More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5774 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
267 aa  531  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.29 
 
 
264 aa  322  5e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.61 
 
 
287 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  48.05 
 
 
259 aa  229  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0194  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.2 
 
 
265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5145  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.21 
 
 
260 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.149843 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.79 
 
 
273 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2583  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.3 
 
 
269 aa  207  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.601041  normal  0.0270036 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  48.79 
 
 
264 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.39 
 
 
264 aa  205  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5501  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.9 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4185  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.08 
 
 
267 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.67 
 
 
260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.37 
 
 
258 aa  168  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4549  enoyl-CoA hydratase  43.08 
 
 
276 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1594  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.52 
 
 
263 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.91 
 
 
264 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  0.988887 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  41.96 
 
 
268 aa  160  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  39.59 
 
 
259 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 
264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  38.76 
 
 
265 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6846  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.94 
 
 
266 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763233  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6847  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.29 
 
 
268 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480531  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0344  enoyl-CoA hydratase  38.04 
 
 
256 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.458261  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  40.15 
 
 
267 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  39.62 
 
 
265 aa  148  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.46 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1655  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.68 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  38.04 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0973  enoyl-CoA hydratase  36.9 
 
 
259 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0850913 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.52 
 
 
267 aa  145  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.11 
 
 
268 aa  145  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.43 
 
 
266 aa  145  9e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4597  enoyl-CoA hydratase  39.39 
 
 
270 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 
266 aa  144  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.87 
 
 
267 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.43 
 
 
253 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.744072  decreased coverage  0.0000000565271 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6848  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.57 
 
 
271 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.02 
 
 
287 aa  142  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.538415 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 
267 aa  142  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3284  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.02 
 
 
272 aa  142  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 
258 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0228  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.25 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421003  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  36.29 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1457  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.02 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.221294  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.22 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  36.29 
 
 
262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2057  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 
278 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0685085  normal  0.0230217 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 
263 aa  139  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0087  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.27 
 
 
263 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  38.87 
 
 
266 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4362  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.43 
 
 
253 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 
267 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  36.23 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.79 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
270 aa  136  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  34.4 
 
 
259 aa  135  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4708  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.740902  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.82 
 
 
273 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1007  enoyl-CoA hydratase  36.59 
 
 
268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0394132  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  37.79 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  32.06 
 
 
266 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2240  enoyl-CoA hydratase  40.32 
 
 
272 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1625  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.68 
 
 
259 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0454555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  36.14 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  30.83 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.87 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0054  enoyl-CoA hydratase  36.7 
 
 
270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  36.76 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.59 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.2 
 
 
264 aa  130  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  35.06 
 
 
263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.49 
 
 
261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  36.22 
 
 
263 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  38.8 
 
 
261 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.78 
 
 
260 aa  128  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09128  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G01210)  34.65 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2014  enoyl-CoA hydratase  35.6 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.49745  normal  0.0415975 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  34.11 
 
 
297 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  30.43 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 
265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.94 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2136  enoyl-CoA hydratase  34.85 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.259318  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.28 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.05 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  36.22 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  34.11 
 
 
297 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.11 
 
 
261 aa  126  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  31.3 
 
 
266 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  34.11 
 
 
261 aa  126  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  35.89 
 
 
260 aa  126  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 
267 aa  126  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  34.11 
 
 
297 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  34.11 
 
 
261 aa  126  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1538  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.21 
 
 
255 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>