273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5970 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5970  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 534 aa  1096    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  41.14 
 
 		 544 aa  413  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  37.25 
 
 		 547 aa  362  8e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  33.27 
 
 		 535 aa  328  2.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54800  carotenoid isomerase-like protein  28.21 
 
 		 923 aa  216  7e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0759229  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03825  hypothetical protein  23.51 
 
 		 508 aa  157  5.0000000000000005e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1995  All-trans-retinol 13,14-reductase  25.58 
 
 		 499 aa  157  5.0000000000000005e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2002  FAD dependent oxidoreductase  26 
 
 		 510 aa  150  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  23.46 
 
 		 505 aa  150  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2032  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 		 520 aa  146  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.756687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1174  All-trans-retinol 13,14-reductase  23.12 
 
 		 522 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4146  All-trans-retinol 13,14-reductase  28.43 
 
 		 562 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.559453  decreased coverage  0.00452261 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0425  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.48 
 
 		 511 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1874  All-trans-retinol 13,14-reductase  24.41 
 
 		 501 aa  140  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1209  conserved hypothetical protein, FAD-binding domain protein  25.54 
 
 		 502 aa  139  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0436  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.48 
 
 		 511 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.601478 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  26.73 
 
 		 501 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0577  All-trans-retinol 13,14-reductase  24.04 
 
 		 542 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0906  hypothetical protein  24.76 
 
 		 480 aa  117  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396685  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.25 
 
 		 740 aa  116  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2665  putative phytoene dehydrogenase  25.14 
 
 		 495 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  27.35 
 
 		 496 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 		 554 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  27.82 
 
 		 504 aa  110  8.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  25.38 
 
 		 516 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  27.2 
 
 		 508 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  25.76 
 
 		 512 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  27.31 
 
 		 508 aa  103  9e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  25.76 
 
 		 512 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  26 
 
 		 532 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  26.64 
 
 		 505 aa  102  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  27.89 
 
 		 518 aa  100  5e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 515 aa  100  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 		 503 aa  99.4  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  24.42 
 
 		 506 aa  97.8  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  26.68 
 
 		 598 aa  97.4  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  24.57 
 
 		 506 aa  96.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 		 559 aa  94.7  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  25.33 
 
 		 520 aa  94.7  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 512 aa  94.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  25.14 
 
 		 499 aa  94  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  22.4 
 
 		 509 aa  94  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  22.22 
 
 		 509 aa  93.2  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  25.33 
 
 		 503 aa  93.2  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  24.62 
 
 		 520 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  24.15 
 
 		 512 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  23.99 
 
 		 497 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 		 510 aa  92  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  24.86 
 
 		 520 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1708  hypothetical protein  21.43 
 
 		 509 aa  91.7  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.718334  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  27.95 
 
 		 510 aa  92  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  24.57 
 
 		 522 aa  91.3  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  21.26 
 
 		 509 aa  91.3  4e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  26.1 
 
 		 489 aa  90.5  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  23.61 
 
 		 497 aa  90.5  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  25.41 
 
 		 503 aa  90.1  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  26.54 
 
 		 510 aa  90.1  9e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  21.48 
 
 		 509 aa  90.1  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  26.24 
 
 		 518 aa  89  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  24.2 
 
 		 547 aa  88.2  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 717 aa  88.6  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  23.74 
 
 		 514 aa  88.2  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  23.02 
 
 		 938 aa  87.8  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  24.69 
 
 		 554 aa  86.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  23.27 
 
 		 514 aa  85.5  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  27.13 
 
 		 507 aa  85.1  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  30.52 
 
 		 511 aa  82.4  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  25.36 
 
 		 530 aa  82.4  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  24.01 
 
 		 513 aa  81.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  24.65 
 
 		 511 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 		 537 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  22.92 
 
 		 506 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  22.8 
 
 		 514 aa  80.9  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  21.6 
 
 		 484 aa  80.9  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  26.37 
 
 		 708 aa  80.5  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  25.31 
 
 		 512 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  23.84 
 
 		 504 aa  79  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  25.1 
 
 		 511 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  19.8 
 
 		 525 aa  78.6  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  24.47 
 
 		 555 aa  77.8  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  25.1 
 
 		 511 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  23.03 
 
 		 554 aa  77  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1834  FAD dependent oxidoreductase  26.25 
 
 		 504 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0259899 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  22.18 
 
 		 556 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  24.44 
 
 		 494 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  23.8 
 
 		 505 aa  75.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2059  hypothetical protein  20.7 
 
 		 509 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0409241  normal  0.0351139 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  24.54 
 
 		 556 aa  75.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4129  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 		 504 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.60213 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  23.14 
 
 		 492 aa  74.3  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3286  FAD dependent oxidoreductase  24.92 
 
 		 488 aa  74.3  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 		 514 aa  74.3  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  25.38 
 
 		 498 aa  74.3  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  22.47 
 
 		 514 aa  73.6  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  23.55 
 
 		 509 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  23.61 
 
 		 645 aa  72.4  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  26.02 
 
 		 523 aa  71.2  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  26.71 
 
 		 508 aa  71.6  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 		 501 aa  70.9  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  23.13 
 
 		 509 aa  70.5  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>