288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5729 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5729  Integral membrane protein TerC  100 
 
 		 249 aa  487  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  78.37 
 
 		 259 aa  387  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  75.1 
 
 		 252 aa  362  3e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  61.63 
 
 		 248 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  60.41 
 
 		 250 aa  300  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1919  Integral membrane protein TerC  62.14 
 
 		 253 aa  291  5e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.996169 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2281  Integral membrane protein TerC  58.87 
 
 		 250 aa  290  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000295379 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  61.89 
 
 		 248 aa  290  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  58.85 
 
 		 249 aa  288  6e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1336  TerC family membrane protein  60.66 
 
 		 245 aa  286  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2234  integral membrane protein TerC  60.34 
 
 		 247 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0786  integral membrane protein TerC  60.32 
 
 		 253 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0111606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0899  integral membrane protein TerC  60.41 
 
 		 257 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  56.79 
 
 		 253 aa  278  8e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  59 
 
 		 250 aa  276  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  56.79 
 
 		 255 aa  272  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000024631  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0038  Integral membrane protein TerC  57.44 
 
 		 249 aa  271  8.000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0299  hypothetical protein  58.02 
 
 		 251 aa  270  1e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.481455  hitchhiker  0.0000710089 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  54.81 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  58.13 
 
 		 259 aa  269  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  55.04 
 
 		 238 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2148  Integral membrane protein TerC  53.88 
 
 		 250 aa  268  5e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  0.0306348 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  56.41 
 
 		 250 aa  267  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  57.32 
 
 		 239 aa  266  2e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9165  integral membrane protein TerC  61.79 
 
 		 254 aa  265  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1505  integral membrane protein TerC  57.79 
 
 		 244 aa  262  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6267  hypothetical protein  59.35 
 
 		 254 aa  261  6e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  56.61 
 
 		 253 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2445  integral membrane protein TerC  53.66 
 
 		 250 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3248  integral membrane protein TerC  53.66 
 
 		 250 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  55.88 
 
 		 238 aa  259  3e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3180  integral membrane protein TerC  53.94 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.492128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1505  protein YegH  55 
 
 		 246 aa  258  4e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000614006  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1753  hypothetical protein  60.08 
 
 		 253 aa  259  4e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0162  integral membrane protein TerC  57.81 
 
 		 256 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4355  Integral membrane protein TerC  56.45 
 
 		 253 aa  256  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695526 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4337  Integral membrane protein TerC  55.02 
 
 		 295 aa  256  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3527  integral membrane protein TerC  53.25 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.16998 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49600  Integral membrane protein TerC family  57.03 
 
 		 248 aa  256  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0032  integral membrane protein TerC  55.69 
 
 		 255 aa  256  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43134  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2490  Integral membrane protein TerC  58.23 
 
 		 251 aa  255  6e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0146  integral membrane protein TerC  56.64 
 
 		 265 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.125302 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1787  S-adenosylmethionine synthetase (methionineadenosyltransferase; AdoMet synthetase; MAT)  57.14 
 
 		 241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1180  integral membrane protein TerC  57.2 
 
 		 241 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000873859 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4229  Integral membrane protein TerC  54.55 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0769944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1505  integral membrane protein TerC  56.85 
 
 		 241 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0874873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0164  integral membrane protein TerC  56.25 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0055  Integral membrane protein TerC  55.56 
 
 		 253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0067  Integral membrane protein TerC  55.56 
 
 		 253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.645865  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5081  integral membrane protein TerC  56.42 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0792895 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1356  integral membrane protein TerC  57.44 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.764248  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3200  Integral membrane protein TerC  55.7 
 
 		 238 aa  253  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3663  integral membrane protein TerC  51.85 
 
 		 510 aa  253  3e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2326  integral membrane protein TerC  50.41 
 
 		 523 aa  252  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3437  CBS domain-containing protein  50.41 
 
 		 523 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527422  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0051  integral membrane protein TerC  55.56 
 
 		 253 aa  252  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.653903  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2160  integral membrane protein TerC  58.51 
 
 		 249 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2436  integral membrane protein TerC  50.82 
 
 		 523 aa  251  6e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2424  integral membrane protein TerC  52.21 
 
 		 252 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.350299  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1942  integral membrane protein TerC  53.16 
 
 		 247 aa  251  9.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0501852  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2045  integral membrane protein TerC  53.91 
 
 		 241 aa  251  9.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7344  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5995  hypothetical protein  60.49 
 
 		 252 aa  250  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2948  Integral membrane protein TerC  53.56 
 
 		 240 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69320  putative integral membrane transport protein  60.49 
 
 		 252 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2499  integral membrane protein TerC  50 
 
 		 523 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3874  integral membrane protein TerC  52.56 
 
 		 253 aa  249  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3826  integral membrane protein TerC  55.98 
 
 		 238 aa  248  6e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000678399  normal  0.474132 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0273  integral membrane protein TerC  50 
 
 		 241 aa  247  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3094  integral membrane protein TerC  50.42 
 
 		 518 aa  246  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.403437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47510  integral membrane protein  54.94 
 
 		 252 aa  247  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3038  Integral membrane protein TerC  51.75 
 
 		 577 aa  246  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3705  integral membrane protein TerC  52.08 
 
 		 249 aa  246  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72180  putative membrane protein TerC  60.16 
 
 		 254 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.559812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1788  hypothetical protein  59.27 
 
 		 254 aa  246  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.377991 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  51.65 
 
 		 249 aa  245  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0656  Integral membrane protein TerC  52.21 
 
 		 249 aa  245  4e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0892415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3234  hypothetical protein  56.96 
 
 		 237 aa  245  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00228616  hitchhiker  0.000000995784 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2342  CBS:transporter-associated region:integral membrane protein TerC  49.8 
 
 		 522 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2812  integral membrane protein TerC  49.39 
 
 		 514 aa  245  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0276679 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3171  protein YegH  56.96 
 
 		 237 aa  245  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00710454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3219  hypothetical protein  56.96 
 
 		 237 aa  245  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  hitchhiker  0.00113241 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3153  protein YegH  56.96 
 
 		 237 aa  245  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000196217  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3334  hypothetical protein  56.96 
 
 		 237 aa  245  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00486837  hitchhiker  0.00634804 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1725  Integral membrane protein TerC  53.04 
 
 		 268 aa  244  6.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1293  Integral membrane protein TerC  51.32 
 
 		 528 aa  244  8e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3839  hypothetical protein  51.04 
 
 		 254 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2087  Integral membrane protein TerC  58.51 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1972  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  49.57 
 
 		 519 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0865703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0314  inner membrane protein  51.02 
 
 		 251 aa  241  7e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00210653  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2029  TerC family/CBS/transporter membrane protein  49.57 
 
 		 519 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34644  normal  0.965687 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1487  hypothetical protein  49.57 
 
 		 519 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal  0.853347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1968  membrane protein TerC family/CBS/transporter associated domain protein  49.57 
 
 		 519 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0339939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2385  integral membrane protein TerC  51.32 
 
 		 518 aa  241  7e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1303  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  49.57 
 
 		 519 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344709  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2532  membrane protein, TerC family  48.98 
 
 		 522 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02680  predicted inner membrane protein  56.09 
 
 		 237 aa  240  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000474889  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3152  TerC family integral membrane protein  56.09 
 
 		 237 aa  240  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251436  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0883  integral membrane protein TerC  56.09 
 
 		 237 aa  240  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0104396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4099  integral membrane protein, TerC family  56.09 
 
 		 237 aa  240  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000012685  hitchhiker  0.00127098 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2980  TerC family integral membrane protein  56.09 
 
 		 237 aa  240  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000029602  normal  0.0103566 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>