More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6094 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6094  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  100 
 
 		 263 aa  523  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991353  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2919  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  81.23 
 
 		 262 aa  433  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0502891  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2961  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  85.77 
 
 		 257 aa  433  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.919043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4120  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  69.65 
 
 		 258 aa  374  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4434  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  69.26 
 
 		 258 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0274  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  69.96 
 
 		 258 aa  363  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2192  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.48 
 
 		 258 aa  363  1e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4231  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.7 
 
 		 258 aa  361  6e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.503556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5844  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.69 
 
 		 264 aa  356  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3852  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  70.87 
 
 		 257 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.401729 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4211  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  70.63 
 
 		 256 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637449  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3699  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.98 
 
 		 256 aa  350  1e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.493547 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0758  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  69.05 
 
 		 272 aa  349  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850324  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1753  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.72 
 
 		 271 aa  349  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2563  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  66.54 
 
 		 273 aa  348  4e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641397  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2882  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.93 
 
 		 269 aa  347  1e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.769928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2910  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.92 
 
 		 257 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.838485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3332  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.8 
 
 		 284 aa  346  2e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4093  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.9 
 
 		 266 aa  346  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0806703 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20400  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.32 
 
 		 271 aa  346  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110651  normal  0.49891 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2255  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.54 
 
 		 273 aa  345  4e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000530025  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3829  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.72 
 
 		 266 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.179517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0762  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.37 
 
 		 258 aa  338  5e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000264723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4778  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.76 
 
 		 260 aa  335  5e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.326884  normal  0.35491 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1312  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.67 
 
 		 265 aa  335  5.999999999999999e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0517  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.22 
 
 		 262 aa  334  9e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0817  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.87 
 
 		 257 aa  332  3e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1282  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.67 
 
 		 262 aa  332  5e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.328087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0141  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.42 
 
 		 294 aa  330  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662097  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4190  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.93 
 
 		 258 aa  325  7e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4651  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.43 
 
 		 252 aa  324  7e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4338  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.43 
 
 		 252 aa  324  8.000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03969  carbon-phosphorus lyase complex subunit  64.43 
 
 		 252 aa  324  9e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3894  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.43 
 
 		 252 aa  324  9e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03929  hypothetical protein  64.43 
 
 		 252 aa  324  9e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3929  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.43 
 
 		 252 aa  324  9e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4563  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.03 
 
 		 252 aa  323  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3341  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.27 
 
 		 256 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.489996  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5610  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.03 
 
 		 252 aa  323  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3307  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.27 
 
 		 256 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761331  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2590  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.27 
 
 		 256 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0301  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.24 
 
 		 251 aa  323  2e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1181  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.27 
 
 		 256 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2404  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.87 
 
 		 256 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0320  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.87 
 
 		 256 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4027  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  61.07 
 
 		 263 aa  320  9.999999999999999e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3698  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  61.07 
 
 		 263 aa  320  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3353  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  66.27 
 
 		 611 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403888  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0891  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  61.72 
 
 		 254 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3564  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  61.15 
 
 		 262 aa  318  3.9999999999999996e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2690  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.29 
 
 		 273 aa  317  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3777  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.68 
 
 		 256 aa  315  5e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1312  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.54 
 
 		 262 aa  315  6e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0709875  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0483  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  61.09 
 
 		 262 aa  315  6e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5944  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.29 
 
 		 256 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.504755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2183  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.89 
 
 		 256 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.481502  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0579  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  60.78 
 
 		 262 aa  311  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2915  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  62.85 
 
 		 254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2282  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  60.78 
 
 		 260 aa  306  3e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1929  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  60.78 
 
 		 260 aa  306  3e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2292  ABC phosphonate transport system ATPase  52.08 
 
 		 276 aa  245  6.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5001  ABC transporter related  52.32 
 
 		 276 aa  239  4e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.20285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3688  ABC transporter for phosphonate ATP-binding protein  49.58 
 
 		 278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0428  ABC type ATPase  51.42 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.602427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0464  ABC type ATPase  51.42 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.849392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2086  ABC transporter related  47.97 
 
 		 278 aa  232  5e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3508  ABC transporter related  49.39 
 
 		 279 aa  231  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3788  ABC transporter related  49.17 
 
 		 276 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3839  ABC transporter related  49.17 
 
 		 276 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.588878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2293  ABC transporter related  50.2 
 
 		 276 aa  230  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4145  ABC transporter related  50 
 
 		 276 aa  228  8e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4041  ABC transporter related  47.56 
 
 		 276 aa  225  5.0000000000000005e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0221  ABC transporter related  47.56 
 
 		 276 aa  225  5.0000000000000005e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1587  ABC transporter related  48.18 
 
 		 280 aa  225  7e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0232  ABC transporter related  44.94 
 
 		 286 aa  219  1.9999999999999999e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5869  ABC transporter-related protein  49.18 
 
 		 291 aa  208  8e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  41.35 
 
 		 593 aa  177  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2851  ABC transporter related  40.37 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.148442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  38.19 
 
 		 583 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  37.31 
 
 		 575 aa  171  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1252  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  38.37 
 
 		 629 aa  170  2e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167547 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  37.01 
 
 		 573 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  40.39 
 
 		 547 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  40.98 
 
 		 593 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3166  ABC transporter related protein  41.15 
 
 		 516 aa  160  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4963  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.17 
 
 		 340 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0355569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  43.03 
 
 		 547 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0678  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.74 
 
 		 445 aa  159  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106585  normal  0.159459 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0672  ABC transporter related  38.14 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.92463  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  39.85 
 
 		 601 aa  159  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  38 
 
 		 568 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0484  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.29 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.139637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0754  ABC transporter, ATP-binding protein  40.54 
 
 		 669 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0111  dipeptide transporter ATP-binding subunit  36.78 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1802  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.79 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0111168  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1722  ABC transporter related  42.45 
 
 		 544 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.185167  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  35.25 
 
 		 612 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4790  ABC transporter-like protein protein  35.38 
 
 		 617 aa  156  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.918505  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0817  ABC transporter related  40.46 
 
 		 285 aa  155  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08440  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  36.68 
 
 		 599 aa  155  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>