276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5396 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 
159 aa  330  5e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  81.65 
 
 
159 aa  286  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  79.25 
 
 
159 aa  279  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  79.87 
 
 
159 aa  278  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  79.87 
 
 
159 aa  278  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  79.87 
 
 
159 aa  278  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  81.13 
 
 
159 aa  278  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  74.21 
 
 
159 aa  268  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  74.21 
 
 
159 aa  265  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  72.33 
 
 
159 aa  255  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  70.44 
 
 
159 aa  253  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  69.81 
 
 
159 aa  250  7e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  71.52 
 
 
159 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  71.52 
 
 
159 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  68.55 
 
 
159 aa  234  5.0000000000000005e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  59.12 
 
 
159 aa  214  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  50.63 
 
 
159 aa  176  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  49.66 
 
 
162 aa  161  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.95 
 
 
163 aa  157  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.39 
 
 
153 aa  157  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  45.52 
 
 
145 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  48.95 
 
 
159 aa  151  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.67 
 
 
151 aa  151  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.28 
 
 
146 aa  150  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.95 
 
 
152 aa  149  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50 
 
 
154 aa  149  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  50 
 
 
151 aa  147  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  42.07 
 
 
145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  48.32 
 
 
154 aa  144  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.84 
 
 
163 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.15 
 
 
163 aa  144  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.89 
 
 
157 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.52 
 
 
145 aa  142  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.59 
 
 
153 aa  142  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  47.18 
 
 
157 aa  141  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  44.83 
 
 
145 aa  141  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  46.53 
 
 
145 aa  140  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  49.3 
 
 
158 aa  140  9e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  46.53 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  42.47 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.52 
 
 
145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  45.14 
 
 
145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  47.55 
 
 
154 aa  138  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  41.5 
 
 
149 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.9 
 
 
150 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.07 
 
 
145 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  44.44 
 
 
145 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.07 
 
 
145 aa  136  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.44 
 
 
146 aa  135  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  44.44 
 
 
145 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.69 
 
 
145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  43.05 
 
 
158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.75 
 
 
145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  43.75 
 
 
145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  44.44 
 
 
153 aa  134  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  41.67 
 
 
145 aa  134  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.38 
 
 
145 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.75 
 
 
145 aa  134  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.38 
 
 
145 aa  133  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  40 
 
 
145 aa  133  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.69 
 
 
145 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  40.28 
 
 
145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.45 
 
 
155 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.85 
 
 
153 aa  130  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  46.15 
 
 
155 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  41.43 
 
 
147 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1680  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.29 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581321  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2014  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  39.29 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.14 
 
 
153 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  43.15 
 
 
150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.51 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  47.86 
 
 
157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  47.14 
 
 
167 aa  128  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.97 
 
 
155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  39.29 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  42.34 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  43.66 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  41.06 
 
 
150 aa  125  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  46.1 
 
 
158 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  45 
 
 
157 aa  124  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  47.18 
 
 
158 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.85 
 
 
152 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6288  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.93 
 
 
153 aa  122  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00669161  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2658  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.07 
 
 
151 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764156  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.85 
 
 
152 aa  121  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1182  alkylhydroperoxidase  43.36 
 
 
163 aa  120  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  39.31 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2179  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.5 
 
 
146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  42.86 
 
 
167 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1402  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.29 
 
 
146 aa  118  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.85 
 
 
150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 
147 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  39.13 
 
 
143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.85 
 
 
150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.85 
 
 
150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.85 
 
 
150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.85 
 
 
150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.85 
 
 
150 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6098  alkylhydroperoxidase  39.86 
 
 
149 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.86 
 
 
283 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>