110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5540 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 		 138 aa  279  9e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  60.29 
 
 		 140 aa  170  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  37.98 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  38.52 
 
 		 131 aa  90.9  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  49.38 
 
 		 149 aa  84.3  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  34.07 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  30.3 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3219  protein of unknown function DUF1486  36.43 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247367  hitchhiker  0.000405951 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1710  hypothetical protein  36.09 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.518536  normal  0.0462427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  29.5 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  37.74 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1646  protein of unknown function DUF1486  41.86 
 
 		 152 aa  76.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.081161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1719  protein of unknown function DUF1486  41.86 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  32.35 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6384  hypothetical protein  33.83 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  41.86 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  31.21 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  30.88 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0351  protein of unknown function DUF1486  28.93 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  31.88 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  34.4 
 
 		 185 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4210  hypothetical protein  35.05 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0441  hypothetical protein  30.6 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3928  protein of unknown function DUF1486  32.59 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  33.33 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2801  protein of unknown function DUF1486  32.81 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4651  hypothetical protein  31.25 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  29.6 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5224  hypothetical protein  31.52 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0987  hypothetical protein  34.4 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.983826  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1469  hypothetical protein  34.4 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0249  hypothetical protein  28.7 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000330917  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1354  hypothetical protein  31.2 
 
 		 185 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0339  protein of unknown function DUF1486  30 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1394  hypothetical protein  30.4 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5397  hypothetical protein  30.23 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  0.733155 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2394  protein of unknown function DUF1486  32.26 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7231  protein of unknown function DUF1486  31.03 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.390995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0915  protein of unknown function DUF1486  31.11 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282506  normal  0.0578966 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  29.1 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1107  protein of unknown function DUF1486  31.25 
 
 		 163 aa  57  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2307  protein of unknown function DUF1486  27.14 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0295  protein of unknown function DUF1486  30.3 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3560  protein of unknown function DUF1486  26.04 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4678  protein of unknown function DUF1486  25.9 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000675641 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1595  hypothetical protein  21.9 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000510897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1022  putative lipoprotein  28 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4924  hypothetical protein  27.08 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1179  protein of unknown function DUF1486  26.09 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0659  protein of unknown function DUF1486  23.91 
 
 		 145 aa  52  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0498  hypothetical protein  23.91 
 
 		 145 aa  52  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0035037  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0317  protein of unknown function DUF1486  26.76 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.478711 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0996  protein of unknown function DUF1486  30.3 
 
 		 173 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2668  protein of unknown function DUF1486  31.91 
 
 		 155 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000361014  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1078  beta-lactamase domain protein  28.15 
 
 		 402 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4917  hypothetical protein  25.17 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5713  protein of unknown function DUF1486  26.06 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2604  hypothetical protein  31.96 
 
 		 186 aa  50.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3104  hypothetical protein  32.91 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0633963  normal  0.35406 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0797  putative lipoprotein  26.72 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430815  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0837  putative lipoprotein  26.72 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461005  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0524  hypothetical protein  28.37 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3831  hypothetical protein  23.13 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709956  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0741  hypothetical protein  25.98 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3746  hypothetical protein  24.39 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4442  putative lipoprotein  28 
 
 		 179 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.987994  normal  0.460875 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1104  hypothetical protein  30.93 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0489751  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1882  hypothetical protein  30.93 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0563369  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0972  hypothetical protein  30.53 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.284776  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1546  hypothetical protein  30.93 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0209  hypothetical protein  30.93 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0131745  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1703  hypothetical protein  30.93 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1729  hypothetical protein  30.93 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0373687  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0955  hypothetical protein  30.93 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.949837  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4630  protein of unknown function DUF1486  31.36 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0822  hypothetical protein  25 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.47066  unclonable  0.00000965706 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36501  predicted protein  25.38 
 
 		 284 aa  47.4  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260623  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.76 
 
 		 316 aa  47  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0746  hypothetical protein  25.98 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00470157  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0455  hypothetical protein  27.2 
 
 		 212 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0749  hypothetical protein  26.4 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0932  putative lipoprotein  25.98 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6654500000000002e-29 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0776  protein of unknown function DUF1486  27.87 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0819  hypothetical protein  30.38 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4152  hypothetical protein  27.2 
 
 		 214 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2953  ester cyclase-like  23.31 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2641  hypothetical protein  28.42 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0292741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4712  protein of unknown function DUF1486  27.34 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.719641 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3693  hypothetical protein  26.4 
 
 		 214 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1691  protein of unknown function DUF1486  30 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1610  protein of unknown function DUF1486  25.56 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.692563  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0474  hypothetical protein  26.4 
 
 		 212 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1300  hypothetical protein  26.53 
 
 		 172 aa  43.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.968882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5449  hypothetical protein  27.27 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3667  hypothetical protein  24.49 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4245  hypothetical protein  27.21 
 
 		 176 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.13713 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0930  putative lipoprotein  25.6 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0619  hypothetical protein  26.81 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.15035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6186  protein of unknown function DUF1486  20.59 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0892  putative lipoprotein  25.78 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>