More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5442 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  100 
 
 
339 aa  675    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0901  acyltransferase 3  37.89 
 
 
382 aa  175  9e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.883009 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1531  acyltransferase 3  37.43 
 
 
382 aa  168  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2326  acyltransferase 3  37.68 
 
 
402 aa  162  6e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  33.43 
 
 
695 aa  139  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  29.78 
 
 
603 aa  139  7.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  29.78 
 
 
603 aa  139  7.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  30.16 
 
 
604 aa  136  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  30.16 
 
 
604 aa  136  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  31.98 
 
 
435 aa  136  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2590  acyltransferase 3  31.59 
 
 
360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  34.87 
 
 
682 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  31.54 
 
 
671 aa  130  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  31.16 
 
 
637 aa  130  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4875  acyltransferase 3  31.73 
 
 
671 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  32.96 
 
 
656 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  31.09 
 
 
643 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  32.74 
 
 
695 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3190  acyltransferase 3  34.97 
 
 
357 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  31.75 
 
 
641 aa  124  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  31.3 
 
 
645 aa  123  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  26.93 
 
 
660 aa  122  6e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0723  acyltransferase 3  36.25 
 
 
632 aa  122  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  28.46 
 
 
607 aa  120  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  34.6 
 
 
642 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0131  acyltransferase 3  33.89 
 
 
726 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.971187  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0121  acyltransferase 3  33.89 
 
 
726 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.695544  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0140  acyltransferase 3  33.89 
 
 
726 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.939637 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  33.55 
 
 
667 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  31.47 
 
 
679 aa  119  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  32.85 
 
 
675 aa  119  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  30.72 
 
 
640 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  32.42 
 
 
629 aa  119  9e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2137  hypothetical protein  28.11 
 
 
602 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3115  acyltransferase 3  34.44 
 
 
546 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.228266  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2066  acyltransferase 3  47.4 
 
 
656 aa  116  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  30.88 
 
 
632 aa  116  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  34.92 
 
 
635 aa  115  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  31.76 
 
 
759 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  31.58 
 
 
647 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  30.75 
 
 
690 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  28.8 
 
 
616 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26680  predicted acyltransferase  33.53 
 
 
679 aa  114  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  31.76 
 
 
629 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0174  acyltransferase-like  30.09 
 
 
358 aa  113  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1859  acyltransferase 3  30.32 
 
 
671 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590213  normal  0.294721 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  28.69 
 
 
711 aa  112  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  30.54 
 
 
673 aa  112  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  30.77 
 
 
681 aa  112  9e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1385  acyltransferase 3  34.16 
 
 
635 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0794354 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  28.37 
 
 
665 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  30.56 
 
 
675 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  30.5 
 
 
684 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1310  acyltransferase 3  32.43 
 
 
621 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.502976  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  30.56 
 
 
695 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2192  acyltransferase 3  33.43 
 
 
625 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717297  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  31.99 
 
 
665 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  30.9 
 
 
710 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1252  acyltransferase 3  27.3 
 
 
673 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  30.9 
 
 
710 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  29.43 
 
 
662 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  29.57 
 
 
380 aa  110  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4010  acyltransferase 3  33.12 
 
 
383 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.54643  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  34.52 
 
 
675 aa  109  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  26.78 
 
 
603 aa  109  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  32.39 
 
 
671 aa  109  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  32.2 
 
 
718 aa  108  9.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  27.1 
 
 
660 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  27.3 
 
 
658 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  29.97 
 
 
690 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5518  acyltransferase 3  31.96 
 
 
604 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224376  normal  0.367583 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2409  hypothetical protein  28.95 
 
 
605 aa  108  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.372977  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  27.3 
 
 
658 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  27.14 
 
 
583 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  30.36 
 
 
635 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01286  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  32.59 
 
 
344 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.591708  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  32.45 
 
 
777 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5281  hypothetical protein  32.13 
 
 
644 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458254  normal  0.151011 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  28.34 
 
 
690 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  29.3 
 
 
683 aa  106  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  33.45 
 
 
350 aa  106  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10112  transmembrane acyltransferase  31.35 
 
 
685 aa  106  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  27.35 
 
 
656 aa  106  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  26.46 
 
 
660 aa  106  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3527  acyltransferase 3  32.41 
 
 
408 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138554  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3908  acyltransferase 3  34.08 
 
 
372 aa  105  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0921466  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  34.48 
 
 
685 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3181  acyltransferase 3  31.91 
 
 
378 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000062652  decreased coverage  0.00000145488 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  32.31 
 
 
630 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69170  putative O-antigen acetylase  31.98 
 
 
662 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21020  predicted acyltransferase  30.59 
 
 
676 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00110133  normal  0.49378 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5547  acyltransferase family protein  29.06 
 
 
628 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1920  acyltransferase 3  32.18 
 
 
383 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0265  acyltransferase 3  33.01 
 
 
645 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796474  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  30.12 
 
 
651 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  29.57 
 
 
691 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  27.07 
 
 
657 aa  104  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2881  acyltransferase 3  32.79 
 
 
402 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0475  acyltransferase 3  29.85 
 
 
713 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  32.17 
 
 
716 aa  103  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>