97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5841 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5841  putative carbohydrate binding  100 
 
 		 2730 aa  5493    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4245  glycosyltransferase 36  37.57 
 
 		 2860 aa  1008    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3489  hypothetical protein  41.95 
 
 		 2761 aa  1750    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3139  glycosyltransferase 36  42.59 
 
 		 2842 aa  1092    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0108  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  40.19 
 
 		 2864 aa  1113    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2737  glycosyltransferase 36  39.67 
 
 		 2864 aa  1016    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2993  glycosyltransferase 36  38.69 
 
 		 1303 aa  779    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  39.99 
 
 		 2870 aa  1077    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0124  glycosyltransferase 36  40.6 
 
 		 2888 aa  1118    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  39.63 
 
 		 2748 aa  1600    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4173  glycosyltransferase 36  39.82 
 
 		 2839 aa  1056    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1870  glycosyltransferase 36  40.4 
 
 		 2864 aa  1031    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4340  glycosyltransferase 36  39.49 
 
 		 3021 aa  989    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  39.12 
 
 		 2880 aa  1050    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  39.51 
 
 		 2833 aa  1063    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2577  putative carbohydrate binding  34.1 
 
 		 2823 aa  981    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  37.42 
 
 		 2887 aa  1068    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2133  glycosyltransferase 36  40.88 
 
 		 2881 aa  1035    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1711  glycosyltransferase 36  41.13 
 
 		 2874 aa  1034    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3888  glycosyltransferase 36  41.4 
 
 		 2875 aa  1058    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  39.98 
 
 		 2758 aa  1558    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  39.47 
 
 		 2929 aa  1016    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3845  glycosyltransferase 36  39.86 
 
 		 2839 aa  1060    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  39.41 
 
 		 2747 aa  1576    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1517  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  42.97 
 
 		 2901 aa  1145    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302513  normal  0.43916 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  35.02 
 
 		 2786 aa  1483    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0111  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  40.47 
 
 		 2732 aa  1119    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.888748  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2046  putative carbohydrate binding:glycosyltransferase 36:glycosyltransferase 36 associated  40.8 
 
 		 2932 aa  1030    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1304  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  40.37 
 
 		 2859 aa  1039    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3613  glycosyltransferase  41.19 
 
 		 2769 aa  1752    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1183  glycosyltransferase 36  38.47 
 
 		 2905 aa  1029    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  41.41 
 
 		 2748 aa  1408    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  35.83 
 
 		 2716 aa  1367    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2188  glycosyltransferase 36  38.27 
 
 		 2916 aa  994    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3667  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  63.55 
 
 		 2793 aa  3385    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1346  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  42.25 
 
 		 2868 aa  1092    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2531  glycosyltransferase 36  43.12 
 
 		 2845 aa  1160    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4755  putative carbohydrate binding  39.66 
 
 		 2779 aa  986    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1221  glycosyltransferase 36  35.95 
 
 		 2922 aa  1064    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1306  cyclic beta 1-2 glucan synthase  37.07 
 
 		 2884 aa  1036    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3093  glycosyltransferase 36  63.72 
 
 		 2731 aa  3347    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5592  glycosyltransferase 36  42.38 
 
 		 2831 aa  1068    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5267  glycosyltransferase 36  42.31 
 
 		 2868 aa  1064    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3706  glycosyltransferase 36  35.78 
 
 		 2453 aa  554  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3648  glycosyltransferase 36 associated  47.04 
 
 		 624 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0091  glycosyltransferase 36  37.45 
 
 		 849 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00140222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0953  glycosyltransferase 36  31 
 
 		 786 aa  436  1e-120  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.862285  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19760  glycosyltransferase 36  28.33 
 
 		 784 aa  279  6e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1364  glycosyltransferase 36  30.21 
 
 		 785 aa  276  4.0000000000000004e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19750  glycosyltransferase 36  26.4 
 
 		 819 aa  263  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3274  glycosyltransferase 36  27.62 
 
 		 822 aa  263  3e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1363  glycosyltransferase 36  27.56 
 
 		 815 aa  253  5e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0951  glycosyltransferase 36  27.15 
 
 		 813 aa  252  7e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0220582  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0968  glycosyltransferase 36  27.15 
 
 		 813 aa  252  7e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.547767  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0459  glycosyltransferase 36  25.25 
 
 		 790 aa  252  8e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0460  glycosyltransferase 36  27.08 
 
 		 811 aa  250  3e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0275  cellobiose phosphorylase  25.44 
 
 		 811 aa  238  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1439  glycosyltransferase 36  26.1 
 
 		 784 aa  236  4.0000000000000004e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0148  glycosyltransferase 36  28.01 
 
 		 822 aa  235  9e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0233043 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2312  glycosyltransferase 36  27.11 
 
 		 797 aa  233  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1745  glycosyltransferase 36  26.47 
 
 		 815 aa  230  3e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.414629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1318  cellobiose phosphorylase  25.69 
 
 		 811 aa  229  6e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0462617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03431  hypothetical protein  24.37 
 
 		 802 aa  223  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0430  glycosyltransferase 36  25.06 
 
 		 831 aa  223  5e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.948087  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002578  chitobiose phosphorylase  24.59 
 
 		 802 aa  221  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2109  glycosyltransferase 36  25.16 
 
 		 811 aa  221  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2616  glycosyltransferase 36  27.05 
 
 		 827 aa  220  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.294292  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0141  cellulose degradation product phosphorylase  24.74 
 
 		 801 aa  219  5e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0649  glycosyl transferase 36  24.28 
 
 		 811 aa  213  4e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0225062  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2310  glycosyltransferase 36  25.82 
 
 		 794 aa  206  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.587423  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1053  glycosyltransferase 36  25.53 
 
 		 829 aa  204  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2584  chitobiose phosphorylase (glycosyl transferase)  23.8 
 
 		 762 aa  203  5e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2354  glycosyltransferase 36  24.04 
 
 		 796 aa  192  8e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3854  glycosyltransferase 36  23.33 
 
 		 797 aa  188  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1744  glycosyltransferase 36  25.45 
 
 		 823 aa  188  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0648  glycosyl transferase 36  24.41 
 
 		 809 aa  186  5.0000000000000004e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000072507  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0906  NdvB protein  25.83 
 
 		 788 aa  186  8.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000016442 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3412  glycosyltransferase 36  23.95 
 
 		 824 aa  183  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1929  glycosyltransferase 36  23.38 
 
 		 797 aa  182  5.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02749  NdvB protein  27.38 
 
 		 801 aa  173  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3696  cyclic beta 1-2 glucan synthetase domain-containing protein  24.69 
 
 		 802 aa  150  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3575  hypothetical protein  28.93 
 
 		 536 aa  120  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0510  hypothetical protein  26.76 
 
 		 536 aa  114  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3150  hypothetical protein  28.09 
 
 		 541 aa  109  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30460  hypothetical protein  26.07 
 
 		 754 aa  108  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0534112  normal  0.427386 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2989  glycosyltransferase 36  24.15 
 
 		 984 aa  91.3  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.684465  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5665  hypothetical protein  24.96 
 
 		 1100 aa  76.3  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1072  hypothetical protein  25.76 
 
 		 459 aa  72.4  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0524  hypothetical protein  25.76 
 
 		 459 aa  72  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00628478  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0585  hypothetical protein  25.76 
 
 		 459 aa  72  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0392402  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1872  hypothetical protein  24 
 
 		 461 aa  65.9  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6606  hypothetical protein  24.05 
 
 		 1094 aa  59.7  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814353 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0694  hypothetical protein  21.83 
 
 		 1113 aa  56.6  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.514428  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2456  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1076 aa  54.7  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1386  hypothetical protein  23.76 
 
 		 529 aa  53.1  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257961  normal  0.650962 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1586  hypothetical protein  27.7 
 
 		 1136 aa  48.5  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.707632  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04170  Cellobiose phosphorylase  24 
 
 		 904 aa  47  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>