More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5801 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  669    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  76.56 
 
 		 327 aa  515  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  47.02 
 
 		 327 aa  299  6e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  47.28 
 
 		 325 aa  295  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  47.76 
 
 		 328 aa  295  9e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  47.73 
 
 		 339 aa  295  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  47.14 
 
 		 328 aa  286  4e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  43.96 
 
 		 330 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  43.85 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  43.91 
 
 		 325 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  45.13 
 
 		 333 aa  279  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  45.22 
 
 		 336 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  44.85 
 
 		 325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  46.15 
 
 		 335 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  43.42 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  43.09 
 
 		 328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  42.81 
 
 		 328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  43.73 
 
 		 339 aa  269  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  41.09 
 
 		 332 aa  268  8.999999999999999e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  44.7 
 
 		 330 aa  268  8.999999999999999e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  43.83 
 
 		 360 aa  268  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  45.54 
 
 		 336 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  42.61 
 
 		 339 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  43.18 
 
 		 345 aa  266  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  43.18 
 
 		 345 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  45.15 
 
 		 327 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  42.57 
 
 		 333 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  42.76 
 
 		 324 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  42.59 
 
 		 335 aa  263  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  42.86 
 
 		 332 aa  262  6e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43.52 
 
 		 330 aa  262  6e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  43.42 
 
 		 335 aa  261  8.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  42.86 
 
 		 335 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  43.05 
 
 		 335 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  42.07 
 
 		 325 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  40.19 
 
 		 339 aa  260  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  42.07 
 
 		 327 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  40.79 
 
 		 331 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5199  hypothetical protein  39.02 
 
 		 342 aa  260  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  43.69 
 
 		 320 aa  259  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  40.57 
 
 		 324 aa  259  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  40.44 
 
 		 336 aa  258  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  41.81 
 
 		 318 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  43.14 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  42.26 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  44.63 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  41.85 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  37.73 
 
 		 330 aa  256  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  40.06 
 
 		 328 aa  255  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  43.96 
 
 		 324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  42.45 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  40.86 
 
 		 326 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  41.72 
 
 		 326 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  41.95 
 
 		 324 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  41.9 
 
 		 333 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  41.25 
 
 		 358 aa  252  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  42.62 
 
 		 344 aa  252  6e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  42.23 
 
 		 335 aa  252  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  40.58 
 
 		 323 aa  252  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  41.61 
 
 		 321 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4563  hypothetical protein  40.88 
 
 		 329 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  41.27 
 
 		 332 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  38.41 
 
 		 331 aa  250  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  39.94 
 
 		 314 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3862  hypothetical protein  43.1 
 
 		 339 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.915599  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  43.06 
 
 		 323 aa  250  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  40.45 
 
 		 322 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  43.88 
 
 		 328 aa  249  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  42.32 
 
 		 327 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  40.73 
 
 		 332 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  40 
 
 		 346 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  42.14 
 
 		 326 aa  249  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5251  hypothetical protein  40.47 
 
 		 338 aa  249  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  43.39 
 
 		 322 aa  248  9e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  42.39 
 
 		 334 aa  248  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  40.27 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  43.09 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  41.55 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  41.39 
 
 		 323 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1562  hypothetical protein  41.1 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000177519 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  37.42 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  42.07 
 
 		 337 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4457  extra-cytoplasmic solute receptor  41.64 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00706561  normal  0.0529107 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  41.2 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  39.26 
 
 		 349 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  40.79 
 
 		 344 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  39.54 
 
 		 337 aa  247  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  40.13 
 
 		 326 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5058  extra-cytoplasmic solute receptor  44.75 
 
 		 328 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0827045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  40.32 
 
 		 324 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  42.52 
 
 		 322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  40.2 
 
 		 327 aa  245  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4980  hypothetical protein  44.67 
 
 		 321 aa  245  6.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.790818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  38.54 
 
 		 322 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2909  hypothetical protein  41.5 
 
 		 323 aa  245  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  42.28 
 
 		 326 aa  245  8e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3801  hypothetical protein  38.87 
 
 		 335 aa  245  8e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694709  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  40.51 
 
 		 322 aa  245  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  42.9 
 
 		 326 aa  245  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5294  extra-cytoplasmic solute receptor  45.26 
 
 		 330 aa  245  9e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.125866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>