More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5261 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_5261  Nucleotidyl transferase  100 
 
 
236 aa  474  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0194  nucleotidyl transferase  63.9 
 
 
247 aa  302  4e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0983981 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4057  nucleotidyl transferase  66.24 
 
 
245 aa  301  6e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3308  nucleotidyl transferase  63.07 
 
 
271 aa  298  4e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3958  nucleotidyl transferase  63.07 
 
 
271 aa  298  5e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0085  nucleotidyl transferase  62.5 
 
 
272 aa  295  4e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.420165  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4583  nucleotidyl transferase  65.83 
 
 
263 aa  288  6e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.693762  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0937  nucleotidyl transferase  56.72 
 
 
272 aa  251  5e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4828  nucleotidyl transferase  58.72 
 
 
232 aa  237  9e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0257  putative mannose-1-phosphate guanyltransferase-related protein  52.1 
 
 
234 aa  216  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2073  nucleotidyl transferase  50.22 
 
 
220 aa  192  5e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1576  Nucleotidyl transferase  48.55 
 
 
238 aa  189  3e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1872  nucleotidyl transferase  47.93 
 
 
236 aa  189  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3416  nucleotidyl transferase  47.88 
 
 
250 aa  188  8e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.307515  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2335  putative nucleotidyl transferase  50 
 
 
237 aa  183  2e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.512409 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1452  Nucleotidyl transferase  48.94 
 
 
243 aa  182  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  48.72 
 
 
222 aa  174  1e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0867  nucleotidyl transferase  47.66 
 
 
222 aa  170  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0335423  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0599  nucleotidyltransferase family protein  50.22 
 
 
232 aa  169  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3074  nucleotidyl transferase  43.4 
 
 
232 aa  169  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2814  nucleotidyl transferase  44.17 
 
 
226 aa  167  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164974  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3204  nucleotidyl transferase  46.86 
 
 
221 aa  167  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0602858  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2300  Nucleotidyl transferase  47.44 
 
 
230 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.706405  normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1018  nucleotidyl transferase  46.38 
 
 
228 aa  164  8e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352994  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4026  putative nucleotidyl transferase  44.17 
 
 
241 aa  164  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3634  nucleotidyltransferase family protein  46.44 
 
 
226 aa  164  1e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1652  nucleotidyl transferase  43.53 
 
 
232 aa  163  2e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1084  nucleotidyl transferase  46.96 
 
 
225 aa  163  2e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166383  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2883  nucleotidyl transferase  44.08 
 
 
239 aa  163  2e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  2.45528e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3110  nucleotidyl transferase  46.25 
 
 
222 aa  163  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133152  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0673  Nucleotidyl transferase  43.98 
 
 
242 aa  162  4e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1019  nucleotidyl transferase  45.8 
 
 
229 aa  161  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176753  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0394  nucleotidyl transferase  42.8 
 
 
232 aa  162  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.824565  normal  0.063826 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6040  nucleotidyl transferase  45.71 
 
 
239 aa  162  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2147  nucleotidyl transferase  47.23 
 
 
221 aa  161  8e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0910  nucleotidyl transferase  45.83 
 
 
222 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00048093  normal  0.372808 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0218  nucleotidyl transferase  38.8 
 
 
274 aa  160  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0125725 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4008  nucleotidyl transferase  46.38 
 
 
223 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0402  Nucleotidyl transferase  41.8 
 
 
234 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1051  nucleotidyl transferase  46.77 
 
 
225 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00300889  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3307  Nucleotidyl transferase  46.77 
 
 
225 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.276059  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0994  nucleotidyl transferase  44.58 
 
 
225 aa  159  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.65594  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2740  nucleotidyl transferase  44.9 
 
 
240 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518203  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0982  nucleotidyl transferase  45.56 
 
 
225 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0968395  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2713  nucleotidyl transferase  44.9 
 
 
240 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0969  nucleotidyl transferase  45.19 
 
 
229 aa  159  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0165491  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2101  nucleotidyl transferase  44.9 
 
 
240 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.539682  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  46.61 
 
 
223 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  47.41 
 
 
223 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  47.41 
 
 
223 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0127  nucleotidyl transferase  43.85 
 
 
234 aa  158  8e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  45.53 
 
 
223 aa  158  8e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0493  nucleotidyl transferase  44.35 
 
 
245 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.427783  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0690  nucleotidyl transferase family protein  41.67 
 
 
239 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3512  nucleotidyl transferase  44.12 
 
 
228 aa  156  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0586  nucleotidyl transferase  43.33 
 
 
240 aa  156  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4796  nucleotidyl transferase  46.75 
 
 
223 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.814441  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0206  nucleotidyltransferase family protein  41.67 
 
 
239 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2339  nucleotidyltransferase family protein  41.67 
 
 
239 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329535  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0868  nucleotidyltransferase family protein  41.67 
 
 
239 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2739  nucleotidyltransferase family protein  41.67 
 
 
239 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2419  nucleotidyltransferase family protein  41.67 
 
 
231 aa  155  5e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2765  nucleotidyl transferase  42.74 
 
 
239 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0884  nucleotidyl transferase  43.67 
 
 
249 aa  154  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000795934  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0704  nucleotidyl transferase family protein  41.25 
 
 
239 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0387  Nucleotidyl transferase  41.08 
 
 
230 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3661  nucleotidyl transferase  43.4 
 
 
223 aa  152  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07790  putative nucleotidyl transferase  45.76 
 
 
224 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2631  nucleotidyl transferase  41.91 
 
 
239 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311513  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1752  nucleotidyl transferase  41.67 
 
 
251 aa  150  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  5.89238e-05 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5130  nucleotidyl transferase  44.4 
 
 
223 aa  149  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4622  nucleotidyl transferase  44.68 
 
 
240 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0741  putative nucleotidyl transferase  44.92 
 
 
224 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0573  nucleotidyltransferase family protein  41.74 
 
 
239 aa  147  1e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  44.35 
 
 
229 aa  147  1e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  44.35 
 
 
229 aa  147  1e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2431  nucleotidyl transferase  46.15 
 
 
223 aa  147  2e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0511  putative mannose-1-phosphate guanyltransferase-related protein  40.34 
 
 
241 aa  145  4e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.560778  normal  0.0591515 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  40.93 
 
 
232 aa  145  5e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1696  nucleotidyl transferase  41.32 
 
 
242 aa  145  5e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.114305  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1517  nucleotidyl transferase  41.08 
 
 
246 aa  145  6e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.631437  normal  0.41315 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02245  nucleotidyl transferase  41.18 
 
 
236 aa  144  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.9499  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  41.28 
 
 
222 aa  143  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0433  nucleotidyl transferase  40.65 
 
 
232 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.73488  normal  0.148714 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1716  nucleotidyl transferase  40.98 
 
 
240 aa  141  1e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0694785  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1646  nucleotidyl transferase  40.98 
 
 
240 aa  140  2e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.233302  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0556  nucleotidyltransferase family protein  43.56 
 
 
210 aa  134  2e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46780  nucleotidyl transferase  44.44 
 
 
222 aa  132  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0348  hypothetical protein  38.3 
 
 
220 aa  132  6e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0975  Nucleotidyl transferase  40.25 
 
 
236 aa  131  9e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395928  normal  0.0477553 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0373  hypothetical protein  38.3 
 
 
220 aa  130  2e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2073  mannose-1-phosphate guanyltransferase  36.32 
 
 
219 aa  120  2e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.403503  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0109  nucleotidyl transferase family protein  36.32 
 
 
219 aa  119  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00238886  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0742  transaldolase AB  37.55 
 
 
230 aa  114  2e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3436  nucleotidyl transferase  33.47 
 
 
253 aa  94  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.604999  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2101  nucleotidyltransferase family protein  30.29 
 
 
239 aa  90.9  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3579  nucleotidyl transferase  37.37 
 
 
252 aa  91.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00479956  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2018  nucleotidyltransferase family protein  30.29 
 
 
232 aa  89.4  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0819  nucleotidyl transferase  31.43 
 
 
243 aa  89  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0079  Nucleotidyl transferase  32.63 
 
 
240 aa  83.6  2e-15  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>