122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5443 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012792  Vapar_5443  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  100 
 
 
625 aa  1273    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3305  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  36.13 
 
 
611 aa  346  8e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.0581087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4534  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  36.63 
 
 
609 aa  324  4e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19075  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0414  peptidase S15  31.49 
 
 
763 aa  237  5.0000000000000005e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272153  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1796  peptidase S15  28.04 
 
 
569 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3114  peptidase S15  29.28 
 
 
560 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.976266  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1123  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.83 
 
 
678 aa  111  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.361162  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5294  peptidase S15  27.78 
 
 
599 aa  110  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1732  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.51 
 
 
585 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.116958  hitchhiker  0.00967983 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4675  peptidase S15  28.01 
 
 
615 aa  108  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0378329  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0461  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  28.55 
 
 
550 aa  108  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5053  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  27.42 
 
 
561 aa  104  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.842061  normal  0.996249 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1772  putative esterase  23.21 
 
 
598 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0442239  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2615  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.39 
 
 
599 aa  103  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465007  normal  0.945434 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06743  hydrolase, CocE/NonD family, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00600)  24.02 
 
 
793 aa  100  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0144437 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0241  peptidase S15  26.36 
 
 
673 aa  98.2  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2108  peptidase S15  32.52 
 
 
782 aa  97.1  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681302  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11239  hypothetical protein  25.38 
 
 
561 aa  97.1  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000144699  normal  0.0575196 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2093  peptidase S15  23.74 
 
 
668 aa  96.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.418145 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2913  hydrolase CocE/NonD family protein  25.72 
 
 
677 aa  95.9  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0938  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.28 
 
 
611 aa  95.5  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.274521  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2616  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.92 
 
 
560 aa  95.1  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2670  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.92 
 
 
560 aa  95.1  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2221  peptidase S15  25.29 
 
 
677 aa  94.4  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0930  peptidase S15  26.66 
 
 
714 aa  93.6  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674729  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2869  peptidase S15  23.57 
 
 
644 aa  92.4  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1029  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.91 
 
 
594 aa  91.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1770  peptidase S15  24.27 
 
 
668 aa  91.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11190  putative hydrolase, CocE/NonD family  24.84 
 
 
581 aa  92  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.290865  normal  0.803564 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0930  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like  23.05 
 
 
547 aa  90.1  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1723  peptidase S15  25.76 
 
 
677 aa  89.7  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463427  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0437  peptidase S15  22.86 
 
 
540 aa  87  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2785  peptidase S15  24.18 
 
 
668 aa  86.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08460  putative hydrolase, CocE/NonD family  25.52 
 
 
673 aa  86.7  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.8708  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4266  peptidase S15  23.02 
 
 
553 aa  86.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220247  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3839  peptidase S15  22.81 
 
 
670 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2359  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  24.96 
 
 
595 aa  84.3  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.10843  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3343  putative acylase  22.54 
 
 
636 aa  83.2  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.843899  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1680  dipeptidyl-peptidase  24.13 
 
 
670 aa  83.2  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2060  dipeptidyl-peptidase  24.32 
 
 
670 aa  83.6  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1253  X-Pro dipeptidyl-peptidase  23.21 
 
 
663 aa  82.4  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0391  peptidase S15  25.19 
 
 
668 aa  82  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1499  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  22.73 
 
 
604 aa  81.3  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000124334  normal  0.885769 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0908  peptidase S15  25.52 
 
 
680 aa  81.3  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1297  acylase and diesterase protein  25.61 
 
 
608 aa  80.9  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.36424  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18520  putative hydrolase, CocE/NonD family  23.32 
 
 
534 aa  80.5  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5310  peptidase S15  21.76 
 
 
542 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1942  peptidase S15  23.37 
 
 
670 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4503  peptidase S15  23.46 
 
 
667 aa  78.2  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628764  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2454  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.66 
 
 
595 aa  78.2  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0525399  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4096  peptidase S15  23.17 
 
 
555 aa  75.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127358  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2184  peptidase S15  22.8 
 
 
665 aa  75.5  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.173724 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1900  peptidase S15  23.81 
 
 
705 aa  73.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138312  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2383  peptidase S15  23.55 
 
 
571 aa  73.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1596  peptidase S15  22.98 
 
 
679 aa  73.6  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6422  peptidase S15  22.39 
 
 
667 aa  73.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0843885  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00440  putative hydrolase, CocE/NonD family  29.15 
 
 
637 aa  73.2  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.403131 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0774  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.42 
 
 
576 aa  72.8  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000168063 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1111  peptidase S15  24.07 
 
 
677 aa  72  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4832  peptidase S15  35.29 
 
 
679 aa  71.2  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1252  peptidase S15  22.8 
 
 
667 aa  70.9  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.680341  normal  0.327656 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3814  peptidase S15  23.05 
 
 
650 aa  69.7  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4056  peptidase S15  31.11 
 
 
655 aa  69.3  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4135  peptidase S15  19.53 
 
 
541 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.427793 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0413  peptidase S15  21.84 
 
 
690 aa  67.4  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.928819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3229  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.01 
 
 
588 aa  66.6  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4096  peptidase S15  19.53 
 
 
541 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6346  peptidase S15  22.77 
 
 
612 aa  66.6  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  21.15 
 
 
674 aa  65.1  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1500  peptidase S15  24.06 
 
 
678 aa  65.1  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1361  hydrolase CocE/NonD family protein  23.64 
 
 
674 aa  65.1  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307565  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11864  hypothetical protein  31.58 
 
 
628 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.488629  normal  0.930954 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2848  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  29.94 
 
 
645 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1460  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  24.32 
 
 
607 aa  62  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0269  peptidase S15  23.57 
 
 
745 aa  61.6  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.485084  normal  0.582003 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3241  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  29.96 
 
 
587 aa  61.6  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972915  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6822  peptidase S15  26.67 
 
 
503 aa  61.2  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0815  hydrolase CocE/NonD family protein  23.45 
 
 
557 aa  60.1  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.560842  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2821  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  29.38 
 
 
626 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2865  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  29.38 
 
 
626 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2049  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  34.82 
 
 
577 aa  58.9  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.641906  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0309  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  20.62 
 
 
663 aa  58.5  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3228  peptidase S15  23.58 
 
 
627 aa  58.2  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.46374 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4945  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  31.61 
 
 
605 aa  57.8  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0518837  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0343  glutaryl-7-ACA acylase precursor  20.9 
 
 
660 aa  57.4  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00753978  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3347  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  32.48 
 
 
570 aa  57.4  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0310858 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07789  conserved hypothetical protein  22.91 
 
 
588 aa  56.2  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183202  normal  0.814624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2493  peptidase S15  23.18 
 
 
576 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194166  normal  0.10324 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2820  peptidase S15  20.78 
 
 
638 aa  55.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139695  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0130  hydrolase CocE/NonD family protein subfamily  24.83 
 
 
572 aa  54.7  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0347  peptidase S15  23.73 
 
 
686 aa  54.3  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2349  peptidase S15  22.06 
 
 
690 aa  53.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1556  CocE/NonD family hydrolase  24.6 
 
 
572 aa  53.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04480  putative hydrolase, CocE/NonD family  26.29 
 
 
653 aa  52.4  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000670988 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3763  peptidase S15  29.5 
 
 
667 aa  51.6  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3635  peptidase S15  22.28 
 
 
574 aa  51.6  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.958468  normal  0.454344 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08476  conserved hypothetical protein  25 
 
 
591 aa  51.6  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.706032  normal  0.916636 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00338  alpha-amino acid ester hydrolase  26.94 
 
 
637 aa  51.2  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.015152  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3036  hypothetical protein  29.5 
 
 
667 aa  50.8  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1638  CocE/NonD family hydrolase  24.26 
 
 
567 aa  50.8  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>