68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5685 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5685  blue (type 1) copper domain protein  100 
 
 		 168 aa  341  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3487  blue (type1) copper domain-containing protein  64.6 
 
 		 170 aa  223  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  71.92 
 
 		 272 aa  221  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2668  blue (type1) copper domain-containing protein  65.85 
 
 		 163 aa  214  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  0.234604 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4551  blue (type1) copper domain-containing protein  78.29 
 
 		 171 aa  214  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2721  blue (type1) copper domain-containing protein  69.85 
 
 		 166 aa  209  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0479159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2197  blue (type 1) copper domain protein  70.59 
 
 		 164 aa  208  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3913  blue (type 1) copper domain protein  60.74 
 
 		 162 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4027  blue (type 1) copper domain protein  60.74 
 
 		 162 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0457304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9844  copper tolerance protein  51.23 
 
 		 159 aa  161  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5030  blue (type1) copper domain-containing protein  54.55 
 
 		 159 aa  160  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4583  normal  0.77741 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5863  blue (type 1) copper domain protein  57.75 
 
 		 159 aa  157  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9849  copper tolerance protein  50 
 
 		 159 aa  156  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4824  blue (type1) copper domain-containing protein  48.43 
 
 		 160 aa  154  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.904248  normal  0.294152 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6116  putative oxido-reductase protein CopI  50 
 
 		 158 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4603  blue (type1) copper domain-containing protein  52.21 
 
 		 160 aa  148  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1833  blue (type 1) copper domain protein  50.67 
 
 		 159 aa  147  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584393 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5106  blue (type 1) copper domain protein  49.68 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1207  blue (type 1) copper domain protein  47.17 
 
 		 160 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2909  blue (type1) copper domain-containing protein  51.08 
 
 		 163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.272302  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2601  blue (type1) copper domain-containing protein  47.17 
 
 		 160 aa  144  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377321  normal  0.709674 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7873  blue (type 1) copper domain protein  51.88 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2655  blue (type1) copper domain-containing protein  47.95 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1267  blue (type1) copper domain-containing protein  53.51 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034808 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  51.88 
 
 		 156 aa  137  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1635  oxidoreductase  54.7 
 
 		 181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.400621  normal  0.0387336 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1667  blue (type1) copper domain-containing protein  43.04 
 
 		 164 aa  130  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0734  blue (type 1) copper domain protein  42.14 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3980  blue (type 1) copper domain protein  43.75 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1092  blue (type 1) copper domain protein  45.51 
 
 		 165 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4269  blue (type1) copper domain-containing protein  44 
 
 		 161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0575  blue (type1) copper domain-containing protein  45.74 
 
 		 154 aa  127  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0159129  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6520  putative copper tolerance protein (cupredoxin)  46.56 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3425  putative copper tolerance protein  44.62 
 
 		 151 aa  124  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.792125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4053  transposase Tn3 family protein  47.71 
 
 		 166 aa  120  9e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3995  blue (type1) copper domain-containing protein  44.27 
 
 		 180 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.704782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0125  copper-binding protein  41.96 
 
 		 177 aa  111  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2350  hypothetical protein  37.84 
 
 		 182 aa  110  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3263  putative copper binding protein  43.71 
 
 		 176 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27840  hypothetical protein  38.59 
 
 		 205 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3854  uncharacterized copper-binding protein  41.22 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0348  blue (type1) copper domain-containing protein  35.94 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471869 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2231  blue (type1) copper domain-containing protein  38.16 
 
 		 177 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1700  blue (type1) copper domain-containing protein  38.46 
 
 		 175 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435665 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2159  plastocyanin/azurin family copper binding protein  36.54 
 
 		 175 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0076427  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3583  hypothetical protein  36.54 
 
 		 175 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2232  hypothetical protein  37.82 
 
 		 185 aa  92  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1676  blue (type1) copper domain-containing protein  37.32 
 
 		 167 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0969  hypothetical protein  36.13 
 
 		 169 aa  89.7  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06367  hypothetical protein  38.14 
 
 		 188 aa  87.4  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0713  hypothetical protein  35.43 
 
 		 190 aa  86.7  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001394  hypothetical protein  36.44 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000508588  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2540  blue-copper-protein-like protein  27.91 
 
 		 153 aa  57.4  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00275414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  28.48 
 
 		 534 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  30.5 
 
 		 161 aa  51.6  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  26.89 
 
 		 287 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  24.73 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1660  blue (type 1) copper domain protein  27.87 
 
 		 314 aa  48.5  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4752  Nitrite reductase (NO-forming)  33.33 
 
 		 455 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  31.58 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2981  hypothetical protein  25.64 
 
 		 150 aa  45.1  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2109  hypothetical protein  27.35 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2634  blue (type 1) copper domain protein  27.87 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4905  blue (type1) copper domain-containing protein  34.83 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0465792  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  28.1 
 
 		 116 aa  41.2  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  28.1 
 
 		 116 aa  40.8  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1012  hypothetical protein  28 
 
 		 129 aa  40.8  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1833  blue (type 1) copper domain protein  43.59 
 
 		 241 aa  40.4  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.749286  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>