More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6045 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 329 aa  684    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  32.21 
 
 		 264 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 		 192 aa  95.1  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  32.16 
 
 		 203 aa  94  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  31.72 
 
 		 221 aa  92.8  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  31.31 
 
 		 193 aa  91.3  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  34.46 
 
 		 201 aa  91.3  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  34.46 
 
 		 199 aa  91.7  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  29.27 
 
 		 230 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  30.91 
 
 		 248 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  29.27 
 
 		 230 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  29.27 
 
 		 231 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  29.27 
 
 		 231 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  33.15 
 
 		 244 aa  90.5  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 215 aa  90.5  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  29.27 
 
 		 231 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  33.87 
 
 		 236 aa  89.7  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  28.78 
 
 		 231 aa  89.4  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  28.78 
 
 		 231 aa  89  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  28.78 
 
 		 231 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  30.09 
 
 		 240 aa  87.4  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  31.22 
 
 		 248 aa  87  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  29.9 
 
 		 207 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  32.49 
 
 		 190 aa  86.3  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  34.13 
 
 		 201 aa  86.3  7e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  26.04 
 
 		 213 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 		 230 aa  85.1  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  31.36 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  28.02 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  32.37 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  33 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 192 aa  82  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  32.52 
 
 		 224 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  31.07 
 
 		 258 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  32.76 
 
 		 232 aa  81.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  33.54 
 
 		 201 aa  81.6  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  30.45 
 
 		 248 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  34.38 
 
 		 201 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0690  isochorismatase  33.33 
 
 		 200 aa  81.6  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0385693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  24.55 
 
 		 213 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 190 aa  81.3  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  32.93 
 
 		 196 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4718  hypothetical protein  32.64 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  31.49 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5987  putative isochorismatase family protein  29.9 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.104192 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  35.03 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  27.57 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  32.26 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  31.82 
 
 		 389 aa  79.3  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  33.91 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  27.85 
 
 		 213 aa  78.2  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  29.19 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  28.42 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  34.94 
 
 		 204 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  27.98 
 
 		 266 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  28.65 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  30.65 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  33.92 
 
 		 223 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  31.72 
 
 		 240 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  27.72 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 235 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  32.79 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  35.96 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  29.61 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  31.22 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  30.26 
 
 		 239 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  32.86 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  29.07 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  32.79 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  29.26 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  28.18 
 
 		 174 aa  72  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 204 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  28.48 
 
 		 184 aa  72  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  29.84 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  29.84 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  29.84 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  28.88 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  29.44 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  29.24 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  25.98 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  32.21 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  26.37 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  29.74 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  32.21 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3766  isochorismatase hydrolase  26.11 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.716861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  29.67 
 
 		 533 aa  69.7  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  29.57 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  27.32 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  30.6 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  29.74 
 
 		 239 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  26.63 
 
 		 180 aa  68.6  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  27.49 
 
 		 210 aa  68.9  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  31.92 
 
 		 226 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  29.15 
 
 		 227 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  28.04 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>