More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5641 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 146 aa  306  5.9999999999999995e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  48.51 
 
 		 167 aa  140  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  47.52 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  47.01 
 
 		 156 aa  134  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  46.81 
 
 		 160 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  47.01 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  46.81 
 
 		 160 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  47.01 
 
 		 156 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  46.81 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  46.81 
 
 		 157 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  46.81 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  46.81 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  46.81 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  45.52 
 
 		 156 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  45.52 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  45.52 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  44.03 
 
 		 152 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  46.83 
 
 		 153 aa  127  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0763  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 		 153 aa  123  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0534462 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0697  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  41.67 
 
 		 149 aa  120  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 		 340 aa  62.4  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3748  dinucleoside polyphosphate hydrolase  30.71 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251963 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3198  dinucleoside polyphosphate hydrolase  31.45 
 
 		 175 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00084868  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3017  dinucleoside polyphosphate hydrolase  31.45 
 
 		 175 aa  52.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000442704  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  41.94 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  41.94 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2782  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.9 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000489466  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0904  dinucleoside polyphosphate hydrolase  30.65 
 
 		 177 aa  52  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000367518  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3217  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.9 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000360016  hitchhiker  0.00252549 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1331  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.9 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  28.45 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3151  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.9 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000021359  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1142  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.9 
 
 		 174 aa  51.6  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000333704  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3043  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.9 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  normal  0.544281 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3232  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.9 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000155637  hitchhiker  0.0000853193 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3168  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.9 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000367916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3331  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.9 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000146788  hitchhiker  0.005493 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3824  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.35 
 
 		 175 aa  51.6  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000167151  normal  0.427646 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02678  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.9 
 
 		 176 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000336855  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0861  NUDIX hydrolase  44.9 
 
 		 176 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117938  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3150  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.9 
 
 		 176 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000288941  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3032  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.9 
 
 		 176 aa  51.6  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  9.33004e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 		 160 aa  51.2  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0449  dinucleoside polyphosphate hydrolase  25.38 
 
 		 187 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02639  hypothetical protein  44.9 
 
 		 176 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000320087  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2977  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.9 
 
 		 176 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801466  hitchhiker  0.0062852 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0885  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.9 
 
 		 176 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000193658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2976  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.9 
 
 		 176 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.85852e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4096  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.9 
 
 		 176 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580084  hitchhiker  0.00923204 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  31.46 
 
 		 140 aa  50.8  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  27.7 
 
 		 305 aa  50.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1021  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44 
 
 		 173 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000480643  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  39.66 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  39.66 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  40.32 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3129  dinucleoside polyphosphate hydrolase  42.86 
 
 		 174 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000022986  normal  0.998128 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1184  dinucleoside polyphosphate hydrolase  42.86 
 
 		 174 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515571  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  40.32 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0396  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 		 188 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal  0.770982 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0536  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  40.32 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3101  dinucleoside polyphosphate hydrolase  25.2 
 
 		 241 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1261  dinucleoside polyphosphate hydrolase  42.86 
 
 		 174 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000399476  normal  0.124645 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1228  dinucleoside polyphosphate hydrolase  42.86 
 
 		 174 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000133704  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2865  dinucleoside polyphosphate hydrolase  42.86 
 
 		 174 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000404837  normal  0.876176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2947  dinucleoside polyphosphate hydrolase  42.86 
 
 		 174 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000622219  normal  0.254979 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  30.43 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3399  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.84 
 
 		 178 aa  50.8  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0659  mutT/nudix family protein  35.06 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  28.45 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  28.45 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  28.45 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 		 230 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  42.86 
 
 		 181 aa  50.4  0.000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  48.98 
 
 		 155 aa  50.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3625  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38 
 
 		 171 aa  50.4  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.635767  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2173  NUDIX hydrolase  42 
 
 		 176 aa  50.1  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.573949  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2953  dinucleoside polyphosphate hydrolase  24.81 
 
 		 231 aa  50.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1038  dinucleoside polyphosphate hydrolase  42.86 
 
 		 174 aa  50.1  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000156815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3272  dinucleoside polyphosphate hydrolase  42.86 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000105899  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2569  mutT/nudix family protein  32.99 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0391668  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1831  NUDIX hydrolase  42 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  28.69 
 
 		 216 aa  50.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2755  mutT/nudix family protein  32.99 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.801064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29780  ADP-ribose pyrophosphatase  35.82 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 		 194 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  40 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0427  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.64 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.751341  normal  0.0128679 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2945  dinucleoside polyphosphate hydrolase  42.86 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.019417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>