More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6058 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6058  amidohydrolase  100 
 
 		 479 aa  987    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.535728  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  33.48 
 
 		 439 aa  230  5e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1199  amidohydrolase  28.6 
 
 		 431 aa  206  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.242168  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  28.7 
 
 		 428 aa  203  6e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.65 
 
 		 432 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  30.11 
 
 		 434 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0702  chlorohydrolase family protein  30.22 
 
 		 455 aa  199  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  29.12 
 
 		 433 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  29.19 
 
 		 431 aa  196  8.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  28.64 
 
 		 431 aa  193  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  30.95 
 
 		 428 aa  192  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  31.47 
 
 		 440 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0042  amidohydrolase  32.3 
 
 		 426 aa  189  7e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03194  conserved hypothetical protein  29.28 
 
 		 464 aa  188  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1148  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.26 
 
 		 445 aa  187  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.356182 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2138  amidohydrolase  30.89 
 
 		 469 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0478654 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2167  amidohydrolase  28.71 
 
 		 436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  26.37 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  29.22 
 
 		 431 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5111  amidohydrolase  31.8 
 
 		 479 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0323236  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  30.72 
 
 		 430 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1698  amidohydrolase family protein  32.16 
 
 		 477 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1224  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.99 
 
 		 441 aa  181  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  27.96 
 
 		 426 aa  179  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3918  amidohydrolase  30.04 
 
 		 442 aa  176  8e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2960  amidohydrolase  28.32 
 
 		 458 aa  174  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  28.67 
 
 		 447 aa  172  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2226  amidohydrolase  31 
 
 		 433 aa  171  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.306812 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  26.2 
 
 		 434 aa  171  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1931  amidohydrolase  29.61 
 
 		 440 aa  171  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.64184  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2404  amidohydrolase  29.18 
 
 		 432 aa  171  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.378859  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1980  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  31.5 
 
 		 470 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0946323 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6122  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  31.5 
 
 		 470 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1956  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  31.5 
 
 		 470 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1611  amidohydrolase  29.53 
 
 		 445 aa  169  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170905  decreased coverage  0.00285374 
 
 
-
 
NC_002950  PG0559  chlorohydrolase family protein  30.71 
 
 		 381 aa  168  2e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1669  S-adenosylhomocysteine deaminase  27.73 
 
 		 462 aa  168  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5267  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  31.5 
 
 		 470 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1419  amidohydrolase  27.86 
 
 		 656 aa  168  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  25.55 
 
 		 432 aa  167  4e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1943  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  31.5 
 
 		 470 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2201  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.76 
 
 		 441 aa  167  5e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.419012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3129  amidohydrolase  30.59 
 
 		 434 aa  166  6.9999999999999995e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.611034  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1273  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.17 
 
 		 438 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1577  amidohydrolase  29.82 
 
 		 466 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0911  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.21 
 
 		 442 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1313  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  31.29 
 
 		 470 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.023454 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.7 
 
 		 439 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1870  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  31.29 
 
 		 470 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0172647 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  31.25 
 
 		 442 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2080  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.16 
 
 		 436 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1515  amidohydrolase  31.77 
 
 		 429 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1486  amidohydrolase  30.17 
 
 		 435 aa  163  7e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1851  amidohydrolase  30.89 
 
 		 432 aa  163  8.000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  32.23 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  27.63 
 
 		 440 aa  159  8e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3139  amidohydrolase  28.76 
 
 		 461 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  30 
 
 		 440 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3147  amidohydrolase  30.8 
 
 		 474 aa  157  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0171456  normal  0.0352292 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4866  amidohydrolase  26.89 
 
 		 660 aa  157  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf580  cytosine deaminase  24.37 
 
 		 435 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.239245  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  27.66 
 
 		 663 aa  156  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0977  amidohydrolase  25.72 
 
 		 420 aa  155  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.588063  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2445  amidohydrolase  29.79 
 
 		 449 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0817  amidohydrolase  29.03 
 
 		 464 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2073  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.25 
 
 		 470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722851  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1959  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.81 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.87 
 
 		 465 aa  154  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2422  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.79 
 
 		 500 aa  153  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3055  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.27 
 
 		 452 aa  153  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2379  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.79 
 
 		 476 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750758  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2526  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.79 
 
 		 476 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262801  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0735  amidohydrolase  27.18 
 
 		 422 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.30941 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1743  hydrolase, Atz/Trz family  27.5 
 
 		 443 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3649  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.11 
 
 		 443 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23240  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.48 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00576591 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2323  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.56 
 
 		 465 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1531  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.07 
 
 		 439 aa  152  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2295  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.96 
 
 		 442 aa  151  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.853343  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1183  amidohydrolase  26.93 
 
 		 422 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0768  amidohydrolase  29.81 
 
 		 442 aa  151  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0368346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.93 
 
 		 451 aa  151  3e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.93 
 
 		 484 aa  151  3e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0556  amidohydrolase  26.68 
 
 		 428 aa  150  4e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.216303  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0863  amidohydrolase  29.67 
 
 		 509 aa  150  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222647  normal  0.0227657 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15770  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.24 
 
 		 445 aa  150  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1729  chlorohydrolase  28.08 
 
 		 435 aa  150  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1865  chlorohydrolase  28.08 
 
 		 435 aa  150  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.967163  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11770  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  28.38 
 
 		 449 aa  150  7e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1903  chlorohydrolase  28.08 
 
 		 435 aa  150  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0260  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.77 
 
 		 453 aa  149  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1981  chlorohydrolase  28.31 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1810  amidohydrolase  29.75 
 
 		 473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1336  amidohydrolase  28.94 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395151 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0800  amidohydrolase  26.5 
 
 		 422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.77 
 
 		 469 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1577  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.38 
 
 		 455 aa  147  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0236916  unclonable  0.000000239085 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1736  amidohydrolase  26.81 
 
 		 455 aa  147  4.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1182  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.33 
 
 		 434 aa  147  5e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.335787  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1591  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.18 
 
 		 461 aa  146  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>