More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5604 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 298 aa  609  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  97.64 
 
 		 298 aa  595  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  66.16 
 
 		 295 aa  356  2.9999999999999997e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  36.18 
 
 		 291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  34.46 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  34.47 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  34.01 
 
 		 298 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  34.01 
 
 		 298 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  34.01 
 
 		 298 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  34.01 
 
 		 298 aa  195  6e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  34.35 
 
 		 298 aa  195  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  34.01 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  39.73 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  33.67 
 
 		 298 aa  192  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  33.67 
 
 		 298 aa  192  7e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  35.12 
 
 		 299 aa  191  9e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 298 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  37.88 
 
 		 293 aa  189  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  37.46 
 
 		 294 aa  189  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  35.27 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  34.25 
 
 		 292 aa  185  8e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  34.11 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  37.68 
 
 		 293 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  37.19 
 
 		 293 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  37.29 
 
 		 292 aa  182  7e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  34.59 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2262  dihydrodipicolinate synthase  34.25 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2234  dihydrodipicolinate synthase  34.25 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2602  dihydrodipicolinate synthase  36.88 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  35.79 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  35.62 
 
 		 291 aa  178  8e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  35.17 
 
 		 297 aa  176  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2961  dihydrodipicolinate synthase  34.88 
 
 		 296 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  35.08 
 
 		 297 aa  176  6e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2262  dihydrodipicolinate synthase  36.21 
 
 		 296 aa  175  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 293 aa  175  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2629  dihydrodipicolinate synthase  36.21 
 
 		 319 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.121971 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  35.93 
 
 		 292 aa  175  7e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  32.43 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  34.93 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  33.9 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  35.12 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  34.74 
 
 		 292 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  35.71 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2640  dihydrodipicolinate synthase  34.88 
 
 		 296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 293 aa  172  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  32.77 
 
 		 290 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 292 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  31.76 
 
 		 293 aa  171  9e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  32.88 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  34.24 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  35.67 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  34.34 
 
 		 295 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  33.45 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 291 aa  170  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  33.93 
 
 		 290 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  32.67 
 
 		 300 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  32.53 
 
 		 290 aa  170  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 		 289 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  32.41 
 
 		 289 aa  169  4e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  31.54 
 
 		 293 aa  169  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  32.88 
 
 		 290 aa  169  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  34.46 
 
 		 292 aa  169  5e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0158  dihydrodipicolinate synthase  36.91 
 
 		 301 aa  169  5e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0298297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4192  dihydrodipicolinate synthase  34.34 
 
 		 295 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  35.99 
 
 		 296 aa  169  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  34.33 
 
 		 297 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  34.47 
 
 		 296 aa  169  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0148  dihydrodipicolinate synthase  36.24 
 
 		 301 aa  168  9e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000206082  hitchhiker  0.0000319288 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  34.34 
 
 		 295 aa  168  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  34.77 
 
 		 292 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  33.67 
 
 		 290 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  32.88 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  34.71 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  34.13 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5246  dihydrodipicolinate synthase  34.83 
 
 		 298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  34.13 
 
 		 296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5613  dihydrodipicolinate synthase  34.83 
 
 		 298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292937  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  35.84 
 
 		 295 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  34.34 
 
 		 300 aa  166  4e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  32.53 
 
 		 290 aa  166  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  35.23 
 
 		 292 aa  166  5e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  34.14 
 
 		 292 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  35.54 
 
 		 298 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1992  dihydrodipicolinate synthase  38.84 
 
 		 291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.122144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2358  dihydrodipicolinate synthase  38.84 
 
 		 291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592923  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  32.42 
 
 		 292 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 290 aa  165  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  33.77 
 
 		 293 aa  165  8e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 295 aa  165  8e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4615  dihydrodipicolinate synthase  35.17 
 
 		 298 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330125  hitchhiker  0.00385635 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  32.44 
 
 		 291 aa  165  9e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09012  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02270)  33.7 
 
 		 298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  32.56 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6171  dihydrodipicolinate synthetase  36.95 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  32.55 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  32.32 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5442  dihydrodipicolinate synthase  34.83 
 
 		 298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0078  dihydrodipicolinate synthase  34.14 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00671629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  31.72 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>