40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5375 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5375  malonate transporter, MadM subunit  100 
 
 		 254 aa  484  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0760178  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0787  malonate transporter, MadM subunit  83.86 
 
 		 255 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2051  malonate transporter, MadM subunit  83.86 
 
 		 255 aa  410  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1240  malonate transporter, MadM subunit  83.86 
 
 		 255 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761133  normal  0.122304 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1268  malonate transporter, MadM subunit  83.86 
 
 		 255 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.548394  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4411  malonate/sodium symporter MadM subunit  83.86 
 
 		 255 aa  411  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.676957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6324  malonate transporter, MadM subunit  82.68 
 
 		 255 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1146  malonate transporter, MadM subunit  82.68 
 
 		 255 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523152  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1158  malonate transporter, MadM subunit  82.68 
 
 		 255 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2804  malonate transporter, M subunit  80.71 
 
 		 255 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4945  malonate transporter, MadM subunit  79.84 
 
 		 254 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0533752 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3869  malonate transporter, MadM subunit  79.84 
 
 		 254 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5294  malonate/sodium symporter MadM subunit  77.95 
 
 		 254 aa  391  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0823289  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3038  malonate transporter, M subunit  79.53 
 
 		 255 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.218243  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0537  malonate transporter, MadM subunit  79.53 
 
 		 255 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.976582  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5079  malonate transporter, MadM subunit  78.35 
 
 		 254 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1450  malonate transporter, MadM subunit  79.53 
 
 		 255 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.53305  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0616  malonate transporter, MadM subunit  79.53 
 
 		 255 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1254  malonate transporter, MadM subunit  79.53 
 
 		 255 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0450  malonate/sodium symporter MadM subunit  78.74 
 
 		 254 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1612  malonate/sodium symporter MadM subunit  80.08 
 
 		 259 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1580  malonate transporter, M subunit  79.53 
 
 		 255 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191573  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1481  malonate transporter, MadM subunit  79.13 
 
 		 255 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315449  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2446  malonate transporter, MadM subunit  79.92 
 
 		 254 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0044  malonate transporter, MadM subunit  70.08 
 
 		 254 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0292354 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4284  malonate/sodium symporter MadM subunit  68.38 
 
 		 254 aa  335  3.9999999999999995e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0339134  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3149  malonate transporter, MadM subunit  68.77 
 
 		 254 aa  332  3e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6859  malonate transporter, MadM subunit  68.5 
 
 		 254 aa  330  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3195  malonate transporter, MadM subunit  67.72 
 
 		 254 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.585208 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02640  putative malonate transporter, MadM subunit  62.99 
 
 		 254 aa  300  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.737312  normal  0.519007 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0300  malonate transporter subunit MadM  63.39 
 
 		 254 aa  299  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.62285  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1147  malonate/sodium symporter, MadM subunit  59.92 
 
 		 252 aa  296  2e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.141999  normal  0.564343 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0953  malonate/sodium symporter MadM subunit  62.85 
 
 		 257 aa  293  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3290  malonate transporter, MadM subunit  61.41 
 
 		 254 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.864394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1551  malonate transporter, MadM subunit  60.41 
 
 		 252 aa  278  5e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0388918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2875  signal transduction histidine kinase, LytS  63.24 
 
 		 254 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.369454  normal  0.783252 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10360  malonate transporter, MadM subunit  61.11 
 
 		 255 aa  273  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1065  malonate/sodium symporter MadM subunit  59.06 
 
 		 254 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1330  malonate/sodium symporter MadM subunit  57.31 
 
 		 257 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0218  putative malonate transporter, MadM subunit  57.14 
 
 		 36 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.826701  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>