 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3719  putative esterase  28.29 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0696  putative esterase  31.88 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.665195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0827  putative esterase  33.55 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4516  putative esterase  25.82 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0711  putative esterase  29.81 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000350604  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1825  putative esterase  30.95 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  normal  0.167809 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2146  putative esterase  29.63 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1658  putative esterase  28.79 
 
 		 430 aa  59.7  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.125907  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1666  putative esterase  26.1 
 
 		 445 aa  58.9  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0598325  normal  0.0397493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3791  putative esterase  30.22 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3796  putative esterase  25 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0619  putative esterase  28.65 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  30.95 
 
 		 640 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4495  putative esterase  26.19 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0079  putative esterase  24.9 
 
 		 324 aa  57  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2182  putative esterase  26.27 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000263766  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3111  putative esterase  28.42 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.597643  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2064  alpha/beta fold family hydrolase  31.94 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685345 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4960  putative esterase  26.29 
 
 		 420 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1112  putative esterase  29.32 
 
 		 409 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291043  normal  0.610364 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6036  putative esterase  34.39 
 
 		 404 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000538936  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2988  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  26.78 
 
 		 374 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000107918 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0242  putative esterase  27.38 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3395  alpha/beta fold family hydrolase  30.43 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.981621  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3025  hypothetical protein  29.48 
 
 		 330 aa  53.9  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2707  putative esterase  27.64 
 
 		 285 aa  53.1  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.427697 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1514  putative esterase  28.18 
 
 		 351 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00321061  normal  0.816657 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1265  putative esterase  29.73 
 
 		 287 aa  53.1  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2437  putative esterase  29.59 
 
 		 462 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.580514  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0079  hypothetical protein  23.26 
 
 		 298 aa  52.8  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0868984  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2349  putative esterase  29.59 
 
 		 460 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.705233  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2144  putative esterase  27.44 
 
 		 400 aa  52.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536761  normal  0.363467 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4870  putative esterase  26.29 
 
 		 335 aa  52.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533976  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4375  putative esterase  29.93 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.649215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3833  IroE protein  30.14 
 
 		 272 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.934207  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1518  putative esterase  29.59 
 
 		 442 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1979  IroE protein  28.82 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2741  putative esterase  30.95 
 
 		 318 aa  50.4  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3040  putative esterase  28.4 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91008 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2821  putative esterase  32.26 
 
 		 384 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000598865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1192  putative esterase  26.62 
 
 		 329 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00663281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3491  esterase  30.82 
 
 		 275 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.254505  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2085  putative esterase  25.73 
 
 		 423 aa  50.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1473  putative esterase  33.04 
 
 		 381 aa  50.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3277  putative esterase  33.33 
 
 		 273 aa  50.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.294344  normal  0.0259177 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3542  putative esterase  26.83 
 
 		 412 aa  49.7  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0209702 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1563  putative esterase  31.45 
 
 		 384 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.476528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1341  putative esterase  27.93 
 
 		 279 aa  49.3  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3612  putative esterase  28.92 
 
 		 306 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0832475 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5261  putative esterase  31.43 
 
 		 370 aa  48.9  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1530  putative esterase  31.45 
 
 		 384 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000509673  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1097  putative esterase  29.45 
 
 		 295 aa  48.9  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.808292 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3579  hypothetical protein  26.6 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0266188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3863  hypothetical protein  26.6 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3925  putative esterase  27.85 
 
 		 477 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01445  putative esterase  28.26 
 
 		 381 aa  48.9  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.676403  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3745  hypothetical protein  26.6 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000059605 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3767  hypothetical protein  30.14 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3504  putative esterase  25.81 
 
 		 405 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0973  putative esterase  31.68 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1694  putative esterase  27.59 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286431  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3502  putative esterase  30.82 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1466  IroE protein  30.82 
 
 		 272 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000298906 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3479  esterase  30.14 
 
 		 275 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0471  putative esterase  26.97 
 
 		 339 aa  47.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4525  putative esterase  27.78 
 
 		 277 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0383068  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3783  hypothetical protein  29.45 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159518  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2088  putative esterase  26.97 
 
 		 366 aa  47  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2744  putative esterase  33.33 
 
 		 309 aa  46.6  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000586392 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0737  putative esterase  26.42 
 
 		 437 aa  46.6  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0681  putative esterase  28.96 
 
 		 284 aa  46.6  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32905  hypothetical protein  26.92 
 
 		 526 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.954654  hitchhiker  0.000184596 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2799  hypothetical protein  26.92 
 
 		 526 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3083  putative esterase  25.97 
 
 		 294 aa  45.8  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3112  putative esterase  28.92 
 
 		 280 aa  45.8  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127997  normal  0.511793 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2825  putative esterase  29.92 
 
 		 319 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0298  putative esterase  31.2 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777822  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1251  putative esterase  29.63 
 
 		 341 aa  45.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2339  putative esterase  24.87 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0989572  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2563  putative esterase  31.71 
 
 		 357 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1594  putative esterase  30.83 
 
 		 409 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48746  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4575  putative esterase  22.98 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.971846 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1939  putative esterase  26.34 
 
 		 342 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240589 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3614  putative esterase  25.15 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2435  esterase  23.68 
 
 		 541 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1456  esterase, putative  29.01 
 
 		 281 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2307  putative esterase  28.89 
 
 		 439 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.686614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0939  hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  30.25 
 
 		 478 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1289  putative esterase  29.01 
 
 		 290 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2544  putative esterase  29.01 
 
 		 290 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110736  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2538  putative esterase  31.25 
 
 		 312 aa  43.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0267  putative esterase  29.01 
 
 		 281 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0537  putative esterase  29.01 
 
 		 281 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1370  putative esterase  29.01 
 
 		 281 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1290  putative esterase  29.01 
 
 		 281 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601203  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1030  putative esterase  29.01 
 
 		 281 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4810  putative esterase  27.59 
 
 		 273 aa  43.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>