162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5289 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5289  protein of unknown function UPF0016  100 
 
 		 187 aa  366  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  79.12 
 
 		 204 aa  285  4e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  76.92 
 
 		 192 aa  278  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  76.92 
 
 		 192 aa  276  9e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4126  hypothetical protein  76.37 
 
 		 192 aa  276  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0520  hypothetical protein  75.57 
 
 		 187 aa  266  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  71.35 
 
 		 188 aa  262  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0094  hypothetical protein  69.19 
 
 		 190 aa  256  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169792 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  69.15 
 
 		 204 aa  255  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4103  hypothetical protein  70.43 
 
 		 188 aa  256  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  71.35 
 
 		 190 aa  251  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  66.13 
 
 		 203 aa  249  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1927  protein of unknown function UPF0016  70.79 
 
 		 190 aa  248  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  71.43 
 
 		 196 aa  247  7e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  68.82 
 
 		 191 aa  246  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  67.39 
 
 		 206 aa  242  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  63.98 
 
 		 190 aa  239  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  63.98 
 
 		 190 aa  239  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  63.98 
 
 		 218 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  63.44 
 
 		 218 aa  238  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  63.44 
 
 		 218 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  66.11 
 
 		 190 aa  236  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  66.11 
 
 		 190 aa  236  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  62.9 
 
 		 218 aa  236  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  66.11 
 
 		 190 aa  236  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  66.11 
 
 		 190 aa  236  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  66.11 
 
 		 190 aa  236  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  66.11 
 
 		 190 aa  236  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  66.11 
 
 		 190 aa  236  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  65.56 
 
 		 190 aa  234  6e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  61.29 
 
 		 190 aa  234  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  61.29 
 
 		 234 aa  232  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0366  putative transmembrane protein  67.03 
 
 		 191 aa  230  8.000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0887  hypothetical protein  66.85 
 
 		 241 aa  226  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  59.14 
 
 		 190 aa  223  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0577  hypothetical protein  59.68 
 
 		 193 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.188553  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  54.59 
 
 		 185 aa  219  3e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2039  protein of unknown function UPF0016  60.22 
 
 		 196 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.589069  hitchhiker  0.00000000898807 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  54.05 
 
 		 185 aa  215  4e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0447  hypothetical protein  57.75 
 
 		 191 aa  206  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0985  hypothetical protein  58.38 
 
 		 194 aa  197  9e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3666  hypothetical protein  63.31 
 
 		 194 aa  195  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  55.19 
 
 		 191 aa  195  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  58.38 
 
 		 194 aa  194  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4713  hypothetical protein  56.52 
 
 		 194 aa  189  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133421  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001996  hypothetical protein  51.93 
 
 		 184 aa  188  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0241  hypothetical protein  55.25 
 
 		 191 aa  187  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1438  protein of unknown function UPF0016  53.51 
 
 		 195 aa  186  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00451  hypothetical protein  51.93 
 
 		 184 aa  186  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0802  hypothetical protein  56.52 
 
 		 194 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2778  hypothetical protein  56.28 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2497  hypothetical protein  49.72 
 
 		 200 aa  182  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4428  hypothetical protein  56.52 
 
 		 194 aa  181  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1080  membrane protein  51.14 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0760  hypothetical protein  56.52 
 
 		 194 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2409  hypothetical protein  51.37 
 
 		 183 aa  174  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.936736  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0788  hypothetical protein  56.52 
 
 		 194 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.632611 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  50 
 
 		 189 aa  174  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  52.43 
 
 		 188 aa  173  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0575  hypothetical protein  50.83 
 
 		 184 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0895  hypothetical protein  49.73 
 
 		 184 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.363973  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3467  hypothetical protein  49.73 
 
 		 184 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0950509  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3590  hypothetical protein  50.28 
 
 		 184 aa  171  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.976053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3391  protein of unknown function UPF0016  50.28 
 
 		 184 aa  171  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0682  hypothetical protein  50.27 
 
 		 184 aa  170  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.634771  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3626  hypothetical protein  57.06 
 
 		 185 aa  168  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0640  hypothetical protein  48.11 
 
 		 184 aa  166  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3189  hypothetical protein  49.72 
 
 		 184 aa  166  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.372005  normal  0.740442 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1560  membrane protein-like protein  56.91 
 
 		 190 aa  166  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00722707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3880  hypothetical protein  48.15 
 
 		 188 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000226161  hitchhiker  0.000000250469 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2072  hypothetical protein  48.07 
 
 		 201 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0921348  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41250  hypothetical protein  59.65 
 
 		 193 aa  166  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396742  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41260  hypothetical protein  46.7 
 
 		 194 aa  164  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140731  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  50.57 
 
 		 187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61260  hypothetical protein  59.17 
 
 		 192 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5275  hypothetical protein  60.98 
 
 		 192 aa  160  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.932867  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3939  hypothetical protein  46.81 
 
 		 204 aa  160  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143914  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0488  hypothetical protein  48.35 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1071  hypothetical protein  49.19 
 
 		 197 aa  158  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0946  hypothetical protein  51.38 
 
 		 198 aa  158  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.0960568 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0909  hypothetical protein  50.27 
 
 		 197 aa  158  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0121906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0516  protein of unknown function UPF0016  47.8 
 
 		 187 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113311  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3028  hypothetical protein  50.83 
 
 		 198 aa  156  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.521433 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0914  hypothetical protein  49.72 
 
 		 184 aa  152  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2940  hypothetical protein  48.9 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.835594  normal  0.0290979 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0521  protein of unknown function UPF0016  47.25 
 
 		 187 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  37.57 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  38.74 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3202  hypothetical protein  54.37 
 
 		 102 aa  104  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10240  predicted membrane protein  37.7 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0794  hypothetical protein  35 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552893  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0745  hypothetical protein  36.17 
 
 		 189 aa  101  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0996219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2117  hypothetical protein  38.42 
 
 		 194 aa  101  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  34.81 
 
 		 216 aa  101  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1345  protein of unknown function UPF0016  36.67 
 
 		 212 aa  101  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1056  hypothetical protein  36.26 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  34.44 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1084  protein of unknown function UPF0016  35.56 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4708  hypothetical protein  38.71 
 
 		 261 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.667531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2016  hypothetical protein  36.36 
 
 		 256 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>