142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5465 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012792  Vapar_5465  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  212  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2206  hypothetical protein  52.27 
 
 
90 aa  85.9  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.788583 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2713  hypothetical protein  48.81 
 
 
95 aa  82.4  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550413  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2946  hypothetical protein  46.81 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1504  hypothetical protein  44.19 
 
 
98 aa  77.4  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0681  hypothetical protein  41.49 
 
 
101 aa  75.9  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.126872 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2768  hypothetical protein  43.02 
 
 
96 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2765  hypothetical protein  40.66 
 
 
96 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1807  acetyltransferase-like  43.53 
 
 
110 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3541  GCN5-related N-acetyltransferase  40.86 
 
 
94 aa  73.2  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0392636  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1808  acetyltransferase  39.08 
 
 
93 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02810  predicted acetyltransferase  39.36 
 
 
96 aa  71.2  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1761  acetyltransferase  39.53 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0128615  normal  0.0715534 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3100  hypothetical protein  46.15 
 
 
99 aa  70.5  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386761  normal  0.125352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2724  hypothetical protein  38.04 
 
 
96 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0839227  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3163  hypothetical protein  37.63 
 
 
96 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.919705  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0850  hypothetical protein  40.4 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.348433  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4391  hypothetical protein  38.64 
 
 
90 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.946399  normal  0.0400185 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1960  hypothetical protein  37.23 
 
 
96 aa  66.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3817  hypothetical protein  35.71 
 
 
99 aa  66.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.4231  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0132  hypothetical protein  34.41 
 
 
97 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1973  acetyltransferase-like protein  43.82 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00670  hypothetical protein  40.66 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83104  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3439  acetyltransferase  36.56 
 
 
102 aa  64.3  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1868  hypothetical protein  40.48 
 
 
112 aa  63.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.551038  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0141  hypothetical protein  36.14 
 
 
97 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2243  acetyltransferase-like protein  36.14 
 
 
93 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3077  putative acetyltransferase protein  36.05 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.402192 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3969  hypothetical protein  38.82 
 
 
85 aa  62  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1290  acetyltransferase-like protein  31.46 
 
 
109 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.4967 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2664  hypothetical protein  35.63 
 
 
100 aa  61.6  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0595784 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4762  acetyltransferase-like protein  31.73 
 
 
110 aa  61.6  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1753  acetyltransferase  37.5 
 
 
100 aa  61.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.363811  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0165  acetyltransferase-like protein  45.45 
 
 
123 aa  61.2  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2917  GCN5-related N-acetyltransferase  35.56 
 
 
97 aa  61.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3266  hypothetical protein  37.93 
 
 
96 aa  60.5  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.709169  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1955  acetyltransferase-like  37.65 
 
 
116 aa  60.5  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2548  hypothetical protein  34.48 
 
 
89 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17311  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0481  acetyltransferase  36.56 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0068  hypothetical protein  35.23 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0923  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000523362  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  36.36 
 
 
834 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3334  putative acetyltransferase protein  36.05 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.474868 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1104  GCN5-related N-acetyltransferase  38.2 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4571  acetyltransferase-like protein  31.63 
 
 
100 aa  57.8  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017414  normal  0.441667 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3098  hypothetical protein  39.76 
 
 
96 aa  57.4  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207624  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3553  hypothetical protein  34.41 
 
 
99 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2302  acetyltransferase-like protein  37.37 
 
 
108 aa  56.2  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000367089  hitchhiker  0.00188481 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0804  hypothetical protein  34.57 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4214  acetyltransferase-like protein  34.09 
 
 
95 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4425  GCN5-related N-acetyltransferase  34.07 
 
 
95 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05101  acetyltransferase  32.56 
 
 
114 aa  55.1  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03020  predicted acetyltransferase  37.8 
 
 
123 aa  54.7  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3806  hypothetical protein  36.78 
 
 
93 aa  54.3  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191308  normal  0.244144 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0293  acetyltransferase-like protein  36.25 
 
 
111 aa  54.3  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0300747  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3475  acetyltransferase  36.14 
 
 
111 aa  54.3  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1574  hypothetical protein  30.34 
 
 
98 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1594  hypothetical protein  30.23 
 
 
97 aa  53.9  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106902  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2492  hypothetical protein  36.47 
 
 
96 aa  53.5  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416236  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2375  hypothetical protein  31.11 
 
 
94 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230373  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2274  hypothetical protein  36.78 
 
 
95 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000000180646  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0194  acetyltransferase-like protein  38.55 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0562  hypothetical protein  34.48 
 
 
96 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2072  hypothetical protein  36.78 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000410313  normal  0.04757 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0278  acetyltransferase-like protein  35.06 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2603  hypothetical protein  31.4 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2744  acetyltransferase-like  36.49 
 
 
377 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3505  hypothetical protein  31.82 
 
 
100 aa  51.6  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0090  hypothetical protein  32.18 
 
 
94 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000798856  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1537  hypothetical protein  32.88 
 
 
97 aa  52  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5880  hypothetical protein  32.22 
 
 
91 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.630682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3723  hypothetical protein  31.4 
 
 
87 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4010  hypothetical protein  35.8 
 
 
115 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000057579  normal  0.556915 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2008  hypothetical protein  39.24 
 
 
110 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3734  hypothetical protein  34.48 
 
 
111 aa  51.6  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0465145  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0789  hypothetical protein  40.74 
 
 
113 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1014  hypothetical protein  32.22 
 
 
117 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.411227 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0510  acetyltransferase-like protein  32.1 
 
 
109 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2326  GCN5-related N-acetyltransferase  43.33 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0257  GCN5-related N-acetyltransferase  40.62 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00965317  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4858  hypothetical protein  30.99 
 
 
81 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1003  hypothetical protein  35.29 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709962  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2928  acetyltransferase-like protein  41.03 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.408165 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  31.88 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0084  hypothetical protein  30.95 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0061  hypothetical protein  38.18 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.372722 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1764  hypothetical protein  33.33 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000155918  hitchhiker  0.000000000000406701 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0844  hypothetical protein  33.33 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001234  predicted acetyltransferase  33.78 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546036  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0921  hypothetical protein  31.03 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.513329  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0652  hypothetical protein  36.14 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3447  hypothetical protein  33.33 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000030181  hitchhiker  0.000684662 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1924  hypothetical protein  33.33 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000705286  hitchhiker  0.00000000000000488804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0999  hypothetical protein  34.18 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17450  predicted acetyltransferase  28.28 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.107922  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2323  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000526442  hitchhiker  0.0000374352 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1912  hypothetical protein  38.36 
 
 
79 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00117595  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3632  hypothetical protein  33.33 
 
 
111 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0083  hypothetical protein  28.57 
 
 
87 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4721  hypothetical protein  37.18 
 
 
103 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534046  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>